Protein–RNA interactions for Protein: Q5VTD9

GFI1B, Zinc finger protein Gfi-1b, humanhuman

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Length 330 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GFI1BQ5VTD9 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
GFI1BQ5VTD9 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
GFI1BQ5VTD9 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
GFI1BQ5VTD9 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
GFI1BQ5VTD9 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
GFI1BQ5VTD9 MCCC1-214ENST00000610757 2410 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
GFI1BQ5VTD9 P2RX4-202ENST00000337233 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
GFI1BQ5VTD9 ZNF821-202ENST00000425432 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
GFI1BQ5VTD9 SPOCK2-209ENST00000536168 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
GFI1BQ5VTD9 MZF1-206ENST00000599369 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
GFI1BQ5VTD9 ZNRF1-202ENST00000335325 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
GFI1BQ5VTD9 POTEC-204ENST00000620346 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
GFI1BQ5VTD9 GABARAPL3-202ENST00000624044 1851 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
GFI1BQ5VTD9 HNRNPUL1-203ENST00000378215 2864 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
GFI1BQ5VTD9 TMEM79-203ENST00000405535 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
GFI1BQ5VTD9 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
GFI1BQ5VTD9 CNNM3-202ENST00000377060 3308 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
GFI1BQ5VTD9 CNIH3-201ENST00000272133 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
GFI1BQ5VTD9 HMOX2-218ENST00000619913 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
GFI1BQ5VTD9 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
GFI1BQ5VTD9 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
GFI1BQ5VTD9 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
GFI1BQ5VTD9 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
GFI1BQ5VTD9 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
GFI1BQ5VTD9 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
GFI1BQ5VTD9 SMAD7-201ENST00000262158 3087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
GFI1BQ5VTD9 TTC12-202ENST00000393020 2541 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
GFI1BQ5VTD9 IRX4-207ENST00000613726 2403 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
GFI1BQ5VTD9 ISCA1-203ENST00000375991 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
GFI1BQ5VTD9 ARHGEF18-202ENST00000359920 5733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
GFI1BQ5VTD9 PGM1-205ENST00000540265 2345 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
GFI1BQ5VTD9 KAT2A-201ENST00000225916 3109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
GFI1BQ5VTD9 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
GFI1BQ5VTD9 ZNF211-204ENST00000347302 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
GFI1BQ5VTD9 GAS2L1-210ENST00000621062 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
GFI1BQ5VTD9 TNXA-203ENST00000507684 2038 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
GFI1BQ5VTD9 CACNA1A-246ENST00000637736 8340 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
GFI1BQ5VTD9 MIB2-231ENST00000518681 3116 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
GFI1BQ5VTD9 CACNA1A-218ENST00000635895 8657 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
GFI1BQ5VTD9 CACNA1A-257ENST00000638009 8665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
GFI1BQ5VTD9 HTRA4-201ENST00000302495 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
GFI1BQ5VTD9 SEMA7A-203ENST00000543145 2304 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
GFI1BQ5VTD9 NFKBIE-204ENST00000619360 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
GFI1BQ5VTD9 GPRIN2-202ENST00000374317 1966 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
GFI1BQ5VTD9 TBX21-201ENST00000177694 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
GFI1BQ5VTD9 RTN4RL2-201ENST00000335099 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
GFI1BQ5VTD9 AK3-202ENST00000381809 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
GFI1BQ5VTD9 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
GFI1BQ5VTD9 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
GFI1BQ5VTD9 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
GFI1BQ5VTD9 AGTR1-209ENST00000497524 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
GFI1BQ5VTD9 KCNQ5-207ENST00000403813 6539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
GFI1BQ5VTD9 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
GFI1BQ5VTD9 JPT1-206ENST00000476258 2289 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
GFI1BQ5VTD9 GALNT13-201ENST00000392825 5536 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
GFI1BQ5VTD9 NNT-AS1-206ENST00000606697 1945 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
GFI1BQ5VTD9 PQLC2-201ENST00000375153 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
GFI1BQ5VTD9 LGI2-201ENST00000382114 6428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
GFI1BQ5VTD9 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
GFI1BQ5VTD9 CREB3-201ENST00000353704 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
GFI1BQ5VTD9 YBX3-202ENST00000279550 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
GFI1BQ5VTD9 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
GFI1BQ5VTD9 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
GFI1BQ5VTD9 ZNF696-201ENST00000330143 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
GFI1BQ5VTD9 BASP1-201ENST00000322611 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
GFI1BQ5VTD9 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
GFI1BQ5VTD9 LRFN4-201ENST00000309602 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
GFI1BQ5VTD9 PKP3-201ENST00000331563 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
GFI1BQ5VTD9 SPTBN4-207ENST00000595535 6105 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
GFI1BQ5VTD9 ZNF668-202ENST00000394983 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
GFI1BQ5VTD9 C3orf18-203ENST00000426034 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
GFI1BQ5VTD9 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
GFI1BQ5VTD9 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
GFI1BQ5VTD9 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
GFI1BQ5VTD9 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
GFI1BQ5VTD9 SPSB4-201ENST00000310546 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
GFI1BQ5VTD9 KCTD2-201ENST00000322444 3635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
GFI1BQ5VTD9 NLRP6-201ENST00000312165 2679 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
GFI1BQ5VTD9 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
GFI1BQ5VTD9 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
GFI1BQ5VTD9 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
GFI1BQ5VTD9 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
GFI1BQ5VTD9 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
GFI1BQ5VTD9 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
GFI1BQ5VTD9 PAQR4-202ENST00000318782 2793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
GFI1BQ5VTD9 GTPBP2-202ENST00000307126 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
GFI1BQ5VTD9 HMCES-201ENST00000383463 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
GFI1BQ5VTD9 TMEM250-201ENST00000418388 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
GFI1BQ5VTD9 STARD10-213ENST00000538536 1678 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
GFI1BQ5VTD9 ARNT-212ENST00000515192 2892 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
GFI1BQ5VTD9 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
GFI1BQ5VTD9 NADK-201ENST00000341426 3235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
GFI1BQ5VTD9 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
GFI1BQ5VTD9 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
GFI1BQ5VTD9 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
GFI1BQ5VTD9 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
GFI1BQ5VTD9 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
GFI1BQ5VTD9 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
GFI1BQ5VTD9 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
GFI1BQ5VTD9 GRIN3B-201ENST00000234389 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
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