Protein–RNA interactions for Protein: Q6VB84

FOXD4L3, Forkhead box protein D4-like 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 417 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXD4L3Q6VB84 NDUFB2-212ENST00000476279 1666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
FOXD4L3Q6VB84 FAM151B-201ENST00000282226 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
FOXD4L3Q6VB84 PGAM5-204ENST00000543955 1773 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
FOXD4L3Q6VB84 HMOX1-201ENST00000216117 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
FOXD4L3Q6VB84 RCN3-201ENST00000270645 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
FOXD4L3Q6VB84 PCMT1-205ENST00000464889 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
FOXD4L3Q6VB84 SPNS1-203ENST00000334536 2027 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
FOXD4L3Q6VB84 AP005212.1-201ENST00000581547 1997 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
FOXD4L3Q6VB84 MYO1D-213ENST00000583621 1916 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
FOXD4L3Q6VB84 SLC35A3-205ENST00000465289 5696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
FOXD4L3Q6VB84 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC24.22■■□□□ 1.47
FOXD4L3Q6VB84 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
FOXD4L3Q6VB84 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
FOXD4L3Q6VB84 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
FOXD4L3Q6VB84 CYP1B1-207ENST00000614273 2174 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
FOXD4L3Q6VB84 GRINA-201ENST00000313269 1968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
FOXD4L3Q6VB84 RGMA-210ENST00000557301 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
FOXD4L3Q6VB84 RHNO1-204ENST00000489288 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
FOXD4L3Q6VB84 LAYN-202ENST00000375615 1836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
FOXD4L3Q6VB84 UBE2I-205ENST00000402301 1708 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
FOXD4L3Q6VB84 ARSA-205ENST00000453344 1650 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
FOXD4L3Q6VB84 RUSC1-AS1-203ENST00000450199 1636 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
FOXD4L3Q6VB84 GATA5-201ENST00000252997 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
FOXD4L3Q6VB84 CHRNA10-204ENST00000534359 1474 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
FOXD4L3Q6VB84 PML-217ENST00000567543 1404 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
FOXD4L3Q6VB84 ZIM2-208ENST00000629319 2253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
FOXD4L3Q6VB84 HOOK1-201ENST00000371208 5857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
FOXD4L3Q6VB84 SNX8-201ENST00000222990 4727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
FOXD4L3Q6VB84 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
FOXD4L3Q6VB84 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
FOXD4L3Q6VB84 C16orf86-201ENST00000403458 1267 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
FOXD4L3Q6VB84 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
FOXD4L3Q6VB84 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC24.21■■□□□ 1.47
FOXD4L3Q6VB84 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC24.21■■□□□ 1.47
FOXD4L3Q6VB84 ERF-202ENST00000440177 2032 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
FOXD4L3Q6VB84 FDXR-201ENST00000293195 1875 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
FOXD4L3Q6VB84 MOK-226ENST00000522874 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
FOXD4L3Q6VB84 RNH1-222ENST00000533410 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
FOXD4L3Q6VB84 SNX3-201ENST00000230085 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
FOXD4L3Q6VB84 RAX-202ENST00000334889 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
FOXD4L3Q6VB84 AC016065.1-201ENST00000500118 2413 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
FOXD4L3Q6VB84 NEUROG1-201ENST00000314744 1668 ntAPPRIS P1 BASIC24.21■■□□□ 1.47
FOXD4L3Q6VB84 PANO1-201ENST00000620120 1680 ntAPPRIS P1 BASIC24.21■■□□□ 1.47
FOXD4L3Q6VB84 AC090360.1-201ENST00000569722 2218 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.47
FOXD4L3Q6VB84 VPS53-201ENST00000291074 2656 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
FOXD4L3Q6VB84 ZDHHC7-203ENST00000564466 1488 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.47
FOXD4L3Q6VB84 HPS6-201ENST00000299238 2649 ntAPPRIS P1 BASIC24.2■■□□□ 1.47
FOXD4L3Q6VB84 MLST8-202ENST00000382450 1861 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
FOXD4L3Q6VB84 MLST8-215ENST00000564088 1861 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
