Protein–RNA interactions for Protein: Q5VYK3

ECM29, Proteasome-associated protein ECM29 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 1,845 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ECM29Q5VYK3 AL158047.1-201ENST00000445918 881 ntBASIC25.11■■□□□ 1.61
ECM29Q5VYK3 UNC93B4-201ENST00000505679 747 ntBASIC25.11■■□□□ 1.61
ECM29Q5VYK3 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
ECM29Q5VYK3 SEPT1-201ENST00000321367 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
ECM29Q5VYK3 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
ECM29Q5VYK3 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
ECM29Q5VYK3 LHFPL3-202ENST00000424859 1852 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
ECM29Q5VYK3 ESRRAP1-201ENST00000400596 1257 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
ECM29Q5VYK3 CDK6-202ENST00000424848 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
ECM29Q5VYK3 CAPZB-205ENST00000433834 1462 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
ECM29Q5VYK3 MRPL40-201ENST00000333130 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
ECM29Q5VYK3 CLDN5-204ENST00000618236 1374 ntAPPRIS P1 BASIC25.1■■□□□ 1.61
ECM29Q5VYK3 THAP7-201ENST00000215742 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
ECM29Q5VYK3 OR2A1-AS1-201ENST00000462305 773 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
ECM29Q5VYK3 AC004889.1-204ENST00000474656 773 ntTSL 3 BASIC25.09■■□□□ 1.61
ECM29Q5VYK3 JOSD2-205ENST00000601423 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
ECM29Q5VYK3 PIAS2-203ENST00000545673 1590 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
ECM29Q5VYK3 PITX3-201ENST00000370002 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
ECM29Q5VYK3 AC068473.1-201ENST00000317008 1111 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
ECM29Q5VYK3 SSNA1-201ENST00000322310 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
ECM29Q5VYK3 AC009052.1-201ENST00000567090 298 ntTSL 3 BASIC25.09■■□□□ 1.61
ECM29Q5VYK3 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
ECM29Q5VYK3 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
ECM29Q5VYK3 ARNTL2-209ENST00000546179 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
ECM29Q5VYK3 TRADD-202ENST00000486556 1833 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
ECM29Q5VYK3 YBX1-201ENST00000321358 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
ECM29Q5VYK3 SCO2-201ENST00000252785 992 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
ECM29Q5VYK3 CYYR1-202ENST00000400043 735 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
ECM29Q5VYK3 NDUFB2-203ENST00000461457 559 ntTSL 3 BASIC25.08■■□□□ 1.61
ECM29Q5VYK3 AC089999.2-201ENST00000552525 248 ntTSL 3 BASIC25.08■■□□□ 1.61
ECM29Q5VYK3 PHLDB2-210ENST00000478922 1861 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
ECM29Q5VYK3 CD55-205ENST00000367067 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
ECM29Q5VYK3 ST3GAL4-215ENST00000532243 1825 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
ECM29Q5VYK3 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
ECM29Q5VYK3 ACBD4-202ENST00000376955 1453 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
ECM29Q5VYK3 DUSP23-201ENST00000368107 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
ECM29Q5VYK3 FAM167B-201ENST00000373582 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
ECM29Q5VYK3 SPI1-204ENST00000533968 1290 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
ECM29Q5VYK3 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
ECM29Q5VYK3 PEX10-202ENST00000447513 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
ECM29Q5VYK3 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
ECM29Q5VYK3 SH3GLB2-202ENST00000372559 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
ECM29Q5VYK3 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
ECM29Q5VYK3 PRAF2-202ENST00000553851 1334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
ECM29Q5VYK3 R3HCC1-210ENST00000625275 1489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
ECM29Q5VYK3 C20orf196-202ENST00000378979 585 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
ECM29Q5VYK3 AL365295.1-202ENST00000456100 562 ntTSL 4 BASIC25.07■■□□□ 1.6
ECM29Q5VYK3 RHOD-202ENST00000532559 538 ntTSL 3 BASIC25.07■■□□□ 1.6
ECM29Q5VYK3 CYP2T3P-201ENST00000601990 817 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
