Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZMY3

SPOCD1, SPOC domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,216 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPOCD1Q6ZMY3 FAM71E1-204ENST00000600100 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
SPOCD1Q6ZMY3 AC008175.2-201ENST00000612840 297 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
SPOCD1Q6ZMY3 TTC7A-201ENST00000319190 5157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
SPOCD1Q6ZMY3 GPR108-201ENST00000264080 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
SPOCD1Q6ZMY3 MAG-201ENST00000361922 2426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
SPOCD1Q6ZMY3 SNUPN-205ENST00000564644 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
SPOCD1Q6ZMY3 ANKLE1-204ENST00000594072 2294 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
SPOCD1Q6ZMY3 FMR1-201ENST00000218200 4333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
SPOCD1Q6ZMY3 ZFP69B-202ENST00000411995 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
SPOCD1Q6ZMY3 IL17RC-205ENST00000413608 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
SPOCD1Q6ZMY3 LYSMD2-201ENST00000267838 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
SPOCD1Q6ZMY3 TEAD2-210ENST00000601519 2167 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
SPOCD1Q6ZMY3 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
SPOCD1Q6ZMY3 FNDC3B-204ENST00000421757 946 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
SPOCD1Q6ZMY3 AC093833.1-201ENST00000442821 553 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
SPOCD1Q6ZMY3 AC106738.1-201ENST00000560487 359 ntTSL 3 BASIC21.56■■□□□ 1.04
SPOCD1Q6ZMY3 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC21.56■■□□□ 1.04
SPOCD1Q6ZMY3 AC092667.1-201ENST00000434301 2586 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
SPOCD1Q6ZMY3 C17orf67-201ENST00000397861 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
SPOCD1Q6ZMY3 SMIM3-201ENST00000526627 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
SPOCD1Q6ZMY3 TMEM11-201ENST00000317635 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
SPOCD1Q6ZMY3 TDRP-202ENST00000427263 2465 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
SPOCD1Q6ZMY3 NUP160-203ENST00000526870 1537 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
SPOCD1Q6ZMY3 TMEM62-201ENST00000260403 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
SPOCD1Q6ZMY3 WAS-201ENST00000376701 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
SPOCD1Q6ZMY3 AC073314.1-201ENST00000568729 2216 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
SPOCD1Q6ZMY3 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
SPOCD1Q6ZMY3 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
SPOCD1Q6ZMY3 AC138907.5-202ENST00000569484 235 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
SPOCD1Q6ZMY3 LINC02228-203ENST00000641970 1355 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
SPOCD1Q6ZMY3 TUSC3-203ENST00000503731 1498 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
SPOCD1Q6ZMY3 NRN1-203ENST00000616243 1556 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.55■■□□□ 1.04
SPOCD1Q6ZMY3 AP005212.1-201ENST00000581547 1997 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
SPOCD1Q6ZMY3 FAM72B-202ENST00000369390 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
SPOCD1Q6ZMY3 AC109460.3-201ENST00000569969 5296 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
SPOCD1Q6ZMY3 CTU2-210ENST00000567949 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
SPOCD1Q6ZMY3 HMOX1-201ENST00000216117 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
SPOCD1Q6ZMY3 FBXW7-202ENST00000281708 4976 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
SPOCD1Q6ZMY3 GALK1-201ENST00000225614 1445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
SPOCD1Q6ZMY3 IGDCC4-201ENST00000352385 6508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
SPOCD1Q6ZMY3 PRMT2-210ENST00000458387 1874 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
SPOCD1Q6ZMY3 NDOR1-201ENST00000344894 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
SPOCD1Q6ZMY3 SPOCK3-217ENST00000511269 1768 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
SPOCD1Q6ZMY3 PHOSPHO1-206ENST00000514112 1587 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
SPOCD1Q6ZMY3 KRT3-201ENST00000417996 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
SPOCD1Q6ZMY3 DTYMK-201ENST00000305784 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
SPOCD1Q6ZMY3 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
SPOCD1Q6ZMY3 MAD2L2-204ENST00000376667 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
SPOCD1Q6ZMY3 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
