Protein–RNA interactions for Protein: Q6NW40

RGMB, RGM domain family member B, humanhuman

Predictions only

Length 437 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RGMBQ6NW40 TBC1D7-201ENST00000343141 1027 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
RGMBQ6NW40 PYCR3-202ENST00000377579 985 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
RGMBQ6NW40 CHCHD10-202ENST00000484558 1171 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
RGMBQ6NW40 SNX5-213ENST00000486039 602 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
RGMBQ6NW40 AC022211.2-202ENST00000582668 546 ntTSL 4 BASIC24.35■■□□□ 1.49
RGMBQ6NW40 FBXL12-203ENST00000586073 582 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
RGMBQ6NW40 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
RGMBQ6NW40 HPCAL1-201ENST00000307845 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
RGMBQ6NW40 TTYH1-203ENST00000376531 1763 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
RGMBQ6NW40 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
RGMBQ6NW40 H3F3A-204ENST00000366816 799 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.34■■□□□ 1.49
RGMBQ6NW40 C4orf48-202ENST00000409860 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
RGMBQ6NW40 DBNL-214ENST00000456905 1241 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
RGMBQ6NW40 MLF2-210ENST00000542154 838 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
RGMBQ6NW40 TPM1-226ENST00000560959 925 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
RGMBQ6NW40 CES1P1-204ENST00000574030 877 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
RGMBQ6NW40 AL353593.2-202ENST00000602947 550 ntTSL 4 BASIC24.34■■□□□ 1.49
RGMBQ6NW40 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
RGMBQ6NW40 HOXC9-203ENST00000508190 1505 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.34■■□□□ 1.49
RGMBQ6NW40 PPCS-203ENST00000372561 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
RGMBQ6NW40 PSKH2-201ENST00000276616 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
RGMBQ6NW40 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
RGMBQ6NW40 HLA-G-204ENST00000376828 1490 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
RGMBQ6NW40 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
RGMBQ6NW40 WNT1-201ENST00000293549 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
RGMBQ6NW40 HOXB-AS3-204ENST00000466037 522 ntTSL 3 BASIC24.33■■□□□ 1.49
RGMBQ6NW40 PHF11-218ENST00000496623 1173 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
RGMBQ6NW40 AC015712.2-203ENST00000560461 688 ntTSL 3 BASIC24.33■■□□□ 1.49
RGMBQ6NW40 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
RGMBQ6NW40 TSPAN3-210ENST00000561277 1592 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.48
RGMBQ6NW40 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
RGMBQ6NW40 MTFP1-201ENST00000266263 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
RGMBQ6NW40 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
RGMBQ6NW40 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
RGMBQ6NW40 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.32■■□□□ 1.48
RGMBQ6NW40 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
RGMBQ6NW40 KRAS-201ENST00000256078 1119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
RGMBQ6NW40 DESI2-201ENST00000263831 859 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
RGMBQ6NW40 CCDC103-202ENST00000410006 921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
RGMBQ6NW40 AC020922.2-201ENST00000596786 359 ntTSL 4 BASIC24.32■■□□□ 1.48
RGMBQ6NW40 AC120498.8-201ENST00000614275 531 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
RGMBQ6NW40 AC105020.6-201ENST00000621523 1217 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
RGMBQ6NW40 AC004706.3-201ENST00000634558 1009 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
RGMBQ6NW40 CROCCP2-205ENST00000639481 1296 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
RGMBQ6NW40 AC092865.7-201ENST00000641832 219 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
RGMBQ6NW40 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
RGMBQ6NW40 MADCAM1-201ENST00000215637 1572 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
RGMBQ6NW40 GORASP1-220ENST00000479927 1345 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
RGMBQ6NW40 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
RGMBQ6NW40 VPS13B-204ENST00000441350 1626 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
RGMBQ6NW40 AC007743.1-203ENST00000447423 1623 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
RGMBQ6NW40 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
RGMBQ6NW40 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
RGMBQ6NW40 RENBP-202ENST00000393700 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
RGMBQ6NW40 SLC2A7-201ENST00000400906 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
RGMBQ6NW40 CLDND2-201ENST00000291715 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
RGMBQ6NW40 FN3K-201ENST00000300784 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
RGMBQ6NW40 NDUFB1-201ENST00000329559 528 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
RGMBQ6NW40 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
RGMBQ6NW40 ICAM4-201ENST00000340992 1176 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
RGMBQ6NW40 ANK1-206ENST00000348036 622 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
RGMBQ6NW40 AC091729.3-201ENST00000423008 1401 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
RGMBQ6NW40 AC007322.3-201ENST00000426526 701 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
RGMBQ6NW40 AC008443.1-203ENST00000505151 886 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
RGMBQ6NW40 C5orf38-206ENST00000505778 509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
RGMBQ6NW40 EPHA5-AS1-202ENST00000509473 1177 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
RGMBQ6NW40 TPD52L1-207ENST00000527711 999 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
RGMBQ6NW40 GOSR2-208ENST00000573224 1115 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
RGMBQ6NW40 RMI2-205ENST00000576027 818 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
RGMBQ6NW40 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
RGMBQ6NW40 CYP21A1P-202ENST00000354927 1481 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
RGMBQ6NW40 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.3■■□□□ 1.48
RGMBQ6NW40 AQP6-201ENST00000315520 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
RGMBQ6NW40 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC24.3■■□□□ 1.48
RGMBQ6NW40 SLC35B2-205ENST00000538577 1909 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
RGMBQ6NW40 PYCR1-216ENST00000619204 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
RGMBQ6NW40 MMP23A-201ENST00000234610 1017 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
RGMBQ6NW40 MPC2-201ENST00000271373 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
RGMBQ6NW40 CA3-AS1-201ENST00000517697 559 ntTSL 4 BASIC24.3■■□□□ 1.48
RGMBQ6NW40 CDC42EP2-202ENST00000533419 1279 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.3■■□□□ 1.48
RGMBQ6NW40 B3GAT3-205ENST00000534026 1120 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
RGMBQ6NW40 AC126696.3-202ENST00000570159 553 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
RGMBQ6NW40 CABP2-204ENST00000636477 941 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
RGMBQ6NW40 PADI2-201ENST00000375481 1607 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
RGMBQ6NW40 MAST1-208ENST00000591495 1496 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
RGMBQ6NW40 TMEM51-203ENST00000400796 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
RGMBQ6NW40 CAV3-201ENST00000343849 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
RGMBQ6NW40 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
RGMBQ6NW40 PDCD2-202ENST00000392090 936 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
RGMBQ6NW40 BNIP3L-206ENST00000523515 915 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
RGMBQ6NW40 AC026471.5-201ENST00000615068 467 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
RGMBQ6NW40 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
RGMBQ6NW40 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
RGMBQ6NW40 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
RGMBQ6NW40 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
RGMBQ6NW40 BABAM1-213ENST00000601043 1366 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
RGMBQ6NW40 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
RGMBQ6NW40 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
RGMBQ6NW40 HCRT-201ENST00000293330 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
RGMBQ6NW40 SIVA1-201ENST00000329967 802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.7 ms