Protein–RNA interactions for Protein: Q5UIP0

RIF1, Telomere-associated protein RIF1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 2,472 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RIF1Q5UIP0 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
RIF1Q5UIP0 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
RIF1Q5UIP0 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
RIF1Q5UIP0 HOXC13-AS-201ENST00000512916 1408 ntTSL 3 BASIC20.48■□□□□ 0.87
RIF1Q5UIP0 MRAS-202ENST00000423968 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
RIF1Q5UIP0 ELK1-202ENST00000343894 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
RIF1Q5UIP0 KRT18P68-201ENST00000392293 1000 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
RIF1Q5UIP0 TPPP3-202ENST00000393957 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
RIF1Q5UIP0 ZNF534-203ENST00000432303 956 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
RIF1Q5UIP0 AL355355.2-201ENST00000442321 338 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
RIF1Q5UIP0 C5orf38-206ENST00000505778 509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
RIF1Q5UIP0 PTP4A3-206ENST00000524028 963 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
RIF1Q5UIP0 AKTIP-212ENST00000570004 1162 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
RIF1Q5UIP0 AC003005.1-201ENST00000601674 582 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
RIF1Q5UIP0 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
RIF1Q5UIP0 OTUB1-211ENST00000543004 1647 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
RIF1Q5UIP0 WT1-211ENST00000639907 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
RIF1Q5UIP0 LINC01568-207ENST00000641790 1380 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
RIF1Q5UIP0 RBM42-204ENST00000589559 1328 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
RIF1Q5UIP0 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
RIF1Q5UIP0 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
RIF1Q5UIP0 RPLP0-201ENST00000228306 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
RIF1Q5UIP0 C16orf91-201ENST00000442039 978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
RIF1Q5UIP0 PACRGL-207ENST00000502938 810 ntTSL 4 BASIC20.47■□□□□ 0.87
RIF1Q5UIP0 MRPL36-202ENST00000505059 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
RIF1Q5UIP0 RAB6A-207ENST00000541588 758 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
RIF1Q5UIP0 AC002094.1-201ENST00000591482 1050 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
RIF1Q5UIP0 ILK-203ENST00000420936 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
RIF1Q5UIP0 NDUFB9-206ENST00000522532 1319 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
RIF1Q5UIP0 C22orf34-203ENST00000405854 1593 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
RIF1Q5UIP0 CRYGFP-201ENST00000418459 633 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
RIF1Q5UIP0 EPHX3-202ENST00000435261 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
RIF1Q5UIP0 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
RIF1Q5UIP0 NSMF-203ENST00000371472 1852 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
RIF1Q5UIP0 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
RIF1Q5UIP0 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
RIF1Q5UIP0 PRICKLE4-202ENST00000394260 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
RIF1Q5UIP0 PRICKLE4-203ENST00000394263 1155 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
RIF1Q5UIP0 KRASP1-201ENST00000407852 552 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
RIF1Q5UIP0 LINC00421-201ENST00000413833 1054 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
RIF1Q5UIP0 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
RIF1Q5UIP0 TSPAN3-210ENST00000561277 1592 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
RIF1Q5UIP0 PRR16-202ENST00000407149 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
RIF1Q5UIP0 HRAS-201ENST00000311189 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
RIF1Q5UIP0 EDARADD-201ENST00000334232 858 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
RIF1Q5UIP0 NMU-205ENST00000511469 756 ntTSL 3 BASIC20.46■□□□□ 0.87
RIF1Q5UIP0 AC064807.1-201ENST00000518942 816 ntTSL 3 BASIC20.46■□□□□ 0.87
RIF1Q5UIP0 MMP25-AS1-204ENST00000572574 794 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
RIF1Q5UIP0 AL590094.1-202ENST00000634619 1131 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
RIF1Q5UIP0 CYHR1-202ENST00000403000 1477 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
RIF1Q5UIP0 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
RIF1Q5UIP0 NPM3-201ENST00000370110 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
RIF1Q5UIP0 AC115618.1-201ENST00000376775 549 ntTSL 3 BASIC20.45■□□□□ 0.86
RIF1Q5UIP0 PYCR3-202ENST00000377579 985 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
RIF1Q5UIP0 MCF2L-207ENST00000397024 490 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
RIF1Q5UIP0 AC079145.1-201ENST00000416575 541 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
RIF1Q5UIP0 AQP12A-202ENST00000429564 1110 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
RIF1Q5UIP0 EFTUD1P1-201ENST00000558187 596 ntTSL 4 BASIC20.45■□□□□ 0.86
RIF1Q5UIP0 HSD11B1L-204ENST00000411793 1362 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
RIF1Q5UIP0 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
RIF1Q5UIP0 COPS7A-208ENST00000538410 1610 ntTSL 3 BASIC20.45■□□□□ 0.86
RIF1Q5UIP0 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
RIF1Q5UIP0 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
RIF1Q5UIP0 ATP5D-201ENST00000215375 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
RIF1Q5UIP0 NDUFA1-201ENST00000371437 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
RIF1Q5UIP0 DIMT1-202ENST00000506390 1208 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
RIF1Q5UIP0 NUDT16P1-203ENST00000513809 620 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
RIF1Q5UIP0 AF131216.3-201ENST00000525867 1099 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
RIF1Q5UIP0 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC20.45■□□□□ 0.86
RIF1Q5UIP0 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
RIF1Q5UIP0 PYCR1-216ENST00000619204 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
RIF1Q5UIP0 H3F3A-204ENST00000366816 799 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.44■□□□□ 0.86
RIF1Q5UIP0 KRT18P48-201ENST00000434763 852 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
RIF1Q5UIP0 NDUFA13-203ENST00000503283 825 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
RIF1Q5UIP0 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
RIF1Q5UIP0 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
RIF1Q5UIP0 SLC1A7-201ENST00000371491 1306 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
RIF1Q5UIP0 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
RIF1Q5UIP0 COX4I1-202ENST00000561569 716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
RIF1Q5UIP0 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
RIF1Q5UIP0 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
RIF1Q5UIP0 SRI-203ENST00000419179 1307 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
RIF1Q5UIP0 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
RIF1Q5UIP0 RARRES2-202ENST00000466675 1618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
RIF1Q5UIP0 HMOX1-201ENST00000216117 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
RIF1Q5UIP0 VMO1-204ENST00000441199 741 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
RIF1Q5UIP0 CUTA-210ENST00000488034 769 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
RIF1Q5UIP0 B3GAT3-205ENST00000534026 1120 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
RIF1Q5UIP0 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
RIF1Q5UIP0 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
RIF1Q5UIP0 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
RIF1Q5UIP0 PRTN3-201ENST00000234347 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
RIF1Q5UIP0 IGHV3-73-201ENST00000390636 437 ntAPPRIS P1 BASIC20.43■□□□□ 0.86
RIF1Q5UIP0 SLC25A3P1-201ENST00000443844 931 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
RIF1Q5UIP0 ZNF706-204ENST00000518336 501 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.43■□□□□ 0.86
RIF1Q5UIP0 TPD52L1-207ENST00000527711 999 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
RIF1Q5UIP0 EEF2KMT-206ENST00000587133 873 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.43■□□□□ 0.86
RIF1Q5UIP0 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
RIF1Q5UIP0 SLC25A39-212ENST00000590194 1542 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
RIF1Q5UIP0 HIGD1A-201ENST00000321331 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.2 ms