Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZRI6

C15orf39, Uncharacterized protein C15orf39, humanhuman

Predictions only

Length 1,047 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C15orf39Q6ZRI6 CNN2P6-201ENST00000439038 900 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
C15orf39Q6ZRI6 BHLHA15-202ENST00000609256 796 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
C15orf39Q6ZRI6 CD99-212ENST00000624481 1089 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
C15orf39Q6ZRI6 MCAT-201ENST00000290429 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
C15orf39Q6ZRI6 SCARB2-219ENST00000639738 1517 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
C15orf39Q6ZRI6 HAUS4-205ENST00000541587 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
C15orf39Q6ZRI6 DEDD2-201ENST00000336034 1882 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
C15orf39Q6ZRI6 PAX1-202ENST00000444366 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
C15orf39Q6ZRI6 YBX3-202ENST00000279550 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
C15orf39Q6ZRI6 LGALS9C-201ENST00000328114 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
C15orf39Q6ZRI6 AC132008.2-203ENST00000418868 1552 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
C15orf39Q6ZRI6 NAPEPLD-208ENST00000427257 1822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
C15orf39Q6ZRI6 PPP3CC-201ENST00000240139 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
C15orf39Q6ZRI6 RAPSN-205ENST00000529341 1408 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
C15orf39Q6ZRI6 PAXIP1-AS1-201ENST00000608317 2256 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
C15orf39Q6ZRI6 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
C15orf39Q6ZRI6 KRT7-201ENST00000331817 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
C15orf39Q6ZRI6 RGS20-202ENST00000297313 2104 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
C15orf39Q6ZRI6 TRAPPC5-201ENST00000317378 790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
C15orf39Q6ZRI6 ULK4P1-204ENST00000565949 721 ntTSL 4 BASIC22.59■■□□□ 1.21
C15orf39Q6ZRI6 DRAM2-201ENST00000286692 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
C15orf39Q6ZRI6 SIRT3-202ENST00000524564 1395 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
C15orf39Q6ZRI6 NAE1-203ENST00000379463 1909 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
C15orf39Q6ZRI6 TMEM204-201ENST00000253934 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
C15orf39Q6ZRI6 TCP11-203ENST00000373974 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
C15orf39Q6ZRI6 GAS2L1-207ENST00000611648 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
C15orf39Q6ZRI6 AL049796.1-201ENST00000565336 1766 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
C15orf39Q6ZRI6 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
C15orf39Q6ZRI6 PPCS-203ENST00000372561 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
C15orf39Q6ZRI6 FIP1L1-201ENST00000306932 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
C15orf39Q6ZRI6 CTGF-201ENST00000367976 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
C15orf39Q6ZRI6 OSR2-210ENST00000523368 1519 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
C15orf39Q6ZRI6 AC005229.4-201ENST00000610085 2198 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
C15orf39Q6ZRI6 MAD2L2-204ENST00000376667 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
C15orf39Q6ZRI6 MCHR1-202ENST00000381433 1219 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
C15orf39Q6ZRI6 HTATIP2-208ENST00000532505 595 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
C15orf39Q6ZRI6 SLC7A5P1-201ENST00000568957 537 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
C15orf39Q6ZRI6 AC010536.3-201ENST00000620306 533 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
C15orf39Q6ZRI6 EPHX3-201ENST00000221730 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
C15orf39Q6ZRI6 CA7-201ENST00000338437 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
C15orf39Q6ZRI6 PANO1-201ENST00000620120 1680 ntAPPRIS P1 BASIC22.58■■□□□ 1.2
C15orf39Q6ZRI6 BASP1-201ENST00000322611 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
C15orf39Q6ZRI6 PMPCA-203ENST00000399219 1987 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.2
C15orf39Q6ZRI6 MIF4GD-202ENST00000325102 1306 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
C15orf39Q6ZRI6 BAALC-205ENST00000438105 2662 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
C15orf39Q6ZRI6 MRPL39-201ENST00000307301 1199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
C15orf39Q6ZRI6 MRPL39-202ENST00000352957 1110 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
C15orf39Q6ZRI6 XXYLT1-202ENST00000356740 564 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
C15orf39Q6ZRI6 CHPF-202ENST00000373891 1079 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
