Protein–RNA interactions for Protein: Q6R2W3

ZBED9, SCAN domain-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,325 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZBED9Q6R2W3 RAB5A-201ENST00000273047 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
ZBED9Q6R2W3 AL391422.3-201ENST00000603791 2761 ntBASIC27.49■■□□□ 1.99
ZBED9Q6R2W3 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
ZBED9Q6R2W3 SPG7-202ENST00000341316 2288 ntTSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
ZBED9Q6R2W3 TRIM4-202ENST00000354241 1942 ntTSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
ZBED9Q6R2W3 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC27.48■■□□□ 1.99
ZBED9Q6R2W3 RARRES2-202ENST00000466675 1618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.48■■□□□ 1.99
ZBED9Q6R2W3 PTGDR-202ENST00000553372 1216 ntTSL 3 BASIC27.48■■□□□ 1.99
ZBED9Q6R2W3 ZNF276-208ENST00000568064 2203 ntTSL 5 BASIC27.48■■□□□ 1.99
ZBED9Q6R2W3 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
ZBED9Q6R2W3 FP700111.2-201ENST00000619190 1892 ntBASIC27.48■■□□□ 1.99
ZBED9Q6R2W3 NEU4-202ENST00000391969 2526 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.48■■□□□ 1.99
ZBED9Q6R2W3 ARMC9-201ENST00000349938 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
ZBED9Q6R2W3 DTX2-212ENST00000446820 1770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
ZBED9Q6R2W3 SLC38A7-205ENST00000564010 1437 ntTSL 2 BASIC27.47■■□□□ 1.99
ZBED9Q6R2W3 SHB-201ENST00000377707 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
ZBED9Q6R2W3 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC27.47■■□□□ 1.99
ZBED9Q6R2W3 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC27.47■■□□□ 1.99
ZBED9Q6R2W3 AC127029.2-201ENST00000577329 502 ntTSL 3 BASIC27.47■■□□□ 1.99
ZBED9Q6R2W3 EBF1-202ENST00000380654 2345 ntTSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
ZBED9Q6R2W3 DBNL-220ENST00000494774 2117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
ZBED9Q6R2W3 AGAP4-207ENST00000616763 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
ZBED9Q6R2W3 PTGER3-212ENST00000628037 1815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
ZBED9Q6R2W3 RASL12-202ENST00000421977 1523 ntTSL 2 BASIC27.47■■□□□ 1.99
ZBED9Q6R2W3 PQLC2-201ENST00000375153 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.47■■□□□ 1.99
ZBED9Q6R2W3 TPST2-202ENST00000398110 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.46■■□□□ 1.99
ZBED9Q6R2W3 FAM43B-201ENST00000332947 2572 ntAPPRIS P1 BASIC27.46■■□□□ 1.99
ZBED9Q6R2W3 SCO2-201ENST00000252785 992 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.46■■□□□ 1.99
ZBED9Q6R2W3 AC007114.1-201ENST00000576871 713 ntTSL 2 BASIC27.46■■□□□ 1.99
ZBED9Q6R2W3 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC27.46■■□□□ 1.99
ZBED9Q6R2W3 HSF4-215ENST00000521374 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
ZBED9Q6R2W3 PACSIN3-211ENST00000539589 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.46■■□□□ 1.99
ZBED9Q6R2W3 NXN-201ENST00000336868 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
ZBED9Q6R2W3 MARCH9-201ENST00000266643 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
ZBED9Q6R2W3 CCDC91-207ENST00000539107 2440 ntTSL 5 BASIC27.46■■□□□ 1.99
ZBED9Q6R2W3 POLR2H-204ENST00000438240 994 ntTSL 3 BASIC27.45■■□□□ 1.99
ZBED9Q6R2W3 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC27.45■■□□□ 1.99
ZBED9Q6R2W3 GLI4-210ENST00000523522 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
ZBED9Q6R2W3 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC27.45■■□□□ 1.99
ZBED9Q6R2W3 NAA20-203ENST00000398602 1604 ntTSL 5 BASIC27.45■■□□□ 1.99
ZBED9Q6R2W3 VPS53-201ENST00000291074 2656 ntTSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
ZBED9Q6R2W3 ESR2-212ENST00000556275 2695 ntTSL 2 BASIC27.45■■□□□ 1.98
ZBED9Q6R2W3 TMCO6-203ENST00000394671 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.45■■□□□ 1.98
ZBED9Q6R2W3 AP004607.4-201ENST00000530158 1459 ntBASIC27.45■■□□□ 1.98
ZBED9Q6R2W3 C18orf25-204ENST00000615553 2329 ntTSL 5 BASIC27.45■■□□□ 1.98
ZBED9Q6R2W3 SUSD1-202ENST00000374263 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.45■■□□□ 1.98
ZBED9Q6R2W3 C22orf39-206ENST00000611555 1977 ntTSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
ZBED9Q6R2W3 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
ZBED9Q6R2W3 CPED1-202ENST00000340646 1056 ntTSL 5 BASIC27.44■■□□□ 1.98
