Protein–RNA interactions for Protein: Q6P3S1

DENND1B, DENN domain-containing protein 1B, humanhuman

Predictions only

Length 775 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DENND1BQ6P3S1 DUSP28-201ENST00000343217 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
DENND1BQ6P3S1 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
DENND1BQ6P3S1 AC016769.1-201ENST00000409132 1010 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
DENND1BQ6P3S1 CCDC74B-205ENST00000409943 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
DENND1BQ6P3S1 AC006015.1-201ENST00000429970 570 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
DENND1BQ6P3S1 AP001363.2-201ENST00000538101 391 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
DENND1BQ6P3S1 ABCC6P2-202ENST00000542005 706 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
DENND1BQ6P3S1 SEC11A-208ENST00000559729 1256 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
DENND1BQ6P3S1 ABCC6-204ENST00000575728 714 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
DENND1BQ6P3S1 IKBKGP1-201ENST00000612193 1073 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
DENND1BQ6P3S1 GATA6-AS1-202ENST00000583490 1788 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
DENND1BQ6P3S1 COL23A1-201ENST00000390654 3061 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
DENND1BQ6P3S1 TPD52L1-201ENST00000304877 1468 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
DENND1BQ6P3S1 DBX2-201ENST00000332700 2806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
DENND1BQ6P3S1 MEIS2-207ENST00000557796 2666 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
DENND1BQ6P3S1 HDAC11-211ENST00000433119 2043 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
DENND1BQ6P3S1 TNIP1-205ENST00000518977 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
DENND1BQ6P3S1 C7orf49-213ENST00000617987 1727 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
DENND1BQ6P3S1 FAM118B-209ENST00000533050 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
DENND1BQ6P3S1 DRD2-202ENST00000362072 2789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
DENND1BQ6P3S1 BSN-AS2-201ENST00000421598 2603 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
DENND1BQ6P3S1 CERS1-202ENST00000542296 1947 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
DENND1BQ6P3S1 NMRAL1-212ENST00000574425 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
DENND1BQ6P3S1 MAPRE3-203ENST00000405074 1801 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
DENND1BQ6P3S1 E4F1-206ENST00000565090 2028 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
DENND1BQ6P3S1 CAMK2B-207ENST00000358707 1895 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
DENND1BQ6P3S1 FGF7P6-201ENST00000377614 1890 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
DENND1BQ6P3S1 BX664615.2-202ENST00000639056 1888 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
DENND1BQ6P3S1 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
DENND1BQ6P3S1 THEM6-201ENST00000336138 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
DENND1BQ6P3S1 ABLIM2-204ENST00000407564 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
DENND1BQ6P3S1 SLC35A3-210ENST00000638371 2298 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
DENND1BQ6P3S1 SSTR3-202ENST00000617123 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
DENND1BQ6P3S1 CELF2-211ENST00000632065 1952 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
DENND1BQ6P3S1 ALG1-202ENST00000544428 1419 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
DENND1BQ6P3S1 INAFM2-202ENST00000638170 3052 ntAPPRIS P1 BASIC21.99■■□□□ 1.11
DENND1BQ6P3S1 MXRA8-201ENST00000309212 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
DENND1BQ6P3S1 TUBA1A-201ENST00000295766 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
DENND1BQ6P3S1 IZUMO4-203ENST00000395307 944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
DENND1BQ6P3S1 UQCRFS1P1-201ENST00000435169 820 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
DENND1BQ6P3S1 PARL-206ENST00000435888 1098 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
DENND1BQ6P3S1 EDA-209ENST00000525810 843 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
DENND1BQ6P3S1 EDA-210ENST00000527388 927 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
DENND1BQ6P3S1 MVB12A-212ENST00000543795 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
DENND1BQ6P3S1 AC024267.6-201ENST00000580603 583 ntTSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
DENND1BQ6P3S1 MFSD11-216ENST00000590393 1141 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
DENND1BQ6P3S1 AC011767.1-201ENST00000617410 1153 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
DENND1BQ6P3S1 AC092437.1-201ENST00000624794 1048 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
DENND1BQ6P3S1 TMEM204-202ENST00000566264 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
