Protein–RNA interactions for Protein: Q5GLZ8

HERC4, Probable E3 ubiquitin-protein ligase HERC4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,057 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERC4Q5GLZ8 NAE1-203ENST00000379463 1909 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
HERC4Q5GLZ8 PAX1-202ENST00000444366 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
HERC4Q5GLZ8 CHN1-203ENST00000409156 1761 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
HERC4Q5GLZ8 AL049796.1-201ENST00000565336 1766 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
HERC4Q5GLZ8 CERS4-208ENST00000559336 1515 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
HERC4Q5GLZ8 ALKBH7-201ENST00000245812 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
HERC4Q5GLZ8 HRASLS-201ENST00000264735 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
HERC4Q5GLZ8 BID-202ENST00000342111 854 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
HERC4Q5GLZ8 GPX1P1-201ENST00000388829 606 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
HERC4Q5GLZ8 POU5F1P4-201ENST00000413175 1085 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
HERC4Q5GLZ8 AC108693.2-201ENST00000492981 303 ntTSL 3 BASIC23.2■■□□□ 1.3
HERC4Q5GLZ8 LINC01976-201ENST00000565120 434 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
HERC4Q5GLZ8 FAM193B-217ENST00000514747 2913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
HERC4Q5GLZ8 CLDN23-201ENST00000519106 2169 ntAPPRIS P1 BASIC23.2■■□□□ 1.3
HERC4Q5GLZ8 DYNC1I1-211ENST00000537881 2146 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
HERC4Q5GLZ8 TUSC3-203ENST00000503731 1498 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
HERC4Q5GLZ8 JPT1-206ENST00000476258 2289 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
HERC4Q5GLZ8 KCNN4-201ENST00000262888 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
HERC4Q5GLZ8 PABPC1L2B-201ENST00000373521 2197 ntAPPRIS P1 BASIC23.19■■□□□ 1.3
HERC4Q5GLZ8 TCF7L1-201ENST00000282111 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
HERC4Q5GLZ8 NAA20-201ENST00000310450 920 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
HERC4Q5GLZ8 CYB5R4-201ENST00000369679 768 ntTSL 3 BASIC23.19■■□□□ 1.3
HERC4Q5GLZ8 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC23.19■■□□□ 1.3
HERC4Q5GLZ8 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
HERC4Q5GLZ8 CCNE1-201ENST00000262643 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
HERC4Q5GLZ8 TMC6-212ENST00000589553 2389 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
HERC4Q5GLZ8 RARRES2-202ENST00000466675 1618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
HERC4Q5GLZ8 SEPT5-209ENST00000438754 2241 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
HERC4Q5GLZ8 ERMP1-202ENST00000339450 5376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
HERC4Q5GLZ8 PHF7-201ENST00000327906 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
HERC4Q5GLZ8 EPHX3-201ENST00000221730 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
HERC4Q5GLZ8 ZNF292-204ENST00000392985 1096 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
HERC4Q5GLZ8 APTR-205ENST00000447009 902 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
HERC4Q5GLZ8 AP006621.1-202ENST00000528982 464 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
HERC4Q5GLZ8 AC142086.2-201ENST00000569753 217 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
HERC4Q5GLZ8 AC110285.4-201ENST00000572590 424 ntTSL 3 BASIC23.18■■□□□ 1.3
HERC4Q5GLZ8 WWOX-218ENST00000627394 894 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
HERC4Q5GLZ8 PARP1-210ENST00000629232 477 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
HERC4Q5GLZ8 APOC3-205ENST00000630701 541 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
HERC4Q5GLZ8 AC093762.3-201ENST00000641918 318 ntAPPRIS P1 BASIC23.18■■□□□ 1.3
HERC4Q5GLZ8 CIZ1-206ENST00000372954 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
HERC4Q5GLZ8 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
HERC4Q5GLZ8 C18orf8-214ENST00000615148 1958 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
HERC4Q5GLZ8 USP48-205ENST00000421625 2818 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
HERC4Q5GLZ8 UBE2J2-201ENST00000347370 2387 ntTSL 3 BASIC23.18■■□□□ 1.3
HERC4Q5GLZ8 DNAJB11-202ENST00000439351 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
HERC4Q5GLZ8 FMR1-201ENST00000218200 4333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
HERC4Q5GLZ8 SH3GL1-206ENST00000598564 2194 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
HERC4Q5GLZ8 TPD52L1-203ENST00000368402 1308 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
