Protein–RNA interactions for Protein: Q6UWJ1

TMCO3, Transmembrane and coiled-coil domain-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 677 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMCO3Q6UWJ1 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
TMCO3Q6UWJ1 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
TMCO3Q6UWJ1 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
TMCO3Q6UWJ1 SCUBE1-201ENST00000290460 2258 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
TMCO3Q6UWJ1 NHLRC1-201ENST00000340650 2248 ntAPPRIS P1 BASIC22.43■■□□□ 1.18
TMCO3Q6UWJ1 BYSL-201ENST00000230340 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
TMCO3Q6UWJ1 IRF7-204ENST00000397570 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
TMCO3Q6UWJ1 PPP1R3F-203ENST00000466508 1885 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
TMCO3Q6UWJ1 NAPEPLD-208ENST00000427257 1822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
TMCO3Q6UWJ1 CD2AP-201ENST00000359314 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
TMCO3Q6UWJ1 NEUROG1-201ENST00000314744 1668 ntAPPRIS P1 BASIC22.42■■□□□ 1.18
TMCO3Q6UWJ1 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
TMCO3Q6UWJ1 TTBK1-202ENST00000304139 2449 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
TMCO3Q6UWJ1 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
TMCO3Q6UWJ1 MFSD6L-201ENST00000329805 2188 ntAPPRIS P1 BASIC22.42■■□□□ 1.18
TMCO3Q6UWJ1 PCBP4-212ENST00000484633 2009 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
TMCO3Q6UWJ1 E4F1-206ENST00000565090 2028 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
TMCO3Q6UWJ1 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
TMCO3Q6UWJ1 WDSUB1-202ENST00000359774 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
TMCO3Q6UWJ1 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
TMCO3Q6UWJ1 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
TMCO3Q6UWJ1 ME2-218ENST00000640965 2476 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
TMCO3Q6UWJ1 RHOBTB2-201ENST00000251822 5451 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
TMCO3Q6UWJ1 PHOSPHO1-201ENST00000310544 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
TMCO3Q6UWJ1 CNEP1R1-203ENST00000458059 2965 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
TMCO3Q6UWJ1 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
TMCO3Q6UWJ1 RIMBP3-201ENST00000619918 6105 ntAPPRIS P1 BASIC22.42■■□□□ 1.18
TMCO3Q6UWJ1 PLCD1-201ENST00000334661 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
TMCO3Q6UWJ1 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
TMCO3Q6UWJ1 SDHAF3-202ENST00000432641 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
TMCO3Q6UWJ1 SPTBN4-207ENST00000595535 6105 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
TMCO3Q6UWJ1 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
TMCO3Q6UWJ1 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
TMCO3Q6UWJ1 FOXL2-201ENST00000330315 2917 ntAPPRIS P1 BASIC22.41■■□□□ 1.18
TMCO3Q6UWJ1 REM2-201ENST00000267396 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
TMCO3Q6UWJ1 PLCB2-204ENST00000557821 4517 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
TMCO3Q6UWJ1 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
TMCO3Q6UWJ1 GPC5-201ENST00000377067 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
TMCO3Q6UWJ1 CHST8-203ENST00000438847 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
TMCO3Q6UWJ1 AC010141.3-201ENST00000456659 717 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
TMCO3Q6UWJ1 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
TMCO3Q6UWJ1 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
TMCO3Q6UWJ1 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
TMCO3Q6UWJ1 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
TMCO3Q6UWJ1 RGMB-207ENST00000513185 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
TMCO3Q6UWJ1 FLT1-207ENST00000615840 6453 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
TMCO3Q6UWJ1 KLHL11-201ENST00000319121 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
TMCO3Q6UWJ1 LHFPL3-202ENST00000424859 1852 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
TMCO3Q6UWJ1 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
TMCO3Q6UWJ1 FAM206A-201ENST00000322940 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
TMCO3Q6UWJ1 EIF4E3-201ENST00000295612 2764 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
TMCO3Q6UWJ1 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
TMCO3Q6UWJ1 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
TMCO3Q6UWJ1 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC22.4■■□□□ 1.18
TMCO3Q6UWJ1 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
TMCO3Q6UWJ1 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
TMCO3Q6UWJ1 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC22.4■■□□□ 1.18
TMCO3Q6UWJ1 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
TMCO3Q6UWJ1 MVB12A-201ENST00000317040 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
TMCO3Q6UWJ1 ZNF276-208ENST00000568064 2203 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
TMCO3Q6UWJ1 MARK1-205ENST00000611084 5321 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
TMCO3Q6UWJ1 NGLY1-202ENST00000280700 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
TMCO3Q6UWJ1 AL359710.1-201ENST00000427039 1544 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
TMCO3Q6UWJ1 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
TMCO3Q6UWJ1 LMAN2-201ENST00000303127 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
TMCO3Q6UWJ1 CD6-203ENST00000352009 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
TMCO3Q6UWJ1 ASB16-201ENST00000293414 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
TMCO3Q6UWJ1 TPST1-201ENST00000304842 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
TMCO3Q6UWJ1 C3orf70-201ENST00000335012 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
TMCO3Q6UWJ1 PCED1A-202ENST00000360652 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
TMCO3Q6UWJ1 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
TMCO3Q6UWJ1 AP005212.1-201ENST00000581547 1997 ntBASIC22.39■■□□□ 1.18
TMCO3Q6UWJ1 EVC-201ENST00000264956 6431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
TMCO3Q6UWJ1 BRICD5-201ENST00000328540 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
TMCO3Q6UWJ1 LAMP5-AS1-201ENST00000443469 1928 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.18
TMCO3Q6UWJ1 MBD1-216ENST00000587605 1945 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.18
TMCO3Q6UWJ1 PPP3CC-203ENST00000397775 2094 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
TMCO3Q6UWJ1 KMT5C-201ENST00000255613 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
TMCO3Q6UWJ1 LRCH4-201ENST00000310300 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
TMCO3Q6UWJ1 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
TMCO3Q6UWJ1 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC22.39■■□□□ 1.17
TMCO3Q6UWJ1 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
TMCO3Q6UWJ1 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
TMCO3Q6UWJ1 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
TMCO3Q6UWJ1 TMEM189-201ENST00000371650 2222 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
TMCO3Q6UWJ1 TMEM198-202ENST00000373883 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
TMCO3Q6UWJ1 ZDHHC18-202ENST00000374142 5020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
TMCO3Q6UWJ1 PAX1-201ENST00000398485 2838 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
TMCO3Q6UWJ1 ALX3-201ENST00000369792 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
TMCO3Q6UWJ1 SENP5-204ENST00000445299 2491 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
TMCO3Q6UWJ1 SCARF2-202ENST00000622235 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
TMCO3Q6UWJ1 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
TMCO3Q6UWJ1 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
TMCO3Q6UWJ1 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
TMCO3Q6UWJ1 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
TMCO3Q6UWJ1 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
TMCO3Q6UWJ1 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
TMCO3Q6UWJ1 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
TMCO3Q6UWJ1 CDO1-201ENST00000250535 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
TMCO3Q6UWJ1 STMN3-201ENST00000370053 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.4 ms