DENND1BQ6P3S1 PLK5-205ENST00000642079 1969 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
DENND1BQ6P3S1 ORAI3-201ENST00000318663 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
DENND1BQ6P3S1 ANAPC4-201ENST00000315368 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
DENND1BQ6P3S1 LAG3-202ENST00000441671 1576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
DENND1BQ6P3S1 LINC00605-201ENST00000514902 1558 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
DENND1BQ6P3S1 PAQR6-213ENST00000612424 2037 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
DENND1BQ6P3S1 PACSIN3-201ENST00000298838 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
DENND1BQ6P3S1 GPAA1-202ENST00000361036 1840 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
DENND1BQ6P3S1 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC21.99■■□□□ 1.11
DENND1BQ6P3S1 DGKQ-201ENST00000273814 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
DENND1BQ6P3S1 PLAGL1-207ENST00000417959 1645 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
DENND1BQ6P3S1 TFAP2A-202ENST00000379608 2576 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
DENND1BQ6P3S1 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
DENND1BQ6P3S1 CYB5R2-212ENST00000533558 1658 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
DENND1BQ6P3S1 BAG4-202ENST00000432471 1943 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
DENND1BQ6P3S1 HHIPL1-202ENST00000357223 2241 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
DENND1BQ6P3S1 SMIM12-202ENST00000423898 897 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
DENND1BQ6P3S1 LINC02199-202ENST00000510067 1008 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
DENND1BQ6P3S1 TSC22D3-205ENST00000372390 1812 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
DENND1BQ6P3S1 BOK-201ENST00000318407 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
DENND1BQ6P3S1 CERS4-209ENST00000559450 1637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
DENND1BQ6P3S1 RABL2B-206ENST00000395598 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
DENND1BQ6P3S1 NUDT10-201ENST00000356450 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
DENND1BQ6P3S1 HENMT1-203ENST00000402983 1696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
DENND1BQ6P3S1 CFAP97-205ENST00000514798 2895 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
DENND1BQ6P3S1 IVD-206ENST00000487418 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
DENND1BQ6P3S1 NOXO1-202ENST00000356120 1539 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
DENND1BQ6P3S1 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
DENND1BQ6P3S1 RNASEH2B-206ENST00000611510 1257 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
DENND1BQ6P3S1 AC010536.3-201ENST00000620306 533 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
DENND1BQ6P3S1 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
DENND1BQ6P3S1 KLF9-201ENST00000377126 5175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
DENND1BQ6P3S1 SLC9A3R1-201ENST00000262613 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
DENND1BQ6P3S1 RELA-201ENST00000308639 2681 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
DENND1BQ6P3S1 USP39-203ENST00000409470 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
DENND1BQ6P3S1 CD7-207ENST00000584284 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
DENND1BQ6P3S1 AC121338.2-201ENST00000622535 1744 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
DENND1BQ6P3S1 SPRN-201ENST00000414069 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
DENND1BQ6P3S1 FOXK2-201ENST00000335255 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
DENND1BQ6P3S1 RAB28-203ENST00000338176 1787 ntTSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
DENND1BQ6P3S1 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
DENND1BQ6P3S1 KLC2-207ENST00000421552 2721 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
DENND1BQ6P3S1 AC110285.2-201ENST00000571724 1565 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
DENND1BQ6P3S1 FAM20C-201ENST00000313766 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
DENND1BQ6P3S1 DUSP9-201ENST00000342782 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
DENND1BQ6P3S1 MMP17-201ENST00000360564 2411 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
DENND1BQ6P3S1 ZNF800-208ENST00000619291 2099 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
DENND1BQ6P3S1 CTCF-202ENST00000401394 2978 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
DENND1BQ6P3S1 C19orf24-201ENST00000409293 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
DENND1BQ6P3S1 KRT18P11-201ENST00000435214 1283 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
DENND1BQ6P3S1 ATPIF1-203ENST00000468425 539 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.5 ms