Protein–RNA interactions for Protein: Q6PKG0

LARP1, La-related protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,096 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LARP1Q6PKG0 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC27.74■■■□□ 2.03
LARP1Q6PKG0 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
LARP1Q6PKG0 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
LARP1Q6PKG0 CDKN1C-204ENST00000440480 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
LARP1Q6PKG0 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC27.74■■■□□ 2.03
LARP1Q6PKG0 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
LARP1Q6PKG0 NXN-202ENST00000537628 1340 ntTSL 3 BASIC27.73■■■□□ 2.03
LARP1Q6PKG0 ARRB2-216ENST00000574954 1348 ntTSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
LARP1Q6PKG0 CFAP99-206ENST00000616117 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.73■■■□□ 2.03
LARP1Q6PKG0 PARL-201ENST00000311101 1240 ntTSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
LARP1Q6PKG0 LINC01659-202ENST00000449711 917 ntTSL 3 BASIC27.73■■■□□ 2.03
LARP1Q6PKG0 KRT8P12-201ENST00000468527 998 ntTSL 2 BASIC27.73■■■□□ 2.03
LARP1Q6PKG0 COX4I1-202ENST00000561569 716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.73■■■□□ 2.03
LARP1Q6PKG0 ARMC4P1-202ENST00000576034 643 ntTSL 2 BASIC27.73■■■□□ 2.03
LARP1Q6PKG0 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
LARP1Q6PKG0 MGAT4D-208ENST00000515354 1806 ntTSL 3 BASIC27.73■■■□□ 2.03
LARP1Q6PKG0 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.73■■■□□ 2.03
LARP1Q6PKG0 ITGA4-202ENST00000339307 1403 ntTSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
LARP1Q6PKG0 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
LARP1Q6PKG0 PHOSPHO1-206ENST00000514112 1587 ntTSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
LARP1Q6PKG0 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC27.72■■■□□ 2.03
LARP1Q6PKG0 SLC2A7-201ENST00000400906 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
LARP1Q6PKG0 B4GALNT1-202ENST00000418555 1861 ntTSL 2 BASIC27.72■■■□□ 2.03
LARP1Q6PKG0 PGF-201ENST00000238607 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.72■■■□□ 2.03
LARP1Q6PKG0 LRRC3B-201ENST00000396641 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
LARP1Q6PKG0 KCNE5-201ENST00000372101 1473 ntAPPRIS P1 BASIC27.72■■■□□ 2.03
LARP1Q6PKG0 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
LARP1Q6PKG0 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC27.72■■■□□ 2.03
LARP1Q6PKG0 PLPP2-201ENST00000269812 1228 ntTSL 3 BASIC27.72■■■□□ 2.03
LARP1Q6PKG0 TCTEX1D2-201ENST00000325318 673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
LARP1Q6PKG0 PRSS57-201ENST00000329267 1025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
LARP1Q6PKG0 TMSB4X-201ENST00000380633 495 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.72■■■□□ 2.03
LARP1Q6PKG0 SAPCD2P1-201ENST00000395413 1184 ntBASIC27.72■■■□□ 2.03
LARP1Q6PKG0 TMEM72-203ENST00000544540 1018 ntTSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
LARP1Q6PKG0 PRKACA-209ENST00000590853 1101 ntTSL 5 BASIC27.72■■■□□ 2.03
LARP1Q6PKG0 AC020913.2-201ENST00000601929 629 ntTSL 5 BASIC27.72■■■□□ 2.03
LARP1Q6PKG0 PRSS57-202ENST00000613411 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
LARP1Q6PKG0 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
LARP1Q6PKG0 FAM66E-201ENST00000529252 1433 ntTSL 2 BASIC27.72■■■□□ 2.03
LARP1Q6PKG0 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.72■■■□□ 2.03
LARP1Q6PKG0 POFUT1-201ENST00000375730 1507 ntTSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
LARP1Q6PKG0 NPAS1-201ENST00000439365 1341 ntTSL 2 BASIC27.71■■■□□ 2.03
LARP1Q6PKG0 CDKN2B-AS1-217ENST00000585267 1337 ntTSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
LARP1Q6PKG0 SLX1A-201ENST00000251303 1091 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
LARP1Q6PKG0 OR10H2-201ENST00000305899 1041 ntAPPRIS P1 BASIC27.71■■■□□ 2.03
LARP1Q6PKG0 SLX1B-201ENST00000330181 1165 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
LARP1Q6PKG0 SERF2-207ENST00000409614 582 ntTSL 2 BASIC27.71■■■□□ 2.03
LARP1Q6PKG0 STXBP1-203ENST00000476182 566 ntTSL 5 BASIC27.71■■■□□ 2.03
LARP1Q6PKG0 MAZ-215ENST00000569978 567 ntTSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
LARP1Q6PKG0 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
