Protein–RNA interactions for Protein: Q6XLA1

CASC2, Protein CASC2, isoform 3, humanhuman

Predictions only

Length 102 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CASC2Q6XLA1 RUVBL2-206ENST00000595090 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.47
CASC2Q6XLA1 AFG3L1P-217ENST00000557444 2447 ntBASIC12.15□□□□□ -0.47
CASC2Q6XLA1 ISLR2-204ENST00000453268 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.47
CASC2Q6XLA1 GNAQ-201ENST00000286548 6539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
CASC2Q6XLA1 HMOX2-208ENST00000570646 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
CASC2Q6XLA1 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
CASC2Q6XLA1 PLCD1-201ENST00000334661 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
CASC2Q6XLA1 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC12.14□□□□□ -0.47
CASC2Q6XLA1 TRABD2A-201ENST00000335459 1844 ntTSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
CASC2Q6XLA1 CD6-203ENST00000352009 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
CASC2Q6XLA1 EBF1-202ENST00000380654 2345 ntTSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
CASC2Q6XLA1 ALDH5A1-204ENST00000491546 1699 ntTSL 5 BASIC12.14□□□□□ -0.47
CASC2Q6XLA1 NLE1-203ENST00000586869 5286 ntTSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
CASC2Q6XLA1 REM2-201ENST00000267396 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
CASC2Q6XLA1 INPP1-202ENST00000392329 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.14□□□□□ -0.47
CASC2Q6XLA1 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.14□□□□□ -0.47
CASC2Q6XLA1 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC12.14□□□□□ -0.47
CASC2Q6XLA1 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
CASC2Q6XLA1 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC12.14□□□□□ -0.47
CASC2Q6XLA1 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC12.14□□□□□ -0.47
CASC2Q6XLA1 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC12.14□□□□□ -0.47
CASC2Q6XLA1 NARS2-201ENST00000281038 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
CASC2Q6XLA1 IL17RE-206ENST00000454190 2757 ntTSL 2 BASIC12.14□□□□□ -0.47
CASC2Q6XLA1 JRK-210ENST00000614134 8932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
CASC2Q6XLA1 FAM91A1-207ENST00000521166 2706 ntTSL 2 BASIC12.14□□□□□ -0.47
CASC2Q6XLA1 FOXP4-205ENST00000409208 3341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.14□□□□□ -0.47
CASC2Q6XLA1 GDF11-201ENST00000257868 8657 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
CASC2Q6XLA1 GABBR1-204ENST00000377016 4299 ntTSL 5 BASIC12.14□□□□□ -0.47
CASC2Q6XLA1 TDRD6-201ENST00000316081 6817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
CASC2Q6XLA1 PDK3-201ENST00000379162 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
CASC2Q6XLA1 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC12.13□□□□□ -0.47
CASC2Q6XLA1 MFSD6L-201ENST00000329805 2188 ntAPPRIS P1 BASIC12.13□□□□□ -0.47
CASC2Q6XLA1 TNFSF11-203ENST00000398795 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
CASC2Q6XLA1 RASSF1-203ENST00000359365 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
CASC2Q6XLA1 ELFN2-201ENST00000402918 8361 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC12.13□□□□□ -0.47
CASC2Q6XLA1 E4F1-206ENST00000565090 2028 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
CASC2Q6XLA1 AC008105.1-201ENST00000587534 2003 ntTSL 2 BASIC12.13□□□□□ -0.47
CASC2Q6XLA1 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.13□□□□□ -0.47
CASC2Q6XLA1 METRN-204ENST00000568223 3325 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
CASC2Q6XLA1 HCFC1-201ENST00000310441 8869 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
CASC2Q6XLA1 GATA6-AS1-202ENST00000583490 1788 ntTSL 2 BASIC12.13□□□□□ -0.47
CASC2Q6XLA1 C19orf66-201ENST00000253110 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.13□□□□□ -0.47
CASC2Q6XLA1 CCDC151-201ENST00000356392 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
CASC2Q6XLA1 TUBA4A-202ENST00000392088 2499 ntTSL 2 BASIC12.13□□□□□ -0.47
CASC2Q6XLA1 AL355987.4-201ENST00000415992 4244 ntTSL 2 BASIC12.13□□□□□ -0.47
CASC2Q6XLA1 LINC02175-201ENST00000571219 1875 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
CASC2Q6XLA1 SENP6-205ENST00000447266 6501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
