Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZRR7

LRRC9, Leucine-rich repeat-containing protein 9, humanhuman

Predictions only

Length 1,453 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRC9Q6ZRR7 FAM72A-205ENST00000468509 629 ntTSL 5 BASIC32.15■■■□□ 2.74
LRRC9Q6ZRR7 CTBP1-AS2-203ENST00000507044 739 ntTSL 3 BASIC32.15■■■□□ 2.74
LRRC9Q6ZRR7 IVD-206ENST00000487418 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.15■■■□□ 2.74
LRRC9Q6ZRR7 EXTL3-213ENST00000523149 1779 ntTSL 5 BASIC32.14■■■□□ 2.74
LRRC9Q6ZRR7 MRPL40-201ENST00000333130 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.14■■■□□ 2.74
LRRC9Q6ZRR7 CLDN5-204ENST00000618236 1374 ntAPPRIS P1 BASIC32.14■■■□□ 2.74
LRRC9Q6ZRR7 AC244015.2-201ENST00000616358 1861 ntBASIC32.14■■■□□ 2.74
LRRC9Q6ZRR7 FITM1-201ENST00000267426 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.14■■■□□ 2.74
LRRC9Q6ZRR7 SDHC-201ENST00000342751 1127 ntTSL 1 (best) BASIC32.14■■■□□ 2.74
LRRC9Q6ZRR7 OR2A1-AS1-201ENST00000462305 773 ntBASIC32.14■■■□□ 2.74
LRRC9Q6ZRR7 AC004889.1-204ENST00000474656 773 ntTSL 3 BASIC32.14■■■□□ 2.74
LRRC9Q6ZRR7 LINC01962-201ENST00000513771 411 ntTSL 2 BASIC32.14■■■□□ 2.74
LRRC9Q6ZRR7 RNA5SP413-201ENST00000516373 109 ntBASIC32.14■■■□□ 2.74
LRRC9Q6ZRR7 FBXL8-203ENST00000518148 1054 ntTSL 2 BASIC32.14■■■□□ 2.74
LRRC9Q6ZRR7 AP001972.3-201ENST00000530792 495 ntTSL 3 BASIC32.14■■■□□ 2.74
LRRC9Q6ZRR7 GTPBP6-201ENST00000326153 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.14■■■□□ 2.74
LRRC9Q6ZRR7 AC069431.1-201ENST00000488882 1877 ntTSL 5 BASIC32.13■■■□□ 2.73
LRRC9Q6ZRR7 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.13■■■□□ 2.73
LRRC9Q6ZRR7 CLDN23-201ENST00000519106 2169 ntAPPRIS P1 BASIC32.13■■■□□ 2.73
LRRC9Q6ZRR7 ZNRF2P2-202ENST00000442865 590 ntTSL 4 BASIC32.13■■■□□ 2.73
LRRC9Q6ZRR7 CDKN2A-205ENST00000479692 544 ntTSL 5 BASIC32.13■■■□□ 2.73
LRRC9Q6ZRR7 FAM219B-212ENST00000565772 1249 ntTSL 1 (best) BASIC32.13■■■□□ 2.73
LRRC9Q6ZRR7 AC138028.5-201ENST00000566114 558 ntTSL 5 BASIC32.13■■■□□ 2.73
LRRC9Q6ZRR7 TIMM50-213ENST00000599794 786 ntTSL 2 BASIC32.13■■■□□ 2.73
LRRC9Q6ZRR7 NPDC1-202ENST00000371601 1494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.13■■■□□ 2.73
LRRC9Q6ZRR7 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC32.13■■■□□ 2.73
LRRC9Q6ZRR7 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.13■■■□□ 2.73
LRRC9Q6ZRR7 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.12■■■□□ 2.73
LRRC9Q6ZRR7 TMEM178A-201ENST00000281961 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.12■■■□□ 2.73
LRRC9Q6ZRR7 TBCB-201ENST00000221855 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.12■■■□□ 2.73
LRRC9Q6ZRR7 IPO13-201ENST00000372339 1201 ntTSL 2 BASIC32.12■■■□□ 2.73
LRRC9Q6ZRR7 AC092143.2-201ENST00000554623 985 ntTSL 3 BASIC32.12■■■□□ 2.73
LRRC9Q6ZRR7 ADD3-AS1-204ENST00000627565 388 ntTSL 3 BASIC32.12■■■□□ 2.73