LARP1Q6PKG0 FBXO17-202ENST00000595329 1299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.71■■■□□ 2.03
LARP1Q6PKG0 MTDHP1-201ENST00000605323 784 ntBASIC27.71■■■□□ 2.03
LARP1Q6PKG0 TMEM204-201ENST00000253934 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
LARP1Q6PKG0 GOLGA4-212ENST00000617480 1545 ntTSL 5 BASIC27.71■■■□□ 2.03
LARP1Q6PKG0 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
LARP1Q6PKG0 FNIP1-204ENST00000511848 1720 ntTSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
LARP1Q6PKG0 NTSR2-201ENST00000306928 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
LARP1Q6PKG0 DPF1-209ENST00000456296 1562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.7■■■□□ 2.03
LARP1Q6PKG0 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC27.7■■■□□ 2.03
LARP1Q6PKG0 UCHL5-205ENST00000367454 1815 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
LARP1Q6PKG0 COX7A2L-201ENST00000234301 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
LARP1Q6PKG0 TPSAB1-201ENST00000338844 1175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
LARP1Q6PKG0 POMC-202ENST00000380794 1295 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.7■■■□□ 2.02
LARP1Q6PKG0 C4orf48-202ENST00000409860 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
LARP1Q6PKG0 AL390728.5-201ENST00000428687 706 ntTSL 3 BASIC27.7■■■□□ 2.02
LARP1Q6PKG0 BCL2L10-202ENST00000561198 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
LARP1Q6PKG0 PTGIR-202ENST00000594275 699 ntTSL 3 BASIC27.7■■■□□ 2.02
LARP1Q6PKG0 PTGIR-206ENST00000598865 724 ntTSL 3 BASIC27.7■■■□□ 2.02
LARP1Q6PKG0 AC133561.5-201ENST00000635547 218 ntBASIC27.7■■■□□ 2.02
LARP1Q6PKG0 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.7■■■□□ 2.02
LARP1Q6PKG0 WT1-211ENST00000639907 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.7■■■□□ 2.02
LARP1Q6PKG0 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
LARP1Q6PKG0 AUNIP-203ENST00000538789 1392 ntTSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
LARP1Q6PKG0 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
LARP1Q6PKG0 CYP21A1P-202ENST00000354927 1481 ntBASIC27.7■■■□□ 2.02
LARP1Q6PKG0 KRT17P2-201ENST00000300992 1314 ntBASIC27.69■■■□□ 2.02
LARP1Q6PKG0 NDUFV3-202ENST00000354250 1575 ntTSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
LARP1Q6PKG0 AC013269.1-201ENST00000409259 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
LARP1Q6PKG0 TISP43-206ENST00000623376 1653 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
LARP1Q6PKG0 CDC123-201ENST00000281141 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
LARP1Q6PKG0 USF2-203ENST00000379134 648 ntTSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
LARP1Q6PKG0 CCDC74B-204ENST00000409234 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
LARP1Q6PKG0 AC090877.2-202ENST00000560363 574 ntTSL 2 BASIC27.69■■■□□ 2.02
LARP1Q6PKG0 ZNF134-203ENST00000600344 483 ntTSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
LARP1Q6PKG0 AC124016.1-201ENST00000609552 612 ntBASIC27.69■■■□□ 2.02
LARP1Q6PKG0 AL049637.2-201ENST00000641778 930 ntBASIC27.69■■■□□ 2.02
LARP1Q6PKG0 SERPINB6-204ENST00000380529 1370 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.69■■■□□ 2.02
LARP1Q6PKG0 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC27.69■■■□□ 2.02
LARP1Q6PKG0 MAST1-208ENST00000591495 1496 ntTSL 5 BASIC27.69■■■□□ 2.02
LARP1Q6PKG0 LIME1-201ENST00000309546 1178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
LARP1Q6PKG0 COL11A2-204ENST00000395194 1194 ntTSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
LARP1Q6PKG0 AC087499.1-201ENST00000418141 1075 ntBASIC27.68■■■□□ 2.02
LARP1Q6PKG0 MUC1-211ENST00000438413 927 ntTSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
LARP1Q6PKG0 TNFRSF18-204ENST00000486728 727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
LARP1Q6PKG0 LY6E-205ENST00000519611 635 ntTSL 3 BASIC27.68■■■□□ 2.02
LARP1Q6PKG0 LY6E-212ENST00000522024 868 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.68■■■□□ 2.02
LARP1Q6PKG0 SIVA1-203ENST00000535554 1244 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.68■■■□□ 2.02
LARP1Q6PKG0 CRNDE-210ENST00000560912 459 ntTSL 5 BASIC27.68■■■□□ 2.02
LARP1Q6PKG0 AC008750.8-201ENST00000600067 551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.68■■■□□ 2.02
LARP1Q6PKG0 CLDND2-203ENST00000601435 575 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.68■■■□□ 2.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.5 ms