Protein–RNA interactions for Protein: Q5TIE3

VWA5B1, von Willebrand factor A domain-containing protein 5B1, humanhuman

Predictions only

Length 1,220 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VWA5B1Q5TIE3 PRELID3B-201ENST00000355937 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
VWA5B1Q5TIE3 BCL2L12-201ENST00000246784 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
VWA5B1Q5TIE3 GUK1-207ENST00000366726 873 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC20.56■□□□□ 0.88
VWA5B1Q5TIE3 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
VWA5B1Q5TIE3 FAM219A-202ENST00000379078 770 ntTSL 3 BASIC20.56■□□□□ 0.88
VWA5B1Q5TIE3 FAM219A-205ENST00000379084 893 ntTSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
VWA5B1Q5TIE3 AC019068.1-201ENST00000415226 552 ntTSL 4 BASIC20.56■□□□□ 0.88
VWA5B1Q5TIE3 ZNF302-209ENST00000507959 854 ntTSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
VWA5B1Q5TIE3 ZFPL1-203ENST00000525509 478 ntTSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
VWA5B1Q5TIE3 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
VWA5B1Q5TIE3 IKBKGP1-201ENST00000612193 1073 ntBASIC20.56■□□□□ 0.88
VWA5B1Q5TIE3 AL133516.1-201ENST00000633012 540 ntTSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
VWA5B1Q5TIE3 AP004607.7-201ENST00000527152 1677 ntBASIC20.56■□□□□ 0.88
VWA5B1Q5TIE3 HSD11B1L-218ENST00000581773 1687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
VWA5B1Q5TIE3 DNAAF3-202ENST00000455045 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
VWA5B1Q5TIE3 CAMK2B-207ENST00000358707 1895 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
VWA5B1Q5TIE3 PAX1-202ENST00000444366 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
VWA5B1Q5TIE3 PLK5-205ENST00000642079 1969 ntBASIC20.55■□□□□ 0.88
VWA5B1Q5TIE3 GNA14-201ENST00000341700 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
VWA5B1Q5TIE3 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
VWA5B1Q5TIE3 AP000679.1-202ENST00000319763 2081 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
VWA5B1Q5TIE3 TBL1Y-201ENST00000346432 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
VWA5B1Q5TIE3 TDRD10-202ENST00000368482 2331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
VWA5B1Q5TIE3 TMED4-203ENST00000457408 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
VWA5B1Q5TIE3 CNTNAP3B-202ENST00000341990 2666 ntTSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
VWA5B1Q5TIE3 MMP17-201ENST00000360564 2411 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
VWA5B1Q5TIE3 TMEM178A-201ENST00000281961 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
VWA5B1Q5TIE3 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
VWA5B1Q5TIE3 NKX1-2-201ENST00000451024 3364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
VWA5B1Q5TIE3 CTNNAL1-202ENST00000374593 761 ntTSL 3 BASIC20.55■□□□□ 0.88
VWA5B1Q5TIE3 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
VWA5B1Q5TIE3 CDKN2AIPNL-201ENST00000395009 800 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
VWA5B1Q5TIE3 POLR2H-204ENST00000438240 994 ntTSL 3 BASIC20.55■□□□□ 0.88
VWA5B1Q5TIE3 AC080013.1-202ENST00000465477 674 ntTSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
VWA5B1Q5TIE3 AC093817.1-201ENST00000507296 812 ntTSL 3 BASIC20.55■□□□□ 0.88
VWA5B1Q5TIE3 AC090192.1-201ENST00000517740 490 ntBASIC20.55■□□□□ 0.88
VWA5B1Q5TIE3 LAYN-203ENST00000436913 2590 ntTSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
VWA5B1Q5TIE3 B4GALT5-201ENST00000371711 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
VWA5B1Q5TIE3 ESRRA-202ENST00000405666 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
VWA5B1Q5TIE3 ABLIM2-204ENST00000407564 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
VWA5B1Q5TIE3 ZIM2-208ENST00000629319 2253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
VWA5B1Q5TIE3 PARD3-207ENST00000374788 5996 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
VWA5B1Q5TIE3 SENP5-204ENST00000445299 2491 ntTSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
VWA5B1Q5TIE3 VGF-201ENST00000249330 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
VWA5B1Q5TIE3 LHX6-201ENST00000340587 3457 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
VWA5B1Q5TIE3 CLN8-213ENST00000637156 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
VWA5B1Q5TIE3 IL17RE-206ENST00000454190 2757 ntTSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
VWA5B1Q5TIE3 AP005212.1-201ENST00000581547 1997 ntBASIC20.54■□□□□ 0.88
VWA5B1Q5TIE3 SLC35E4-202ENST00000406566 2081 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
VWA5B1Q5TIE3 FEZF1-203ENST00000442488 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
