Protein–RNA interactions for Protein: Q6DD88

ATL3, Atlastin-3, humanhuman

Predictions only

Length 541 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATL3Q6DD88 FMR1-AS1-202ENST00000596112 1845 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
ATL3Q6DD88 KCTD13-207ENST00000568000 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
ATL3Q6DD88 THOC3-201ENST00000265097 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
ATL3Q6DD88 SUMO3-204ENST00000411651 1921 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
ATL3Q6DD88 PHOSPHO1-206ENST00000514112 1587 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
ATL3Q6DD88 SAE1-203ENST00000413379 2313 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
ATL3Q6DD88 PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 1133 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
ATL3Q6DD88 AC008175.2-201ENST00000612840 297 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
ATL3Q6DD88 TMEM204-201ENST00000253934 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
ATL3Q6DD88 MAMSTR-203ENST00000594582 1693 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
ATL3Q6DD88 SLC16A5-201ENST00000329783 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
ATL3Q6DD88 KLF14-201ENST00000583337 2827 ntAPPRIS P1 BASIC23.74■■□□□ 1.39
ATL3Q6DD88 DBNDD1-201ENST00000002501 2079 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
ATL3Q6DD88 ARFRP1-210ENST00000614942 2554 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
ATL3Q6DD88 RPUSD1-202ENST00000561734 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
ATL3Q6DD88 MANEAL-202ENST00000373045 2685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
ATL3Q6DD88 PBX1-222ENST00000627490 1769 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
ATL3Q6DD88 LRRC3C-201ENST00000377924 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.74■■□□□ 1.39
ATL3Q6DD88 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
ATL3Q6DD88 ADM-206ENST00000528655 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
ATL3Q6DD88 JAKMIP1-203ENST00000409371 2420 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
ATL3Q6DD88 MARK3-206ENST00000440884 2643 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
ATL3Q6DD88 FMR1-204ENST00000370471 4125 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
ATL3Q6DD88 HDGFL2-208ENST00000616600 2281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
ATL3Q6DD88 SLC17A7-201ENST00000221485 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
ATL3Q6DD88 PRMT8-202ENST00000382622 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
ATL3Q6DD88 FBXO31-207ENST00000618298 1871 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
ATL3Q6DD88 SMIM11B-205ENST00000624304 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
ATL3Q6DD88 SLC44A3-203ENST00000446120 2094 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
ATL3Q6DD88 OSCAR-208ENST00000611261 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
ATL3Q6DD88 NT5C3AP1-201ENST00000394500 1012 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
ATL3Q6DD88 LHX9-206ENST00000561173 2144 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
ATL3Q6DD88 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
ATL3Q6DD88 SMURF1-201ENST00000361125 5737 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
ATL3Q6DD88 MAG-203ENST00000537831 2341 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
ATL3Q6DD88 GPR162-201ENST00000311268 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
ATL3Q6DD88 C7orf49-213ENST00000617987 1727 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
ATL3Q6DD88 ARHGDIA-201ENST00000269321 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
ATL3Q6DD88 TERF2IP-201ENST00000300086 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
ATL3Q6DD88 COL13A1-202ENST00000357811 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
ATL3Q6DD88 PHOX2B-201ENST00000226382 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
ATL3Q6DD88 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
ATL3Q6DD88 BEX2-204ENST00000536889 1077 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
ATL3Q6DD88 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
ATL3Q6DD88 FAM71E1-204ENST00000600100 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
ATL3Q6DD88 POLR2E-214ENST00000619917 932 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
ATL3Q6DD88 MSRB1-201ENST00000361871 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
ATL3Q6DD88 NTNG2-202ENST00000393229 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
ATL3Q6DD88 ANAPC1P1-202ENST00000616781 1771 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
ATL3Q6DD88 SPOCK3-204ENST00000502330 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
ATL3Q6DD88 YIPF2-201ENST00000253031 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
ATL3Q6DD88 GPR108-201ENST00000264080 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
ATL3Q6DD88 TRIM4-202ENST00000354241 1942 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
ATL3Q6DD88 MEIS3-212ENST00000561293 1918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
ATL3Q6DD88 ARNTL2-209ENST00000546179 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
ATL3Q6DD88 DPF1-201ENST00000355526 1632 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
ATL3Q6DD88 AC132008.2-203ENST00000418868 1552 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
ATL3Q6DD88 MRPL37-206ENST00000605337 1582 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
ATL3Q6DD88 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
ATL3Q6DD88 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
ATL3Q6DD88 CPED1-202ENST00000340646 1056 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
ATL3Q6DD88 MOSPD3-202ENST00000379527 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
ATL3Q6DD88 SFTPC-205ENST00000521315 1046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
ATL3Q6DD88 AP003071.3-201ENST00000562506 366 ntTSL 3 BASIC23.71■■□□□ 1.39
ATL3Q6DD88 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
ATL3Q6DD88 HSD17B1-202ENST00000585807 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
ATL3Q6DD88 SMARCD2-203ENST00000448276 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
ATL3Q6DD88 PDZRN4-202ENST00000402685 3347 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
ATL3Q6DD88 CHRDL2-203ENST00000376332 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
ATL3Q6DD88 SLC41A3-201ENST00000315891 1797 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
ATL3Q6DD88 AC007249.2-201ENST00000553181 1737 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.39
ATL3Q6DD88 PNMA2-204ENST00000522362 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
ATL3Q6DD88 MATR3-206ENST00000503811 2518 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
ATL3Q6DD88 ME2-202ENST00000382927 2492 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
ATL3Q6DD88 SPATS2L-204ENST00000409140 2463 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
ATL3Q6DD88 KRT87P-202ENST00000534226 1464 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
ATL3Q6DD88 BAZ1A-202ENST00000360310 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
ATL3Q6DD88 OGG1-202ENST00000302008 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
ATL3Q6DD88 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
ATL3Q6DD88 AGAP1-IT1-201ENST00000440498 664 ntTSL 3 BASIC23.7■■□□□ 1.38
ATL3Q6DD88 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
ATL3Q6DD88 ARHGAP24-206ENST00000503995 1273 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
ATL3Q6DD88 RNF114-202ENST00000622920 1284 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
ATL3Q6DD88 SLC16A3-201ENST00000392339 2074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
ATL3Q6DD88 SLC16A3-202ENST00000392341 2086 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
ATL3Q6DD88 FP700111.2-201ENST00000619190 1892 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
ATL3Q6DD88 PTGER3-212ENST00000628037 1815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
ATL3Q6DD88 AL162377.1-201ENST00000618844 1793 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
ATL3Q6DD88 TMPO-204ENST00000393053 2374 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
ATL3Q6DD88 GRK4-203ENST00000398052 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
ATL3Q6DD88 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
ATL3Q6DD88 DYNC1I1-211ENST00000537881 2146 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
ATL3Q6DD88 BORCS8-MEF2B-202ENST00000444486 1492 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
ATL3Q6DD88 GPR35-204ENST00000430267 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
ATL3Q6DD88 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
ATL3Q6DD88 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
ATL3Q6DD88 ADGRA3-204ENST00000502482 2870 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
ATL3Q6DD88 LINC01011-201ENST00000445000 2811 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
ATL3Q6DD88 RARRES2-201ENST00000223271 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
ATL3Q6DD88 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.8 ms