Protein–RNA interactions for Protein: Q53EZ4

CEP55, Centrosomal protein of 55 kDa, humanhuman

Predictions only

Length 464 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CEP55Q53EZ4 PALM-207ENST00000590161 2137 ntTSL 4 BASIC23.51■■□□□ 1.35
CEP55Q53EZ4 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CEP55Q53EZ4 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
CEP55Q53EZ4 CBLN3-201ENST00000267406 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CEP55Q53EZ4 CAPZB-205ENST00000433834 1462 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
CEP55Q53EZ4 PDE9A-212ENST00000398234 1783 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CEP55Q53EZ4 THOC3-201ENST00000265097 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CEP55Q53EZ4 CDV3P1-201ENST00000471403 739 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
CEP55Q53EZ4 SNAP23-210ENST00000564153 775 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
CEP55Q53EZ4 UNC119-201ENST00000301032 1653 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CEP55Q53EZ4 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CEP55Q53EZ4 SPTBN4-203ENST00000392023 2419 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CEP55Q53EZ4 FDXR-219ENST00000583917 1762 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
CEP55Q53EZ4 C10orf91-202ENST00000392630 1846 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
CEP55Q53EZ4 NUF2-208ENST00000524800 1845 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
CEP55Q53EZ4 GNB2-206ENST00000424361 1478 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
CEP55Q53EZ4 PAXIP1-AS1-201ENST00000608317 2256 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
CEP55Q53EZ4 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CEP55Q53EZ4 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
CEP55Q53EZ4 YY1AP1-214ENST00000407221 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
CEP55Q53EZ4 PARN-205ENST00000539279 1557 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
CEP55Q53EZ4 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC23.49■■□□□ 1.35
CEP55Q53EZ4 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CEP55Q53EZ4 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CEP55Q53EZ4 FGFRL1-203ENST00000504138 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CEP55Q53EZ4 S1PR5-204ENST00000617721 1698 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
CEP55Q53EZ4 DESI2-201ENST00000263831 859 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CEP55Q53EZ4 PET117-201ENST00000432901 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CEP55Q53EZ4 PACRGL-206ENST00000502374 1034 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
CEP55Q53EZ4 CASP6-205ENST00000505486 538 ntTSL 4 BASIC23.49■■□□□ 1.35
CEP55Q53EZ4 ULK4P1-204ENST00000565949 721 ntTSL 4 BASIC23.49■■□□□ 1.35
CEP55Q53EZ4 AC018730.2-201ENST00000598623 443 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
CEP55Q53EZ4 WDR88-201ENST00000355868 1718 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
CEP55Q53EZ4 FAM3A-202ENST00000359889 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
CEP55Q53EZ4 TMEM17-201ENST00000335390 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CEP55Q53EZ4 SAC3D1-205ENST00000531072 1362 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
CEP55Q53EZ4 SYNGR2-201ENST00000225777 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CEP55Q53EZ4 AC074212.1-201ENST00000559756 1402 ntTSL 3 BASIC23.49■■□□□ 1.35
CEP55Q53EZ4 BAG4-202ENST00000432471 1943 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CEP55Q53EZ4 ABCG4-204ENST00000615496 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
CEP55Q53EZ4 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CEP55Q53EZ4 RTCA-201ENST00000260563 1534 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CEP55Q53EZ4 MKRN4P-201ENST00000444706 1521 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
CEP55Q53EZ4 RASGRP2-210ENST00000394430 2174 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
CEP55Q53EZ4 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC23.48■■□□□ 1.35
CEP55Q53EZ4 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CEP55Q53EZ4 SMNDC1-201ENST00000369592 1110 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
CEP55Q53EZ4 SAPCD2P1-201ENST00000395413 1184 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
CEP55Q53EZ4 AL138781.1-201ENST00000566567 1274 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
CEP55Q53EZ4 AC007216.1-201ENST00000570197 601 ntTSL 4 BASIC23.48■■□□□ 1.35
CEP55Q53EZ4 PTGIR-205ENST00000597185 775 ntTSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
CEP55Q53EZ4 PFKL-212ENST00000628044 129 ntTSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
CEP55Q53EZ4 DUSP18-205ENST00000404885 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CEP55Q53EZ4 TMEM176B-203ENST00000434545 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CEP55Q53EZ4 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CEP55Q53EZ4 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CEP55Q53EZ4 NTN4-207ENST00000553059 1818 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CEP55Q53EZ4 PAX1-202ENST00000444366 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CEP55Q53EZ4 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CEP55Q53EZ4 GRTP1-201ENST00000326039 1294 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CEP55Q53EZ4 FNDC11-201ENST00000370097 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CEP55Q53EZ4 JDP2-202ENST00000419727 972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CEP55Q53EZ4 DENND3-207ENST00000518347 850 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CEP55Q53EZ4 ATG101-201ENST00000336854 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CEP55Q53EZ4 AUH-202ENST00000375731 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CEP55Q53EZ4 TGIF1-207ENST00000407501 1585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CEP55Q53EZ4 FNDC10-201ENST00000422725 2085 ntAPPRIS P1 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CEP55Q53EZ4 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CEP55Q53EZ4 TMEM178A-201ENST00000281961 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CEP55Q53EZ4 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CEP55Q53EZ4 NOXO1-202ENST00000356120 1539 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CEP55Q53EZ4 SLC2A7-201ENST00000400906 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CEP55Q53EZ4 C4orf48-202ENST00000409860 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CEP55Q53EZ4 AC007322.3-201ENST00000426526 701 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
CEP55Q53EZ4 MPPED1-203ENST00000443721 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
CEP55Q53EZ4 PHB2-213ENST00000546111 858 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
CEP55Q53EZ4 AC010980.2-201ENST00000587099 1412 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
CEP55Q53EZ4 SLC25A39-212ENST00000590194 1542 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
CEP55Q53EZ4 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CEP55Q53EZ4 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
CEP55Q53EZ4 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
CEP55Q53EZ4 DOCK5-208ENST00000481100 2166 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
CEP55Q53EZ4 DPYS-201ENST00000351513 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
CEP55Q53EZ4 MAMSTR-202ENST00000356751 1825 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
CEP55Q53EZ4 GAS8-202ENST00000536122 1687 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
CEP55Q53EZ4 SLC25A24P1-201ENST00000411846 1569 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
CEP55Q53EZ4 SNX21-201ENST00000342644 1506 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CEP55Q53EZ4 XXYLT1-202ENST00000356740 564 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
CEP55Q53EZ4 MAGI2-AS3-209ENST00000448195 774 ntTSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
CEP55Q53EZ4 ZNF263-205ENST00000574253 1139 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
CEP55Q53EZ4 TSC22D3-205ENST00000372390 1812 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CEP55Q53EZ4 GRTP1-202ENST00000375430 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CEP55Q53EZ4 AC116050.2-201ENST00000612102 1779 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
CEP55Q53EZ4 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
CEP55Q53EZ4 PANO1-201ENST00000620120 1680 ntAPPRIS P1 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CEP55Q53EZ4 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CEP55Q53EZ4 NELFE-202ENST00000375429 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CEP55Q53EZ4 LAG3-202ENST00000441671 1576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CEP55Q53EZ4 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CEP55Q53EZ4 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.2 ms