Protein–RNA interactions for Protein: Q5JVS0

HABP4, Intracellular hyaluronan-binding protein 4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 413 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HABP4Q5JVS0 UNKL-202ENST00000301712 1431 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
HABP4Q5JVS0 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
HABP4Q5JVS0 POMC-201ENST00000264708 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
HABP4Q5JVS0 EDARADD-201ENST00000334232 858 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
HABP4Q5JVS0 RAB6A-207ENST00000541588 758 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
HABP4Q5JVS0 AC020922.2-201ENST00000596786 359 ntTSL 4 BASIC22.85■■□□□ 1.25
HABP4Q5JVS0 NAPSA-201ENST00000253719 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
HABP4Q5JVS0 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
HABP4Q5JVS0 KRT8P9-201ENST00000558927 1449 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
HABP4Q5JVS0 ACAT1-201ENST00000265838 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
HABP4Q5JVS0 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
HABP4Q5JVS0 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
HABP4Q5JVS0 LGALS1-201ENST00000215909 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
HABP4Q5JVS0 IPPK-202ENST00000375522 882 ntTSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
HABP4Q5JVS0 PDCD2-202ENST00000392090 936 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
HABP4Q5JVS0 ISOC2-202ENST00000425675 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
HABP4Q5JVS0 OCIAD2-205ENST00000508632 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
HABP4Q5JVS0 TMEM191C-212ENST00000536718 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
HABP4Q5JVS0 LY6L-201ENST00000562505 988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
HABP4Q5JVS0 TMEM191B-203ENST00000613597 366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
HABP4Q5JVS0 FGF8-207ENST00000618991 856 ntTSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
HABP4Q5JVS0 AC105020.6-201ENST00000621523 1217 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
HABP4Q5JVS0 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
HABP4Q5JVS0 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
HABP4Q5JVS0 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
HABP4Q5JVS0 SLC35B2-205ENST00000538577 1909 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
HABP4Q5JVS0 ACY1-215ENST00000636358 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
HABP4Q5JVS0 KCNQ5-205ENST00000370398 6345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
HABP4Q5JVS0 AC025164.2-201ENST00000501008 1898 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
HABP4Q5JVS0 NFKBIL1-201ENST00000376145 1401 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
HABP4Q5JVS0 SMAGP-205ENST00000603864 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
HABP4Q5JVS0 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
HABP4Q5JVS0 AL121761.1-202ENST00000412571 415 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
HABP4Q5JVS0 COX4I1-202ENST00000561569 716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
HABP4Q5JVS0 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
HABP4Q5JVS0 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC22.83■■□□□ 1.25
HABP4Q5JVS0 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC22.83■■□□□ 1.25
HABP4Q5JVS0 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
HABP4Q5JVS0 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.24
HABP4Q5JVS0 YBX1-201ENST00000321358 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
HABP4Q5JVS0 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
HABP4Q5JVS0 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
HABP4Q5JVS0 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
HABP4Q5JVS0 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
HABP4Q5JVS0 UBE2E1-AS1-201ENST00000426702 778 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
HABP4Q5JVS0 UMAD1-202ENST00000463725 559 ntTSL 4 BASIC22.82■■□□□ 1.24
HABP4Q5JVS0 LINC00654-202ENST00000589201 579 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
HABP4Q5JVS0 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
HABP4Q5JVS0 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
HABP4Q5JVS0 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC22.82■■□□□ 1.24
HABP4Q5JVS0 EPS8L1-209ENST00000588359 1407 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
HABP4Q5JVS0 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
HABP4Q5JVS0 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
HABP4Q5JVS0 SCARB1-211ENST00000546215 1597 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
HABP4Q5JVS0 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
HABP4Q5JVS0 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
HABP4Q5JVS0 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
HABP4Q5JVS0 MIEN1-201ENST00000394231 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
HABP4Q5JVS0 KRASP1-201ENST00000407852 552 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
HABP4Q5JVS0 LINC00969-218ENST00000452844 583 ntTSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
HABP4Q5JVS0 LINC00969-221ENST00000457233 1279 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
HABP4Q5JVS0 AC004080.2-201ENST00000523331 556 ntTSL 4 BASIC22.81■■□□□ 1.24
HABP4Q5JVS0 CABP2-204ENST00000636477 941 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
HABP4Q5JVS0 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
HABP4Q5JVS0 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
HABP4Q5JVS0 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
HABP4Q5JVS0 KDM3B-201ENST00000314358 6813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
HABP4Q5JVS0 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
HABP4Q5JVS0 COPS7A-208ENST00000538410 1610 ntTSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
HABP4Q5JVS0 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
HABP4Q5JVS0 AL954642.1-201ENST00000428088 538 ntTSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
HABP4Q5JVS0 THEM4-205ENST00000489410 643 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
HABP4Q5JVS0 MRPL36-202ENST00000505059 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
HABP4Q5JVS0 LTBR-211ENST00000543190 785 ntTSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
HABP4Q5JVS0 TNFRSF12A-206ENST00000575124 1133 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
HABP4Q5JVS0 EEF2KMT-206ENST00000587133 873 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
HABP4Q5JVS0 AL589743.5-201ENST00000616611 1050 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
HABP4Q5JVS0 SPINK2-206ENST00000618802 608 ntTSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
HABP4Q5JVS0 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
HABP4Q5JVS0 VPS29-206ENST00000549578 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
HABP4Q5JVS0 EEF1D-202ENST00000395119 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
HABP4Q5JVS0 TRAF3IP2-AS1-208ENST00000525151 609 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
HABP4Q5JVS0 AC073896.1-201ENST00000549318 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
HABP4Q5JVS0 MCRIP1-204ENST00000570507 765 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
HABP4Q5JVS0 MMP25-AS1-204ENST00000572574 794 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
HABP4Q5JVS0 GRAP-204ENST00000573099 846 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
HABP4Q5JVS0 MCRIP1-208ENST00000575061 618 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
HABP4Q5JVS0 CIRBP-213ENST00000587323 1092 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
HABP4Q5JVS0 SMAGP-204ENST00000603838 816 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
HABP4Q5JVS0 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
HABP4Q5JVS0 KLF1-201ENST00000264834 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
HABP4Q5JVS0 HS2ST1-202ENST00000370551 1585 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
HABP4Q5JVS0 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
HABP4Q5JVS0 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
HABP4Q5JVS0 KRT18P22-201ENST00000402024 1347 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
HABP4Q5JVS0 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
HABP4Q5JVS0 CBWD6-201ENST00000377391 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
HABP4Q5JVS0 EDA-208ENST00000524573 1381 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
HABP4Q5JVS0 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
HABP4Q5JVS0 SIVA1-201ENST00000329967 802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.2 ms