ZBED9Q6R2W3 ASB16-201ENST00000293414 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
ZBED9Q6R2W3 HMOX2-208ENST00000570646 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
ZBED9Q6R2W3 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC27.44■■□□□ 1.98
ZBED9Q6R2W3 AC007249.2-201ENST00000553181 1737 ntTSL 5 BASIC27.44■■□□□ 1.98
ZBED9Q6R2W3 MAPK15-201ENST00000338033 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
ZBED9Q6R2W3 UCK2-201ENST00000367879 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
ZBED9Q6R2W3 ME2-218ENST00000640965 2476 ntTSL 5 BASIC27.44■■□□□ 1.98
ZBED9Q6R2W3 MPST-204ENST00000404393 1329 ntTSL 5 BASIC27.44■■□□□ 1.98
ZBED9Q6R2W3 NUDT14-202ENST00000392568 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
ZBED9Q6R2W3 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC27.43■■□□□ 1.98
ZBED9Q6R2W3 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC27.43■■□□□ 1.98
ZBED9Q6R2W3 CPT2-209ENST00000636935 803 ntTSL 5 BASIC27.43■■□□□ 1.98
ZBED9Q6R2W3 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
ZBED9Q6R2W3 SSH3-202ENST00000308298 2046 ntTSL 2 BASIC27.43■■□□□ 1.98
ZBED9Q6R2W3 FAM189B-201ENST00000350210 2379 ntTSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
ZBED9Q6R2W3 H2AFX-202ENST00000530167 1614 ntAPPRIS P1 BASIC27.43■■□□□ 1.98
ZBED9Q6R2W3 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC27.43■■□□□ 1.98
ZBED9Q6R2W3 ZNF282-203ENST00000479907 1815 ntTSL 2 BASIC27.43■■□□□ 1.98
ZBED9Q6R2W3 USP39-204ENST00000409766 2033 ntTSL 2 BASIC27.43■■□□□ 1.98
ZBED9Q6R2W3 AVPR2-202ENST00000358927 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.43■■□□□ 1.98
ZBED9Q6R2W3 OXER1-201ENST00000378661 1781 ntAPPRIS P1 BASIC27.43■■□□□ 1.98
ZBED9Q6R2W3 EPO-201ENST00000252723 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
ZBED9Q6R2W3 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC27.42■■□□□ 1.98
ZBED9Q6R2W3 CHST8-203ENST00000438847 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
ZBED9Q6R2W3 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC27.42■■□□□ 1.98
ZBED9Q6R2W3 FP565260.3-201ENST00000612610 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
ZBED9Q6R2W3 GNB2-206ENST00000424361 1478 ntTSL 5 BASIC27.42■■□□□ 1.98
ZBED9Q6R2W3 BORCS8-MEF2B-202ENST00000444486 1492 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.42■■□□□ 1.98
ZBED9Q6R2W3 CHD1L-201ENST00000361293 2484 ntTSL 2 BASIC27.42■■□□□ 1.98
ZBED9Q6R2W3 KLC1-208ENST00000452929 2453 ntTSL 5 BASIC27.42■■□□□ 1.98
ZBED9Q6R2W3 LINC00969-219ENST00000453324 1439 ntTSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
ZBED9Q6R2W3 PRKRA-201ENST00000325748 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
ZBED9Q6R2W3 XBP1-203ENST00000403532 1824 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC27.42■■□□□ 1.98
ZBED9Q6R2W3 LACTB-202ENST00000413507 2978 ntTSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
ZBED9Q6R2W3 FAM46B-201ENST00000289166 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
ZBED9Q6R2W3 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.42■■□□□ 1.98
ZBED9Q6R2W3 DUX4-204ENST00000569241 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
ZBED9Q6R2W3 MSLN-205ENST00000563941 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
ZBED9Q6R2W3 CRHR1-203ENST00000339069 2490 ntTSL 2 BASIC27.42■■□□□ 1.98
ZBED9Q6R2W3 SEC11A-201ENST00000268220 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
ZBED9Q6R2W3 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
ZBED9Q6R2W3 LTC4S-202ENST00000401985 486 ntTSL 3 BASIC27.41■■□□□ 1.98
ZBED9Q6R2W3 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC27.41■■□□□ 1.98
ZBED9Q6R2W3 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC27.41■■□□□ 1.98
ZBED9Q6R2W3 SLC41A3-201ENST00000315891 1797 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
ZBED9Q6R2W3 RBM45-207ENST00000616198 1788 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
ZBED9Q6R2W3 METRNL-203ENST00000571814 1900 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
ZBED9Q6R2W3 LAYN-203ENST00000436913 2590 ntTSL 2 BASIC27.41■■□□□ 1.98
ZBED9Q6R2W3 ME3-202ENST00000393324 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
ZBED9Q6R2W3 KIRREL2-202ENST00000347900 2015 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
ZBED9Q6R2W3 TUSC3-203ENST00000503731 1498 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.8 ms