CASC2Q6XLA1 ZNF707-202ENST00000418203 2661 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
CASC2Q6XLA1 RNF38-205ENST00000377877 1974 ntTSL 2 BASIC12.13□□□□□ -0.47
CASC2Q6XLA1 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
CASC2Q6XLA1 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC12.13□□□□□ -0.47
CASC2Q6XLA1 ELMSAN1-201ENST00000286523 8091 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
CASC2Q6XLA1 PPP3CC-203ENST00000397775 2094 ntTSL 2 BASIC12.13□□□□□ -0.47
CASC2Q6XLA1 RGMB-207ENST00000513185 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.13□□□□□ -0.47
CASC2Q6XLA1 ZNF800-208ENST00000619291 2099 ntTSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
CASC2Q6XLA1 MFF-203ENST00000349901 1716 ntTSL 2 BASIC12.13□□□□□ -0.47
CASC2Q6XLA1 PHKA1-205ENST00000541944 5944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
CASC2Q6XLA1 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
CASC2Q6XLA1 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC12.13□□□□□ -0.47
CASC2Q6XLA1 TFAP2B-202ENST00000393655 5773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
CASC2Q6XLA1 GLCCI1-201ENST00000223145 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
CASC2Q6XLA1 ZNF804A-201ENST00000302277 4690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
CASC2Q6XLA1 ME2-216ENST00000639850 2331 ntTSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
CASC2Q6XLA1 MTMR1-208ENST00000445323 4516 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
CASC2Q6XLA1 B4GALNT1-202ENST00000418555 1861 ntTSL 2 BASIC12.12□□□□□ -0.47
CASC2Q6XLA1 FDFT1-210ENST00000525954 1890 ntTSL 2 BASIC12.12□□□□□ -0.47
CASC2Q6XLA1 LMLN-204ENST00000420910 2423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
CASC2Q6XLA1 MIR210HG-201ENST00000500447 1965 ntTSL 2 BASIC12.12□□□□□ -0.47
CASC2Q6XLA1 AL359710.1-201ENST00000427039 1544 ntTSL 2 BASIC12.12□□□□□ -0.47
CASC2Q6XLA1 CNTNAP3B-212ENST00000617422 2170 ntTSL 2 BASIC12.12□□□□□ -0.47
CASC2Q6XLA1 SET-201ENST00000322030 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
CASC2Q6XLA1 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
CASC2Q6XLA1 RABEP1-202ENST00000537505 5365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
CASC2Q6XLA1 C10orf91-202ENST00000392630 1846 ntTSL 2 BASIC12.12□□□□□ -0.47
CASC2Q6XLA1 DMRTB1-201ENST00000371445 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
CASC2Q6XLA1 IRF7-204ENST00000397570 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
CASC2Q6XLA1 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
CASC2Q6XLA1 TPST1-201ENST00000304842 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
CASC2Q6XLA1 LGALS9B-201ENST00000324290 1243 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
CASC2Q6XLA1 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
CASC2Q6XLA1 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
CASC2Q6XLA1 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
CASC2Q6XLA1 CNEP1R1-203ENST00000458059 2965 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
CASC2Q6XLA1 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
CASC2Q6XLA1 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
CASC2Q6XLA1 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
CASC2Q6XLA1 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
CASC2Q6XLA1 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
CASC2Q6XLA1 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
CASC2Q6XLA1 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
CASC2Q6XLA1 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
CASC2Q6XLA1 ADGRG2-209ENST00000379876 4779 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
CASC2Q6XLA1 TMEM189-201ENST00000371650 2222 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
CASC2Q6XLA1 ZNF276-208ENST00000568064 2203 ntTSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
CASC2Q6XLA1 PLXND1-201ENST00000324093 7094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
CASC2Q6XLA1 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
CASC2Q6XLA1 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
CASC2Q6XLA1 TTBK1-201ENST00000259750 6932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
CASC2Q6XLA1 ALX3-201ENST00000369792 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
CASC2Q6XLA1 PRR36-202ENST00000618550 4456 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.1 ms