LRRC9Q6ZRR7 CLDND1-201ENST00000341181 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.12■■■□□ 2.73
LRRC9Q6ZRR7 MADCAM1-201ENST00000215637 1572 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC32.12■■■□□ 2.73
LRRC9Q6ZRR7 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC32.12■■■□□ 2.73
LRRC9Q6ZRR7 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.12■■■□□ 2.73
LRRC9Q6ZRR7 CDKN2C-203ENST00000396148 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.12■■■□□ 2.73
LRRC9Q6ZRR7 S1PR5-204ENST00000617721 1698 ntTSL 5 BASIC32.12■■■□□ 2.73
LRRC9Q6ZRR7 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC32.12■■■□□ 2.73
LRRC9Q6ZRR7 CDK6-202ENST00000424848 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.11■■■□□ 2.73
LRRC9Q6ZRR7 AC116050.2-201ENST00000612102 1779 ntBASIC32.11■■■□□ 2.73
LRRC9Q6ZRR7 CNTFR-202ENST00000378980 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.11■■■□□ 2.73
LRRC9Q6ZRR7 IL15RA-208ENST00000397251 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.11■■■□□ 2.73
LRRC9Q6ZRR7 NAA60-204ENST00000421765 1045 ntTSL 2 BASIC32.11■■■□□ 2.73
LRRC9Q6ZRR7 AL049874.3-201ENST00000557618 868 ntTSL 3 BASIC32.11■■■□□ 2.73
LRRC9Q6ZRR7 AC006435.1-201ENST00000571775 1065 ntTSL 5 BASIC32.11■■■□□ 2.73
LRRC9Q6ZRR7 IL15RA-221ENST00000620865 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.11■■■□□ 2.73
LRRC9Q6ZRR7 IL15RA-222ENST00000622442 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.11■■■□□ 2.73
LRRC9Q6ZRR7 DOK3-202ENST00000357198 1729 ntTSL 2 BASIC32.11■■■□□ 2.73
LRRC9Q6ZRR7 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC32.11■■■□□ 2.73
LRRC9Q6ZRR7 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.11■■■□□ 2.73
LRRC9Q6ZRR7 IKBIP-203ENST00000393042 1368 ntTSL 1 (best) BASIC32.11■■■□□ 2.73
LRRC9Q6ZRR7 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC32.11■■■□□ 2.73
LRRC9Q6ZRR7 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.11■■■□□ 2.73
LRRC9Q6ZRR7 GNB2-206ENST00000424361 1478 ntTSL 5 BASIC32.11■■■□□ 2.73
LRRC9Q6ZRR7 PDXDC1-205ENST00000535621 2048 ntTSL 1 (best) BASIC32.11■■■□□ 2.73
LRRC9Q6ZRR7 UNC50-201ENST00000357765 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.1■■■□□ 2.73
LRRC9Q6ZRR7 PRSS3-202ENST00000361005 966 ntTSL 1 (best) BASIC32.1■■■□□ 2.73
LRRC9Q6ZRR7 SERPINH1P1-201ENST00000419794 1249 ntBASIC32.1■■■□□ 2.73
LRRC9Q6ZRR7 TMEM9-209ENST00000485839 938 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC32.1■■■□□ 2.73
LRRC9Q6ZRR7 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC32.1■■■□□ 2.73
LRRC9Q6ZRR7 FUZ-216ENST00000533418 1524 ntTSL 5 BASIC32.1■■■□□ 2.73
LRRC9Q6ZRR7 PITX3-201ENST00000370002 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.1■■■□□ 2.73
LRRC9Q6ZRR7 SUGCT-202ENST00000401647 1369 ntTSL 1 (best) BASIC32.1■■■□□ 2.73
LRRC9Q6ZRR7 C8orf82-201ENST00000313465 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.1■■■□□ 2.73
LRRC9Q6ZRR7 NTN4-207ENST00000553059 1818 ntTSL 1 (best) BASIC32.1■■■□□ 2.73
