Protein–RNA interactions for Protein: Q5BJE1

CCDC178, Coiled-coil domain-containing protein 178, humanhuman

Predictions only

Length 867 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC178Q5BJE1 CHRNA7-203ENST00000454250 2093 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
CCDC178Q5BJE1 PANO1-201ENST00000620120 1680 ntAPPRIS P1 BASIC24.35■■□□□ 1.49
CCDC178Q5BJE1 DUSP28-201ENST00000343217 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
CCDC178Q5BJE1 ZNF644-203ENST00000361321 1253 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
CCDC178Q5BJE1 ASIP-201ENST00000374954 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
CCDC178Q5BJE1 C2orf50-202ENST00000405022 980 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
CCDC178Q5BJE1 CYP2T1P-201ENST00000432607 1285 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
CCDC178Q5BJE1 POLE4-205ENST00000483063 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
CCDC178Q5BJE1 AL121832.2-201ENST00000610979 668 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
CCDC178Q5BJE1 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
CCDC178Q5BJE1 CASP16P-201ENST00000428155 1433 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
CCDC178Q5BJE1 DEDD2-201ENST00000336034 1882 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
CCDC178Q5BJE1 TMEM178A-201ENST00000281961 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
CCDC178Q5BJE1 HENMT1-203ENST00000402983 1696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
CCDC178Q5BJE1 S1PR5-204ENST00000617721 1698 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
CCDC178Q5BJE1 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
CCDC178Q5BJE1 NAGPA-202ENST00000381955 2100 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
CCDC178Q5BJE1 SMCO4-201ENST00000298966 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
CCDC178Q5BJE1 DHRS4-207ENST00000559632 1003 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
CCDC178Q5BJE1 NDUFA6-AS1-207ENST00000595777 833 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
CCDC178Q5BJE1 PTGIR-205ENST00000597185 775 ntTSL 3 BASIC24.34■■□□□ 1.49
CCDC178Q5BJE1 AL050303.2-201ENST00000619798 666 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
CCDC178Q5BJE1 GDF6-203ENST00000621429 1179 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
CCDC178Q5BJE1 AC093762.2-201ENST00000641700 291 ntAPPRIS P1 BASIC24.34■■□□□ 1.49
CCDC178Q5BJE1 SSTR3-202ENST00000617123 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
CCDC178Q5BJE1 CCSAP-201ENST00000284617 5121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
CCDC178Q5BJE1 MREG-201ENST00000263268 1314 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
CCDC178Q5BJE1 DUSP18-205ENST00000404885 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
CCDC178Q5BJE1 MAN2C1-244ENST00000618257 1346 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
CCDC178Q5BJE1 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
CCDC178Q5BJE1 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
CCDC178Q5BJE1 ANKLE2-201ENST00000357997 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
CCDC178Q5BJE1 CD247-201ENST00000362089 1609 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
CCDC178Q5BJE1 HRASLS-201ENST00000264735 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
CCDC178Q5BJE1 AL512625.2-201ENST00000417533 625 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
CCDC178Q5BJE1 PRELID2-204ENST00000505416 738 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC24.33■■□□□ 1.49
CCDC178Q5BJE1 CASP6-205ENST00000505486 538 ntTSL 4 BASIC24.33■■□□□ 1.49
CCDC178Q5BJE1 AC025754.1-201ENST00000507566 407 ntTSL 3 BASIC24.33■■□□□ 1.49
CCDC178Q5BJE1 OAS3-207ENST00000551007 998 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
CCDC178Q5BJE1 AC106738.2-202ENST00000558156 533 ntTSL 4 BASIC24.33■■□□□ 1.49
CCDC178Q5BJE1 TRAPPC3-208ENST00000616074 1114 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
CCDC178Q5BJE1 KLF9-201ENST00000377126 5175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
CCDC178Q5BJE1 SNX21-201ENST00000342644 1506 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
CCDC178Q5BJE1 RELL2-207ENST00000521367 1780 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
CCDC178Q5BJE1 ARSA-205ENST00000453344 1650 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
CCDC178Q5BJE1 CBLN3-201ENST00000267406 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
CCDC178Q5BJE1 GRTP1-203ENST00000375431 1384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
CCDC178Q5BJE1 IGDCC4-201ENST00000352385 6508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
CCDC178Q5BJE1 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