C15orf39Q6ZRI6 SNHG6-203ENST00000520944 638 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
C15orf39Q6ZRI6 IL34-204ENST00000566361 1001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
C15orf39Q6ZRI6 BX322557.1-202ENST00000400362 1460 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
C15orf39Q6ZRI6 PHOSPHO1-206ENST00000514112 1587 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
C15orf39Q6ZRI6 CHN1-203ENST00000409156 1761 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
C15orf39Q6ZRI6 CLDN23-201ENST00000519106 2169 ntAPPRIS P1 BASIC22.57■■□□□ 1.2
C15orf39Q6ZRI6 IKBKG-206ENST00000594239 2299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
C15orf39Q6ZRI6 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
C15orf39Q6ZRI6 AL137060.1-201ENST00000618151 2648 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
C15orf39Q6ZRI6 TMEM178A-201ENST00000281961 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
C15orf39Q6ZRI6 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
C15orf39Q6ZRI6 BCAT2-207ENST00000597011 1579 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
C15orf39Q6ZRI6 NAT16-204ENST00000455377 1492 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
C15orf39Q6ZRI6 FAM207A-201ENST00000291634 927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
C15orf39Q6ZRI6 APTR-203ENST00000430801 583 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
C15orf39Q6ZRI6 FADS3-204ENST00000525588 1254 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
C15orf39Q6ZRI6 FBXO17-201ENST00000292852 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
C15orf39Q6ZRI6 KIF12-207ENST00000640217 2194 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
C15orf39Q6ZRI6 NFS1-204ENST00000397425 1956 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
C15orf39Q6ZRI6 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
C15orf39Q6ZRI6 POLR2F-205ENST00000442738 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
C15orf39Q6ZRI6 MSL1-204ENST00000578648 2267 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
C15orf39Q6ZRI6 SH3GL1-206ENST00000598564 2194 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
C15orf39Q6ZRI6 SEC23A-213ENST00000557280 561 ntTSL 4 BASIC22.55■■□□□ 1.2
C15orf39Q6ZRI6 AC105036.2-201ENST00000569468 176 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
C15orf39Q6ZRI6 AP005205.2-201ENST00000577327 491 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
C15orf39Q6ZRI6 F2RL3-202ENST00000599210 613 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
C15orf39Q6ZRI6 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
C15orf39Q6ZRI6 ARSA-202ENST00000356098 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
C15orf39Q6ZRI6 SLC25A22-216ENST00000531214 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
C15orf39Q6ZRI6 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
C15orf39Q6ZRI6 EML2-201ENST00000245925 2264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
C15orf39Q6ZRI6 CCDC130-201ENST00000221554 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
C15orf39Q6ZRI6 MAP1LC3A-202ENST00000374837 961 ntTSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
C15orf39Q6ZRI6 CCDC74B-203ENST00000409128 789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
C15orf39Q6ZRI6 AP000282.1-201ENST00000454622 682 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
C15orf39Q6ZRI6 FAM201B-201ENST00000458407 597 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
C15orf39Q6ZRI6 UMAD1-202ENST00000463725 559 ntTSL 4 BASIC22.54■■□□□ 1.2
C15orf39Q6ZRI6 AC099522.1-201ENST00000505955 881 ntTSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
C15orf39Q6ZRI6 DDN-AS1-201ENST00000547395 858 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
C15orf39Q6ZRI6 MIR4651-201ENST00000582622 73 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
C15orf39Q6ZRI6 SEPT5-209ENST00000438754 2241 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
C15orf39Q6ZRI6 POMGNT2-201ENST00000344697 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
C15orf39Q6ZRI6 AVPI1-201ENST00000370626 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
C15orf39Q6ZRI6 SLC13A3-204ENST00000413164 2008 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
C15orf39Q6ZRI6 TNFAIP8L3-202ENST00000637513 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
C15orf39Q6ZRI6 TEAD2-201ENST00000311227 2164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
C15orf39Q6ZRI6 PABPC1L2B-201ENST00000373521 2197 ntAPPRIS P1 BASIC22.53■■□□□ 1.2
C15orf39Q6ZRI6 NAAA-201ENST00000286733 1900 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
C15orf39Q6ZRI6 TRIM15-210ENST00000619857 2217 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
C15orf39Q6ZRI6 NUDT8-202ENST00000376693 728 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.6 ms