ECM29Q5VYK3 CD24-208ENST00000622315 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
ECM29Q5VYK3 KCNK4-201ENST00000394525 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
ECM29Q5VYK3 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
ECM29Q5VYK3 P2RX2-201ENST00000343948 1494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
ECM29Q5VYK3 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
ECM29Q5VYK3 OLFM1-202ENST00000277415 1014 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
ECM29Q5VYK3 CLDN3-201ENST00000395145 1274 ntAPPRIS P1 BASIC25.06■■□□□ 1.6
ECM29Q5VYK3 SLC47A1P1-201ENST00000420951 500 ntTSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
ECM29Q5VYK3 HTT-AS-201ENST00000503893 515 ntTSL 4 BASIC25.06■■□□□ 1.6
ECM29Q5VYK3 IGFBP6-203ENST00000548547 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
ECM29Q5VYK3 ANAPC13-204ENST00000510994 1840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
ECM29Q5VYK3 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
ECM29Q5VYK3 HSF2BP-201ENST00000291560 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
ECM29Q5VYK3 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
ECM29Q5VYK3 AUH-202ENST00000375731 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
ECM29Q5VYK3 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
ECM29Q5VYK3 HLA-C-203ENST00000383329 1554 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
ECM29Q5VYK3 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
ECM29Q5VYK3 PDCD10-202ENST00000461494 934 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.05■■□□□ 1.6
ECM29Q5VYK3 SCARA5-203ENST00000518030 1074 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
ECM29Q5VYK3 C14orf144-202ENST00000555282 854 ntTSL 3 BASIC25.05■■□□□ 1.6
ECM29Q5VYK3 ZNF264-205ENST00000599653 705 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
ECM29Q5VYK3 FAM21FP-204ENST00000608637 956 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
ECM29Q5VYK3 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
ECM29Q5VYK3 CNTFR-202ENST00000378980 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
ECM29Q5VYK3 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC25.04■■□□□ 1.6
ECM29Q5VYK3 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
ECM29Q5VYK3 CA7-201ENST00000338437 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
ECM29Q5VYK3 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
ECM29Q5VYK3 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
ECM29Q5VYK3 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC25.04■■□□□ 1.6
ECM29Q5VYK3 NMRK1-201ENST00000361092 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
ECM29Q5VYK3 AC007322.3-201ENST00000426526 701 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
ECM29Q5VYK3 AC128676.1-201ENST00000454392 318 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
ECM29Q5VYK3 FBXL8-203ENST00000518148 1054 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
ECM29Q5VYK3 AC005225.2-202ENST00000617980 408 ntTSL 4 BASIC25.04■■□□□ 1.6
ECM29Q5VYK3 MAGIX-207ENST00000615915 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
ECM29Q5VYK3 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
ECM29Q5VYK3 ANKRD44-204ENST00000409919 1622 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
ECM29Q5VYK3 SYNGR1-201ENST00000216155 497 ntTSL 3 BASIC25.03■■□□□ 1.6
ECM29Q5VYK3 DESI2-201ENST00000263831 859 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
ECM29Q5VYK3 MRAP-201ENST00000303645 935 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
ECM29Q5VYK3 PTPMT1-202ENST00000326674 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
ECM29Q5VYK3 PLEKHB1-216ENST00000543085 632 ntTSL 3 BASIC25.03■■□□□ 1.6
ECM29Q5VYK3 MAGIX-206ENST00000615626 1057 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
ECM29Q5VYK3 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
ECM29Q5VYK3 RNF180-201ENST00000296615 1727 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
ECM29Q5VYK3 ANKRD19P-205ENST00000473204 2370 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
ECM29Q5VYK3 FAM19A5-202ENST00000358295 2638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
ECM29Q5VYK3 FAM207A-202ENST00000397826 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
ECM29Q5VYK3 PET117-201ENST00000432901 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.1 ms