LRRC9Q6ZRR7 GAS8-202ENST00000536122 1687 ntTSL 2 BASIC32.1■■■□□ 2.73
LRRC9Q6ZRR7 GUK1-201ENST00000312726 1084 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.1■■■□□ 2.73
LRRC9Q6ZRR7 AC034102.6-201ENST00000550947 559 ntTSL 4 BASIC32.1■■■□□ 2.73
LRRC9Q6ZRR7 AC003102.1-201ENST00000588279 569 ntTSL 4 BASIC32.1■■■□□ 2.73
LRRC9Q6ZRR7 PQLC2-203ENST00000400548 1548 ntTSL 1 (best) BASIC32.1■■■□□ 2.73
LRRC9Q6ZRR7 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.09■■■□□ 2.73
LRRC9Q6ZRR7 RNH1-222ENST00000533410 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.09■■■□□ 2.73
LRRC9Q6ZRR7 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.09■■■□□ 2.73
LRRC9Q6ZRR7 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.09■■■□□ 2.73
LRRC9Q6ZRR7 NAA20-202ENST00000334982 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.09■■■□□ 2.73
LRRC9Q6ZRR7 KRTAP5-8-201ENST00000398534 1183 ntAPPRIS P1 BASIC32.09■■■□□ 2.73
LRRC9Q6ZRR7 C2orf82-203ENST00000409533 561 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC32.09■■■□□ 2.73
LRRC9Q6ZRR7 AC097658.1-201ENST00000475555 843 ntBASIC32.09■■■□□ 2.73
LRRC9Q6ZRR7 PACSIN3-201ENST00000298838 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.09■■■□□ 2.73
LRRC9Q6ZRR7 BCKDK-201ENST00000219794 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.08■■■□□ 2.73
LRRC9Q6ZRR7 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.08■■■□□ 2.73
LRRC9Q6ZRR7 DDAH1-205ENST00000539042 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.08■■■□□ 2.73
LRRC9Q6ZRR7 ETHE1-201ENST00000292147 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.08■■■□□ 2.73
LRRC9Q6ZRR7 DGCR6L-202ENST00000405465 962 ntTSL 3 BASIC32.08■■■□□ 2.73
LRRC9Q6ZRR7 LINC01659-202ENST00000449711 917 ntTSL 3 BASIC32.08■■■□□ 2.73
LRRC9Q6ZRR7 AC008667.2-201ENST00000504413 469 ntTSL 3 BASIC32.08■■■□□ 2.73
LRRC9Q6ZRR7 AC105020.6-201ENST00000621523 1217 ntBASIC32.08■■■□□ 2.73
LRRC9Q6ZRR7 GSEC-202ENST00000629441 1572 ntTSL 2 BASIC32.08■■■□□ 2.73
LRRC9Q6ZRR7 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.08■■■□□ 2.73
LRRC9Q6ZRR7 SHISA4-201ENST00000362011 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.07■■■□□ 2.73
LRRC9Q6ZRR7 PAGR1-201ENST00000320330 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.07■■■□□ 2.72
LRRC9Q6ZRR7 MAMSTR-202ENST00000356751 1825 ntTSL 2 BASIC32.07■■■□□ 2.72
LRRC9Q6ZRR7 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC32.07■■■□□ 2.72
LRRC9Q6ZRR7 GCK-205ENST00000437084 1385 ntTSL 5 BASIC32.07■■■□□ 2.72
LRRC9Q6ZRR7 LIPT2-201ENST00000310109 1018 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.07■■■□□ 2.72
LRRC9Q6ZRR7 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC32.07■■■□□ 2.72
LRRC9Q6ZRR7 RENBP-201ENST00000369997 1322 ntTSL 5 BASIC32.07■■■□□ 2.72
LRRC9Q6ZRR7 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC32.06■■■□□ 2.72
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.6 ms