Protein–RNA interactions for Protein: Q6Q0C0

TRAF7, E3 ubiquitin-protein ligase TRAF7, humanhuman

Predictions only

Length 670 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAF7Q6Q0C0 RPS15-206ENST00000589656 473 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
TRAF7Q6Q0C0 CD99-210ENST00000611428 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
TRAF7Q6Q0C0 RALGPS1-207ENST00000394022 1672 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
TRAF7Q6Q0C0 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
TRAF7Q6Q0C0 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
TRAF7Q6Q0C0 AC133065.2-201ENST00000573379 2147 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
TRAF7Q6Q0C0 RORA-204ENST00000449337 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
TRAF7Q6Q0C0 FUZ-216ENST00000533418 1524 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
TRAF7Q6Q0C0 SLC38A8-201ENST00000299709 1308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
TRAF7Q6Q0C0 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
TRAF7Q6Q0C0 RNF38-205ENST00000377877 1974 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
TRAF7Q6Q0C0 STX5-203ENST00000394690 1568 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
TRAF7Q6Q0C0 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
TRAF7Q6Q0C0 CYB5R2-212ENST00000533558 1658 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
TRAF7Q6Q0C0 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
TRAF7Q6Q0C0 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
TRAF7Q6Q0C0 MAST1-208ENST00000591495 1496 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
TRAF7Q6Q0C0 TM7SF2-201ENST00000279263 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
TRAF7Q6Q0C0 ZNF410-206ENST00000540593 1722 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
TRAF7Q6Q0C0 PRTN3-201ENST00000234347 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
TRAF7Q6Q0C0 MRPL15-201ENST00000260102 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
TRAF7Q6Q0C0 C6orf132-202ENST00000356542 894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
TRAF7Q6Q0C0 MTFP1-203ENST00000407550 912 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
TRAF7Q6Q0C0 AC007322.3-201ENST00000426526 701 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
TRAF7Q6Q0C0 AC092849.2-201ENST00000492523 333 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
TRAF7Q6Q0C0 ANP32AP1-202ENST00000560832 1074 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
TRAF7Q6Q0C0 AC007493.2-201ENST00000568427 478 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
TRAF7Q6Q0C0 RN7SL471P-201ENST00000580476 299 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
TRAF7Q6Q0C0 AL024498.1-202ENST00000606652 480 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
TRAF7Q6Q0C0 FAM99A-202ENST00000538190 1989 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
TRAF7Q6Q0C0 LINC00605-201ENST00000514902 1558 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
TRAF7Q6Q0C0 AC092368.3-202ENST00000574180 1591 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
TRAF7Q6Q0C0 MFSD14C-208ENST00000637864 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
TRAF7Q6Q0C0 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
TRAF7Q6Q0C0 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC22.75■■□□□ 1.23
TRAF7Q6Q0C0 DTD1-201ENST00000377452 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
TRAF7Q6Q0C0 ANKRD44-204ENST00000409919 1622 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
TRAF7Q6Q0C0 CYP21A1P-202ENST00000354927 1481 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
TRAF7Q6Q0C0 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
TRAF7Q6Q0C0 ONECUT3-201ENST00000382349 8318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
TRAF7Q6Q0C0 PTPMT1-202ENST00000326674 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
TRAF7Q6Q0C0 MFF-205ENST00000354503 1085 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
TRAF7Q6Q0C0 CACNA1H-202ENST00000358590 8069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
TRAF7Q6Q0C0 PRSS3-202ENST00000361005 966 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
TRAF7Q6Q0C0 CERNA3-201ENST00000521403 557 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
TRAF7Q6Q0C0 KLF2-202ENST00000592003 564 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
TRAF7Q6Q0C0 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
TRAF7Q6Q0C0 TSPAN3-207ENST00000559494 1326 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
TRAF7Q6Q0C0 DPF1-201ENST00000355526 1632 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
TRAF7Q6Q0C0 B4GALNT1-203ENST00000449184 1633 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
TRAF7Q6Q0C0 POTED-202ENST00000620442 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
TRAF7Q6Q0C0 AL645608.1-202ENST00000417705 1389 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
TRAF7Q6Q0C0 DDIT4-201ENST00000307365 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
TRAF7Q6Q0C0 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
TRAF7Q6Q0C0 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
TRAF7Q6Q0C0 EXTL3-213ENST00000523149 1779 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
TRAF7Q6Q0C0 FDXR-219ENST00000583917 1762 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
TRAF7Q6Q0C0 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
TRAF7Q6Q0C0 NIPAL4-202ENST00000435489 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
TRAF7Q6Q0C0 C6orf48-205ENST00000375640 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
TRAF7Q6Q0C0 HOXD12-201ENST00000404162 841 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
TRAF7Q6Q0C0 CDKN2A-205ENST00000479692 544 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
TRAF7Q6Q0C0 DLEU7-203ENST00000504404 1122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
TRAF7Q6Q0C0 DEDD2-205ENST00000596251 1183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
TRAF7Q6Q0C0 ACAA1-202ENST00000333167 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
TRAF7Q6Q0C0 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
TRAF7Q6Q0C0 AC092384.1-201ENST00000378347 1812 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
TRAF7Q6Q0C0 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
TRAF7Q6Q0C0 TMEM53-205ENST00000372244 1472 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
TRAF7Q6Q0C0 GOLGA4-212ENST00000617480 1545 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
TRAF7Q6Q0C0 NELFE-202ENST00000375429 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
TRAF7Q6Q0C0 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
TRAF7Q6Q0C0 CERS5-201ENST00000317551 2051 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
TRAF7Q6Q0C0 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
TRAF7Q6Q0C0 TUSC2-201ENST00000232496 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
TRAF7Q6Q0C0 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
TRAF7Q6Q0C0 N4BP2L1-203ENST00000380133 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
TRAF7Q6Q0C0 TNFRSF1B-204ENST00000536782 557 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
TRAF7Q6Q0C0 AC127496.6-201ENST00000576215 338 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
TRAF7Q6Q0C0 METTL23-208ENST00000588822 1049 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
TRAF7Q6Q0C0 PTCD3-220ENST00000627371 210 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
TRAF7Q6Q0C0 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
TRAF7Q6Q0C0 PHB2-201ENST00000399433 1308 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
TRAF7Q6Q0C0 TMEM191C-214ENST00000621561 1337 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
TRAF7Q6Q0C0 MOK-226ENST00000522874 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
TRAF7Q6Q0C0 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
TRAF7Q6Q0C0 SUGCT-202ENST00000401647 1369 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
TRAF7Q6Q0C0 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
TRAF7Q6Q0C0 RBBP7-202ENST00000380084 2036 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
TRAF7Q6Q0C0 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
TRAF7Q6Q0C0 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
TRAF7Q6Q0C0 NOXO1-202ENST00000356120 1539 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
TRAF7Q6Q0C0 DUSP28-201ENST00000343217 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
TRAF7Q6Q0C0 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
TRAF7Q6Q0C0 CELF2-213ENST00000633077 1733 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
TRAF7Q6Q0C0 CDC14A-203ENST00000370124 1883 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
TRAF7Q6Q0C0 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
TRAF7Q6Q0C0 ZIM2-201ENST00000593711 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
TRAF7Q6Q0C0 ARL2-201ENST00000246747 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
TRAF7Q6Q0C0 LTB-210ENST00000429299 897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.9 ms