SPOCD1Q6ZMY3 AC073343.2-201ENST00000413182 548 ntTSL 4 BASIC21.54■■□□□ 1.04
SPOCD1Q6ZMY3 AC011511.3-201ENST00000587088 355 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
SPOCD1Q6ZMY3 AC007225.1-201ENST00000566331 1836 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
SPOCD1Q6ZMY3 DUSP15-201ENST00000278979 1732 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
SPOCD1Q6ZMY3 DALRD3-202ENST00000341949 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
SPOCD1Q6ZMY3 CDIPT-202ENST00000561555 1726 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
SPOCD1Q6ZMY3 NUDT11-201ENST00000375992 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
SPOCD1Q6ZMY3 CHRNB2-205ENST00000637900 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
SPOCD1Q6ZMY3 PTPRJ-208ENST00000615445 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
SPOCD1Q6ZMY3 MGAT5B-209ENST00000569840 4492 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
SPOCD1Q6ZMY3 GABARAPL3-202ENST00000624044 1851 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
SPOCD1Q6ZMY3 TNIP2-203ENST00000503235 1653 ntTSL 3 BASIC21.53■■□□□ 1.04
SPOCD1Q6ZMY3 SP3-208ENST00000640958 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
SPOCD1Q6ZMY3 AC132008.2-203ENST00000418868 1552 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
SPOCD1Q6ZMY3 TUBGCP3-204ENST00000464139 2461 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
SPOCD1Q6ZMY3 PARD3-207ENST00000374788 5996 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
SPOCD1Q6ZMY3 SAP30L-201ENST00000297109 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
SPOCD1Q6ZMY3 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC21.53■■□□□ 1.04
SPOCD1Q6ZMY3 NDUFS3-201ENST00000263774 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
SPOCD1Q6ZMY3 SMCO4-201ENST00000298966 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
SPOCD1Q6ZMY3 FAXDC2-211ENST00000520968 558 ntTSL 4 BASIC21.53■■□□□ 1.04
SPOCD1Q6ZMY3 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
SPOCD1Q6ZMY3 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
SPOCD1Q6ZMY3 FAM129C-203ENST00000449408 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
SPOCD1Q6ZMY3 NSUN5-204ENST00000438747 1663 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
SPOCD1Q6ZMY3 ADGRA3-204ENST00000502482 2870 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
SPOCD1Q6ZMY3 UBR2-203ENST00000372903 2423 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
SPOCD1Q6ZMY3 NEK3-208ENST00000618534 2414 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
SPOCD1Q6ZMY3 C19orf35-201ENST00000342063 2574 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
SPOCD1Q6ZMY3 GNB2-206ENST00000424361 1478 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
SPOCD1Q6ZMY3 AC011484.1-201ENST00000377652 1995 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
SPOCD1Q6ZMY3 CERKL-204ENST00000374970 1392 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
SPOCD1Q6ZMY3 SLC25A24-204ENST00000569674 2357 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
SPOCD1Q6ZMY3 NTNG2-202ENST00000393229 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
SPOCD1Q6ZMY3 FAM3C-201ENST00000359943 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
SPOCD1Q6ZMY3 KANK3-203ENST00000593649 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
SPOCD1Q6ZMY3 CYB5R4-201ENST00000369679 768 ntTSL 3 BASIC21.52■■□□□ 1.04
SPOCD1Q6ZMY3 EIF6-203ENST00000374450 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
SPOCD1Q6ZMY3 ZSWIM7-205ENST00000472495 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
SPOCD1Q6ZMY3 PNMA2-204ENST00000522362 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
SPOCD1Q6ZMY3 ERMP1-202ENST00000339450 5376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
SPOCD1Q6ZMY3 KLHDC4-204ENST00000353170 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
SPOCD1Q6ZMY3 TSPAN4-206ENST00000397408 1430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
SPOCD1Q6ZMY3 RBM34-201ENST00000408888 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
SPOCD1Q6ZMY3 SDHAF3-202ENST00000432641 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
SPOCD1Q6ZMY3 TPD52L1-203ENST00000368402 1308 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
SPOCD1Q6ZMY3 JDP2-201ENST00000267569 1700 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
SPOCD1Q6ZMY3 NTRK3-206ENST00000540489 2145 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.03
SPOCD1Q6ZMY3 PKMYT1-213ENST00000574385 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.03
SPOCD1Q6ZMY3 TMEM98-206ENST00000579849 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
SPOCD1Q6ZMY3 C10orf95-201ENST00000625129 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.7 ms