FOXD4L3Q6VB84 MPZL1-201ENST00000359523 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
FOXD4L3Q6VB84 SRCIN1-213ENST00000617146 7058 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
FOXD4L3Q6VB84 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
FOXD4L3Q6VB84 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
FOXD4L3Q6VB84 LAYN-204ENST00000525126 1763 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
FOXD4L3Q6VB84 DBNL-220ENST00000494774 2117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
FOXD4L3Q6VB84 CCDC88B-202ENST00000356786 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
FOXD4L3Q6VB84 GMPPA-205ENST00000373917 1630 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
FOXD4L3Q6VB84 SLC25A22-228ENST00000628067 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
FOXD4L3Q6VB84 GPAA1-202ENST00000361036 1840 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
FOXD4L3Q6VB84 EZH2-201ENST00000320356 2639 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
FOXD4L3Q6VB84 EGLN2-202ENST00000406058 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
FOXD4L3Q6VB84 GSG1L-202ENST00000395724 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
FOXD4L3Q6VB84 AC121338.2-201ENST00000622535 1744 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
FOXD4L3Q6VB84 TCP11-203ENST00000373974 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
FOXD4L3Q6VB84 LRRC3B-201ENST00000396641 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
FOXD4L3Q6VB84 IFNGR2-203ENST00000405436 1684 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
FOXD4L3Q6VB84 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
FOXD4L3Q6VB84 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
FOXD4L3Q6VB84 AC027702.1-201ENST00000563810 1770 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
FOXD4L3Q6VB84 PLEKHB1-204ENST00000398494 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
FOXD4L3Q6VB84 UBE2K-201ENST00000261427 5245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
FOXD4L3Q6VB84 SMG1P5-201ENST00000411546 2362 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
FOXD4L3Q6VB84 CHRNA3-202ENST00000348639 2030 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
FOXD4L3Q6VB84 DISC1-202ENST00000317586 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
FOXD4L3Q6VB84 MEIS3-212ENST00000561293 1918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
FOXD4L3Q6VB84 ASCL2-201ENST00000331289 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
FOXD4L3Q6VB84 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC24.18■■□□□ 1.46
FOXD4L3Q6VB84 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
FOXD4L3Q6VB84 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC24.18■■□□□ 1.46
FOXD4L3Q6VB84 TUSC3-209ENST00000509380 1266 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
FOXD4L3Q6VB84 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
FOXD4L3Q6VB84 AL390816.2-201ENST00000554252 737 ntTSL 3 BASIC24.18■■□□□ 1.46
FOXD4L3Q6VB84 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
FOXD4L3Q6VB84 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
FOXD4L3Q6VB84 ADRM1-204ENST00000491935 1530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
FOXD4L3Q6VB84 PLCL1-201ENST00000428675 5125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
FOXD4L3Q6VB84 FBXW8-201ENST00000309909 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
FOXD4L3Q6VB84 DTX3-201ENST00000337737 2029 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
FOXD4L3Q6VB84 CERS1-202ENST00000542296 1947 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
FOXD4L3Q6VB84 VSX1-202ENST00000376709 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
FOXD4L3Q6VB84 FAM129C-212ENST00000601861 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
FOXD4L3Q6VB84 MAPT-210ENST00000535772 5718 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
FOXD4L3Q6VB84 SMPD5-201ENST00000528912 1390 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
FOXD4L3Q6VB84 RASEF-202ENST00000376447 5576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
FOXD4L3Q6VB84 DYRK2-202ENST00000344096 8912 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
FOXD4L3Q6VB84 SLC44A3-203ENST00000446120 2094 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
FOXD4L3Q6VB84 ZNF510-203ENST00000375231 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
FOXD4L3Q6VB84 SNX32-201ENST00000308342 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
FOXD4L3Q6VB84 TPCN2-205ENST00000542467 2000 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
FOXD4L3Q6VB84 ME2-218ENST00000640965 2476 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.8 ms