CCDC178Q5BJE1 AC007322.3-201ENST00000426526 701 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
CCDC178Q5BJE1 ARL5A-202ENST00000428992 747 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
CCDC178Q5BJE1 RARRES2P4-201ENST00000514074 484 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
CCDC178Q5BJE1 AF201337.1-201ENST00000520239 748 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
CCDC178Q5BJE1 VIM-AS1-202ENST00000605833 918 ntTSL 3 BASIC24.32■■□□□ 1.48
CCDC178Q5BJE1 RBKS-201ENST00000302188 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
CCDC178Q5BJE1 OTOP1-201ENST00000296358 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
CCDC178Q5BJE1 DR1-201ENST00000370267 1647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
CCDC178Q5BJE1 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
CCDC178Q5BJE1 AC116050.2-201ENST00000612102 1779 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
CCDC178Q5BJE1 RTCA-201ENST00000260563 1534 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
CCDC178Q5BJE1 HOXA11-AS-204ENST00000522674 1549 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
CCDC178Q5BJE1 NTN4-207ENST00000553059 1818 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
CCDC178Q5BJE1 DESI2-201ENST00000263831 859 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
CCDC178Q5BJE1 RNPS1-201ENST00000301730 1276 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
CCDC178Q5BJE1 GPX1P1-201ENST00000388829 606 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
CCDC178Q5BJE1 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
CCDC178Q5BJE1 C4orf48-202ENST00000409860 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
CCDC178Q5BJE1 MAP2K4P1-201ENST00000438453 1195 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
CCDC178Q5BJE1 RAPSN-205ENST00000529341 1408 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
CCDC178Q5BJE1 AC091138.1-202ENST00000578967 457 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
CCDC178Q5BJE1 CIRBP-211ENST00000586773 942 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
CCDC178Q5BJE1 FADS6-204ENST00000614223 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
CCDC178Q5BJE1 FAM66C-208ENST00000541558 2087 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
CCDC178Q5BJE1 VIL1-204ENST00000440053 1454 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
CCDC178Q5BJE1 PDXK-205ENST00000398081 2251 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
CCDC178Q5BJE1 SH3BP2-204ENST00000452765 2265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
CCDC178Q5BJE1 PACSIN3-201ENST00000298838 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
CCDC178Q5BJE1 MAMSTR-202ENST00000356751 1825 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
CCDC178Q5BJE1 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
CCDC178Q5BJE1 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
CCDC178Q5BJE1 FIP1L1-201ENST00000306932 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
CCDC178Q5BJE1 ZIM2-201ENST00000593711 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
CCDC178Q5BJE1 PDE9A-212ENST00000398234 1783 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
CCDC178Q5BJE1 ID1-201ENST00000376105 1233 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
CCDC178Q5BJE1 AC083906.2-201ENST00000511578 360 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
CCDC178Q5BJE1 ZNF696-204ENST00000520333 605 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
CCDC178Q5BJE1 C12orf75-205ENST00000549893 719 ntTSL 3 BASIC24.3■■□□□ 1.48
CCDC178Q5BJE1 CPEB1-AS1-201ENST00000560650 2138 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
CCDC178Q5BJE1 ANAPC11-219ENST00000583839 499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
CCDC178Q5BJE1 GXYLT1P5-201ENST00000614548 1189 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
CCDC178Q5BJE1 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
CCDC178Q5BJE1 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
CCDC178Q5BJE1 FBXW7-202ENST00000281708 4976 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
CCDC178Q5BJE1 ARHGEF25-201ENST00000286494 2552 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
CCDC178Q5BJE1 PABPC1L2A-201ENST00000373519 2237 ntAPPRIS P1 BASIC24.3■■□□□ 1.48
CCDC178Q5BJE1 DTNB-207ENST00000405222 2273 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
CCDC178Q5BJE1 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
CCDC178Q5BJE1 PIGP-203ENST00000399098 972 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
CCDC178Q5BJE1 CIRBP-246ENST00000628979 1043 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
CCDC178Q5BJE1 EXOC3-AS1-202ENST00000623673 1663 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.2 ms