Protein–RNA interactions for Protein: Q5VV63

ATRNL1, Attractin-like protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,379 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATRNL1Q5VV63 PYCR1-216ENST00000619204 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
ATRNL1Q5VV63 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
ATRNL1Q5VV63 SNX21-201ENST00000342644 1506 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
ATRNL1Q5VV63 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
ATRNL1Q5VV63 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
ATRNL1Q5VV63 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
ATRNL1Q5VV63 BAG4-202ENST00000432471 1943 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
ATRNL1Q5VV63 SSNA1-201ENST00000322310 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
ATRNL1Q5VV63 PRSS3-202ENST00000361005 966 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
ATRNL1Q5VV63 EGFL7-202ENST00000371698 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
ATRNL1Q5VV63 PUSL1-201ENST00000379031 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
ATRNL1Q5VV63 KRT18P68-201ENST00000392293 1000 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
ATRNL1Q5VV63 FAM131A-208ENST00000453072 1038 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
ATRNL1Q5VV63 RRAS2-203ENST00000526063 970 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
ATRNL1Q5VV63 RRAS2-208ENST00000532814 982 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
ATRNL1Q5VV63 RPS15-206ENST00000589656 473 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
ATRNL1Q5VV63 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
ATRNL1Q5VV63 BCAT2-207ENST00000597011 1579 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
ATRNL1Q5VV63 NOXO1-202ENST00000356120 1539 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
ATRNL1Q5VV63 FUZ-216ENST00000533418 1524 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
ATRNL1Q5VV63 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
ATRNL1Q5VV63 ZNF622-201ENST00000308683 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
ATRNL1Q5VV63 HSD11B1L-218ENST00000581773 1687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
ATRNL1Q5VV63 DTD1-201ENST00000377452 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
ATRNL1Q5VV63 TMPRSS5-208ENST00000544476 1320 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
ATRNL1Q5VV63 WDR74-202ENST00000311713 1153 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
ATRNL1Q5VV63 AL158047.1-201ENST00000445918 881 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
ATRNL1Q5VV63 AC142381.4-202ENST00000563973 229 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
ATRNL1Q5VV63 ZNF264-205ENST00000599653 705 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
ATRNL1Q5VV63 PQLC2-203ENST00000400548 1548 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
ATRNL1Q5VV63 P2RX2-201ENST00000343948 1494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
ATRNL1Q5VV63 SPN-202ENST00000395389 1935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
ATRNL1Q5VV63 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
ATRNL1Q5VV63 THOC3-201ENST00000265097 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
ATRNL1Q5VV63 HOXA4-202ENST00000428284 1595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
ATRNL1Q5VV63 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
ATRNL1Q5VV63 DISC1-205ENST00000366636 2224 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
ATRNL1Q5VV63 GOLGA4-212ENST00000617480 1545 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
ATRNL1Q5VV63 LRRC26-201ENST00000371542 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
ATRNL1Q5VV63 ZNRF2P2-202ENST00000442865 590 ntTSL 4 BASIC24.54■■□□□ 1.52
ATRNL1Q5VV63 AL356020.1-201ENST00000554235 1076 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
ATRNL1Q5VV63 ATRAID-208ENST00000611786 1256 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
ATRNL1Q5VV63 DUSP2-201ENST00000288943 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
ATRNL1Q5VV63 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
ATRNL1Q5VV63 GRINA-202ENST00000395068 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
ATRNL1Q5VV63 OLIG3-201ENST00000367734 2049 ntAPPRIS P1 BASIC24.53■■□□□ 1.52
ATRNL1Q5VV63 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
ATRNL1Q5VV63 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
ATRNL1Q5VV63 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
ATRNL1Q5VV63 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC24.53■■□□□ 1.52
ATRNL1Q5VV63 C7orf49-213ENST00000617987 1727 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
ATRNL1Q5VV63 MAST1-208ENST00000591495 1496 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
ATRNL1Q5VV63 GOLGA2P6-201ENST00000340929 2049 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
ATRNL1Q5VV63 AK2-201ENST00000354858 1021 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
ATRNL1Q5VV63 SEC61A2-206ENST00000379051 707 ntTSL 3 BASIC24.53■■□□□ 1.52
ATRNL1Q5VV63 HOTAIRM1-203ENST00000429611 722 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
ATRNL1Q5VV63 AC044860.1-201ENST00000560756 1160 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
ATRNL1Q5VV63 SLC25A22-216ENST00000531214 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
ATRNL1Q5VV63 SSTR3-202ENST00000617123 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
ATRNL1Q5VV63 OLFM1-202ENST00000277415 1014 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
ATRNL1Q5VV63 CEACAM3-201ENST00000344550 1022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
ATRNL1Q5VV63 CSF1-205ENST00000420111 1083 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
ATRNL1Q5VV63 AL596275.1-201ENST00000423464 877 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
ATRNL1Q5VV63 AP000697.1-201ENST00000430607 339 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
ATRNL1Q5VV63 NT5C3B-203ENST00000435506 975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
ATRNL1Q5VV63 AL161908.1-201ENST00000451449 449 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
ATRNL1Q5VV63 AC108693.2-201ENST00000492981 303 ntTSL 3 BASIC24.52■■□□□ 1.52
ATRNL1Q5VV63 SLC29A4P2-201ENST00000504749 1089 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
ATRNL1Q5VV63 SPI1-204ENST00000533968 1290 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
ATRNL1Q5VV63 PNMA6B-201ENST00000538162 1200 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
ATRNL1Q5VV63 AC105020.6-201ENST00000621523 1217 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
ATRNL1Q5VV63 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
ATRNL1Q5VV63 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
ATRNL1Q5VV63 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.51
ATRNL1Q5VV63 ESR1-210ENST00000456483 1368 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
ATRNL1Q5VV63 CD151-213ENST00000528011 1369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
ATRNL1Q5VV63 CDC123-201ENST00000281141 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
ATRNL1Q5VV63 C16orf58-209ENST00000567994 1845 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
ATRNL1Q5VV63 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
ATRNL1Q5VV63 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
ATRNL1Q5VV63 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
ATRNL1Q5VV63 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
ATRNL1Q5VV63 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
ATRNL1Q5VV63 EXTL3-213ENST00000523149 1779 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
ATRNL1Q5VV63 AC116050.2-201ENST00000612102 1779 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
ATRNL1Q5VV63 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
ATRNL1Q5VV63 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
ATRNL1Q5VV63 TANGO2-212ENST00000434570 2180 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
ATRNL1Q5VV63 AC069431.1-201ENST00000488882 1877 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
ATRNL1Q5VV63 PRTN3-201ENST00000234347 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
ATRNL1Q5VV63 C10orf76-201ENST00000311122 724 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
ATRNL1Q5VV63 AC068473.1-201ENST00000317008 1111 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
ATRNL1Q5VV63 ZDHHC20-204ENST00000415724 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
ATRNL1Q5VV63 CAVIN3-203ENST00000530979 957 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
ATRNL1Q5VV63 AC089999.2-201ENST00000552525 248 ntTSL 3 BASIC24.51■■□□□ 1.51
ATRNL1Q5VV63 BX649632.1-201ENST00000610187 819 ntTSL 3 BASIC24.51■■□□□ 1.51
ATRNL1Q5VV63 AC005225.2-202ENST00000617980 408 ntTSL 4 BASIC24.51■■□□□ 1.51
ATRNL1Q5VV63 PTCD3-220ENST00000627371 210 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
ATRNL1Q5VV63 CYB5R2-212ENST00000533558 1658 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
ATRNL1Q5VV63 FBXO6-201ENST00000376753 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.8 ms