HERC4Q5GLZ8 MT3-201ENST00000200691 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
HERC4Q5GLZ8 RAP1B-202ENST00000341355 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.17■■□□□ 1.3
HERC4Q5GLZ8 JDP2-202ENST00000419727 972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
HERC4Q5GLZ8 RPS15-210ENST00000592623 873 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
HERC4Q5GLZ8 CD24-202ENST00000610952 802 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
HERC4Q5GLZ8 EFHD1-201ENST00000264059 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
HERC4Q5GLZ8 GSTM3-202ENST00000361066 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
HERC4Q5GLZ8 AP000547.3-201ENST00000592918 1576 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
HERC4Q5GLZ8 TRIM15-210ENST00000619857 2217 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
HERC4Q5GLZ8 PPCS-203ENST00000372561 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
HERC4Q5GLZ8 TCP11-203ENST00000373974 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
HERC4Q5GLZ8 OAF-201ENST00000328965 2525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
HERC4Q5GLZ8 HNF4A-205ENST00000443598 1603 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
HERC4Q5GLZ8 BCAT2-207ENST00000597011 1579 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
HERC4Q5GLZ8 FMR1-202ENST00000334557 1295 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
HERC4Q5GLZ8 AGAP1-IT1-201ENST00000440498 664 ntTSL 3 BASIC23.16■■□□□ 1.3
HERC4Q5GLZ8 FAM66A-201ENST00000525829 921 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
HERC4Q5GLZ8 WT1-AS_3.1-201ENST00000613262 234 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
HERC4Q5GLZ8 SLC13A3-204ENST00000413164 2008 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
HERC4Q5GLZ8 DNM2-205ENST00000585892 2774 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
HERC4Q5GLZ8 DMRT2-203ENST00000358146 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
HERC4Q5GLZ8 TNIP2-203ENST00000503235 1653 ntTSL 3 BASIC23.16■■□□□ 1.3
HERC4Q5GLZ8 ACADVL-202ENST00000350303 2191 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
HERC4Q5GLZ8 NTN1-201ENST00000173229 5954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
HERC4Q5GLZ8 LGR4-202ENST00000389858 5163 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
HERC4Q5GLZ8 SOX3-201ENST00000370536 2132 ntAPPRIS P1 BASIC23.15■■□□□ 1.3
HERC4Q5GLZ8 INAFM2-202ENST00000638170 3052 ntAPPRIS P1 BASIC23.15■■□□□ 1.3
HERC4Q5GLZ8 DAZAP2-201ENST00000412716 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
HERC4Q5GLZ8 HRASLS5-201ENST00000301790 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
HERC4Q5GLZ8 CFD-201ENST00000327726 1201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
HERC4Q5GLZ8 YBEY-204ENST00000397692 433 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
HERC4Q5GLZ8 KRT19P1-201ENST00000405746 1186 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
HERC4Q5GLZ8 AP000662.2-202ENST00000530595 2790 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
HERC4Q5GLZ8 C1QL4-201ENST00000334221 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
HERC4Q5GLZ8 EPHX3-204ENST00000602233 1805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
HERC4Q5GLZ8 LRCH4-209ENST00000497245 2014 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
HERC4Q5GLZ8 DUX4-204ENST00000569241 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
HERC4Q5GLZ8 SCLY-201ENST00000254663 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
HERC4Q5GLZ8 TMEM178A-201ENST00000281961 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
HERC4Q5GLZ8 S1PR5-204ENST00000617721 1698 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
HERC4Q5GLZ8 FAM160B1-201ENST00000369246 666 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
HERC4Q5GLZ8 ZNF451-202ENST00000370702 458 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
HERC4Q5GLZ8 MIR663A-201ENST00000385250 93 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
HERC4Q5GLZ8 ARF3-202ENST00000447318 1089 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
HERC4Q5GLZ8 SLC7A5P2-201ENST00000553010 536 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
HERC4Q5GLZ8 CENPU-201ENST00000281453 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
HERC4Q5GLZ8 ZNF584-201ENST00000306910 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
HERC4Q5GLZ8 CNR1-203ENST00000369501 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
HERC4Q5GLZ8 PTOV1-212ENST00000599732 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
HERC4Q5GLZ8 HNRNPLL-204ENST00000409328 1908 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
HERC4Q5GLZ8 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.3 ms