VWA5B1Q5TIE3 KRTAP5-2-201ENST00000412090 1118 ntAPPRIS P1 BASIC20.54■□□□□ 0.88
VWA5B1Q5TIE3 AC012313.1-204ENST00000444227 462 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
VWA5B1Q5TIE3 ATOX1-207ENST00000524142 749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
VWA5B1Q5TIE3 MIF4GD-211ENST00000580571 952 ntTSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
VWA5B1Q5TIE3 UBE2Q2P2-204ENST00000618775 648 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
VWA5B1Q5TIE3 NAAA-201ENST00000286733 1900 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
VWA5B1Q5TIE3 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
VWA5B1Q5TIE3 NEUROG1-201ENST00000314744 1668 ntAPPRIS P1 BASIC20.54■□□□□ 0.88
VWA5B1Q5TIE3 MAF1-205ENST00000534585 1754 ntTSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
VWA5B1Q5TIE3 RHNO1-204ENST00000489288 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
VWA5B1Q5TIE3 PAQR9-201ENST00000340634 2452 ntAPPRIS P1 BASIC20.53■□□□□ 0.88
VWA5B1Q5TIE3 PRR20B-201ENST00000377930 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
VWA5B1Q5TIE3 PRR20A-201ENST00000377931 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
VWA5B1Q5TIE3 PRR20E-201ENST00000434815 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
VWA5B1Q5TIE3 PRR20D-201ENST00000452123 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
VWA5B1Q5TIE3 SCOC-207ENST00000506597 1838 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
VWA5B1Q5TIE3 PRR20C-201ENST00000544357 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
VWA5B1Q5TIE3 NR1H2-204ENST00000593926 1828 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
VWA5B1Q5TIE3 PRR20C-202ENST00000614894 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
VWA5B1Q5TIE3 HNRNPUL2-201ENST00000301785 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
VWA5B1Q5TIE3 CDCA4-201ENST00000336219 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
VWA5B1Q5TIE3 GP9-201ENST00000307395 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
VWA5B1Q5TIE3 CENPVL3-201ENST00000417339 864 ntAPPRIS P1 BASIC20.53■□□□□ 0.88
VWA5B1Q5TIE3 FIZ1-205ENST00000592585 489 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
VWA5B1Q5TIE3 H2AFB3-201ENST00000615853 591 ntAPPRIS P1 BASIC20.53■□□□□ 0.88
VWA5B1Q5TIE3 AC025164.2-201ENST00000501008 1898 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
VWA5B1Q5TIE3 IRF7-201ENST00000330243 1992 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
VWA5B1Q5TIE3 CNR1-203ENST00000369501 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
VWA5B1Q5TIE3 PIF1-202ENST00000333425 2278 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
VWA5B1Q5TIE3 HDGFL2-208ENST00000616600 2281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
VWA5B1Q5TIE3 UAP1-201ENST00000271469 2377 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
VWA5B1Q5TIE3 FBXL19-207ENST00000565690 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
VWA5B1Q5TIE3 FGFR2-224ENST00000613048 4369 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
VWA5B1Q5TIE3 LGR4-202ENST00000389858 5163 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
VWA5B1Q5TIE3 KCNK12-201ENST00000327876 6227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
VWA5B1Q5TIE3 SPI1-202ENST00000378538 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
VWA5B1Q5TIE3 DENND4B-201ENST00000361217 5706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
VWA5B1Q5TIE3 BAZ1A-202ENST00000360310 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
VWA5B1Q5TIE3 SUSD1-204ENST00000374270 3124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
VWA5B1Q5TIE3 CXCL16-203ENST00000574412 1668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
VWA5B1Q5TIE3 AC006128.1-201ENST00000624704 1661 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
VWA5B1Q5TIE3 DMWD-202ENST00000377735 3292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
VWA5B1Q5TIE3 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
VWA5B1Q5TIE3 SPATA22-214ENST00000575375 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
VWA5B1Q5TIE3 TRIM15-210ENST00000619857 2217 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
VWA5B1Q5TIE3 GADD45A-201ENST00000370985 803 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
VWA5B1Q5TIE3 CCDC92B-201ENST00000575506 885 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
VWA5B1Q5TIE3 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
VWA5B1Q5TIE3 BRD9-202ENST00000467963 2156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
VWA5B1Q5TIE3 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19 ms