Protein–RNA interactions for Protein: Q5VT99

LRRC38, Leucine-rich repeat-containing protein 38, humanhuman

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Length 294 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRC38Q5VT99 KCNK17-202ENST00000453413 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
LRRC38Q5VT99 STIM2-204ENST00000467087 5154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
LRRC38Q5VT99 SYTL1-211ENST00000618673 1712 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
LRRC38Q5VT99 RHNO1-204ENST00000489288 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
LRRC38Q5VT99 ZXDC-201ENST00000336332 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
LRRC38Q5VT99 NUDT11-201ENST00000375992 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
LRRC38Q5VT99 ZNF688-201ENST00000223459 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
LRRC38Q5VT99 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
LRRC38Q5VT99 RNF208-202ENST00000392827 1135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
LRRC38Q5VT99 RAMP1-203ENST00000404910 857 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
LRRC38Q5VT99 IL17RC-205ENST00000413608 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
LRRC38Q5VT99 YBX1P1-201ENST00000445822 960 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
LRRC38Q5VT99 RARRES2P11-201ENST00000635158 484 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
LRRC38Q5VT99 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
LRRC38Q5VT99 TMEM11-201ENST00000317635 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
LRRC38Q5VT99 SMAGP-205ENST00000603864 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
LRRC38Q5VT99 DLX2-201ENST00000234198 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
LRRC38Q5VT99 SP3-208ENST00000640958 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
LRRC38Q5VT99 OLFM1-204ENST00000371793 2444 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.59■■□□□ 1.05
LRRC38Q5VT99 CASTOR1-201ENST00000404953 1460 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
LRRC38Q5VT99 ANAPC1P1-202ENST00000616781 1771 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
LRRC38Q5VT99 STARD3-202ENST00000394250 1949 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
LRRC38Q5VT99 FAM72B-202ENST00000369390 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
LRRC38Q5VT99 NAA20-201ENST00000310450 920 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
LRRC38Q5VT99 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
LRRC38Q5VT99 C19orf12-205ENST00000392278 895 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
LRRC38Q5VT99 ATPIF1-204ENST00000497986 599 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
LRRC38Q5VT99 YJEFN3-203ENST00000514277 995 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
LRRC38Q5VT99 DUX4L2-201ENST00000561772 1275 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
LRRC38Q5VT99 IGFALS-203ENST00000568221 730 ntTSL 4 BASIC21.59■■□□□ 1.05
LRRC38Q5VT99 DUX4-206ENST00000616166 1275 ntAPPRIS P2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
LRRC38Q5VT99 AC120498.10-201ENST00000621827 505 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
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LRRC38Q5VT99 AC073130.3-201ENST00000624389 2278 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
LRRC38Q5VT99 WDR4-202ENST00000398208 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
LRRC38Q5VT99 PLEKHB1-204ENST00000398494 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
LRRC38Q5VT99 SSTR3-202ENST00000617123 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
LRRC38Q5VT99 HAUS4-205ENST00000541587 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
LRRC38Q5VT99 MIF4GD-202ENST00000325102 1306 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
LRRC38Q5VT99 TMEM163-201ENST00000281924 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
LRRC38Q5VT99 TAF6L-201ENST00000294168 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
LRRC38Q5VT99 AP000547.3-201ENST00000592918 1576 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
LRRC38Q5VT99 CYP21A1P-201ENST00000342991 1971 ntTSL 3 BASIC21.58■■□□□ 1.05
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LRRC38Q5VT99 GABRA2-214ENST00000515082 2366 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
LRRC38Q5VT99 IVD-206ENST00000487418 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
LRRC38Q5VT99 AC073314.1-201ENST00000568729 2216 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
LRRC38Q5VT99 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
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LRRC38Q5VT99 EIF6-203ENST00000374450 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
LRRC38Q5VT99 AC116614.1-201ENST00000456949 539 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
LRRC38Q5VT99 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
LRRC38Q5VT99 PHACTR2-203ENST00000367584 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
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LRRC38Q5VT99 MYO1D-213ENST00000583621 1916 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
LRRC38Q5VT99 TEX22-201ENST00000451127 2571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.04
LRRC38Q5VT99 ZNF773-204ENST00000598770 2019 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.04
LRRC38Q5VT99 NFYC-204ENST00000372653 1862 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.04
LRRC38Q5VT99 SLC46A3-202ENST00000380814 2121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
LRRC38Q5VT99 BORCS8-MEF2B-202ENST00000444486 1492 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.04
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LRRC38Q5VT99 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
LRRC38Q5VT99 SNX32-201ENST00000308342 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
LRRC38Q5VT99 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
LRRC38Q5VT99 MRPL14-201ENST00000372014 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
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LRRC38Q5VT99 ZSWIM7-205ENST00000472495 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
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LRRC38Q5VT99 PKMYT1-213ENST00000574385 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
LRRC38Q5VT99 SPATA5L1-201ENST00000305560 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
LRRC38Q5VT99 AL158151.1-201ENST00000372490 2047 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
LRRC38Q5VT99 GUCY1A3-210ENST00000513574 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
LRRC38Q5VT99 SMIM3-201ENST00000526627 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
LRRC38Q5VT99 PCMT1-205ENST00000464889 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
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LRRC38Q5VT99 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
LRRC38Q5VT99 AC104187.1-201ENST00000607510 612 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
LRRC38Q5VT99 AC091230.1-202ENST00000564823 5356 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
LRRC38Q5VT99 FASTK-201ENST00000297532 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
LRRC38Q5VT99 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
LRRC38Q5VT99 CHRNA3-202ENST00000348639 2030 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
LRRC38Q5VT99 CEBPA-201ENST00000498907 2631 ntAPPRIS P1 BASIC21.56■■□□□ 1.04
LRRC38Q5VT99 PALM-202ENST00000338448 2725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
LRRC38Q5VT99 NOS3-204ENST00000467517 2377 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
LRRC38Q5VT99 FAM129C-203ENST00000449408 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
LRRC38Q5VT99 PKM-215ENST00000565154 2004 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
LRRC38Q5VT99 APPL2-201ENST00000258530 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
LRRC38Q5VT99 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
LRRC38Q5VT99 TRAPPC2L-213ENST00000567895 854 ntTSL 3 BASIC21.55■■□□□ 1.04
LRRC38Q5VT99 AP001160.3-201ENST00000601484 763 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
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