Protein–RNA interactions for Protein: Q52LD8

RFTN2, Raftlin-2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 501 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RFTN2Q52LD8 B3GAT3-202ENST00000531383 2056 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
RFTN2Q52LD8 SUSD1-203ENST00000374264 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
RFTN2Q52LD8 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
RFTN2Q52LD8 FLT1-204ENST00000541932 2969 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
RFTN2Q52LD8 EEF1DP3-203ENST00000566025 782 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
RFTN2Q52LD8 ARHGEF4-202ENST00000355771 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
RFTN2Q52LD8 PKMYT1-201ENST00000262300 2171 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
RFTN2Q52LD8 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
RFTN2Q52LD8 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
RFTN2Q52LD8 SLC25A22-216ENST00000531214 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
RFTN2Q52LD8 FLVCR1-201ENST00000366971 5939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
RFTN2Q52LD8 GRK4-203ENST00000398052 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
RFTN2Q52LD8 FUBP3-201ENST00000319725 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
RFTN2Q52LD8 NTRK3-206ENST00000540489 2145 ntTSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
RFTN2Q52LD8 RASL12-202ENST00000421977 1523 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
RFTN2Q52LD8 ME2-202ENST00000382927 2492 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
RFTN2Q52LD8 FBXL15-202ENST00000369956 2344 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
RFTN2Q52LD8 ZNF773-204ENST00000598770 2019 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
RFTN2Q52LD8 JDP2-201ENST00000267569 1700 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
RFTN2Q52LD8 MON1A-201ENST00000296473 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
RFTN2Q52LD8 TMPO-204ENST00000393053 2374 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
RFTN2Q52LD8 NUDT14-202ENST00000392568 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
RFTN2Q52LD8 AC127029.2-201ENST00000577329 502 ntTSL 3 BASIC19.97■□□□□ 0.79
RFTN2Q52LD8 AC053503.5-201ENST00000601508 636 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
RFTN2Q52LD8 PLEKHG4-201ENST00000360461 6782 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
RFTN2Q52LD8 JAKMIP1-203ENST00000409371 2420 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
RFTN2Q52LD8 DYNC1I1-211ENST00000537881 2146 ntTSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
RFTN2Q52LD8 CELF2-211ENST00000632065 1952 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
RFTN2Q52LD8 LINC01547-202ENST00000397841 2303 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
RFTN2Q52LD8 FSTL3-201ENST00000166139 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
RFTN2Q52LD8 SMIM10L2A-201ENST00000417443 5230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
RFTN2Q52LD8 IRX4-208ENST00000622814 2398 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
RFTN2Q52LD8 RHNO1-204ENST00000489288 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
RFTN2Q52LD8 GABARAPL3-202ENST00000624044 1851 ntBASIC19.96■□□□□ 0.79
RFTN2Q52LD8 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
RFTN2Q52LD8 SP3-208ENST00000640958 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
RFTN2Q52LD8 NAA10-208ENST00000464845 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
RFTN2Q52LD8 LINC00969-219ENST00000453324 1439 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
RFTN2Q52LD8 RPUSD1-202ENST00000561734 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
RFTN2Q52LD8 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
RFTN2Q52LD8 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
RFTN2Q52LD8 STOML2-202ENST00000452248 1296 ntTSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
RFTN2Q52LD8 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
RFTN2Q52LD8 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
RFTN2Q52LD8 AP2S1-203ENST00000593442 636 ntTSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
RFTN2Q52LD8 STOML2-205ENST00000619795 1293 ntTSL 3 BASIC19.96■□□□□ 0.79
RFTN2Q52LD8 PKIB-206ENST00000392490 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
RFTN2Q52LD8 MATN4-204ENST00000372756 2077 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
RFTN2Q52LD8 NXN-201ENST00000336868 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
RFTN2Q52LD8 MFF-207ENST00000409565 1548 ntTSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
RFTN2Q52LD8 PAXIP1-202ENST00000404141 3827 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
RFTN2Q52LD8 MYO1D-213ENST00000583621 1916 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
RFTN2Q52LD8 AP004608.1-201ENST00000531319 1402 ntTSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
RFTN2Q52LD8 PLEKHB1-204ENST00000398494 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
RFTN2Q52LD8 SUMF2-208ENST00000434526 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
RFTN2Q52LD8 CYB5R2-212ENST00000533558 1658 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
RFTN2Q52LD8 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
RFTN2Q52LD8 TPRG1LP1-201ENST00000598702 760 ntBASIC19.95■□□□□ 0.78
RFTN2Q52LD8 SOX21-201ENST00000376945 2778 ntAPPRIS P1 BASIC19.95■□□□□ 0.78
RFTN2Q52LD8 FMR1-208ENST00000440235 4271 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
RFTN2Q52LD8 CTU2-210ENST00000567949 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
RFTN2Q52LD8 PCMT1-205ENST00000464889 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
RFTN2Q52LD8 SNX3-201ENST00000230085 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
RFTN2Q52LD8 AC061975.6-201ENST00000579045 1553 ntBASIC19.95■□□□□ 0.78
RFTN2Q52LD8 PTOV1-212ENST00000599732 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
RFTN2Q52LD8 NR6A1-202ENST00000373584 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
RFTN2Q52LD8 TAF6L-201ENST00000294168 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
RFTN2Q52LD8 DUSP15-201ENST00000278979 1732 ntTSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
RFTN2Q52LD8 SHKBP1-225ENST00000600733 2284 ntTSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
RFTN2Q52LD8 LYSMD2-201ENST00000267838 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
RFTN2Q52LD8 SPOCK3-217ENST00000511269 1768 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
RFTN2Q52LD8 LTC4S-202ENST00000401985 486 ntTSL 3 BASIC19.94■□□□□ 0.78
RFTN2Q52LD8 AL354811.1-201ENST00000610286 706 ntBASIC19.94■□□□□ 0.78
RFTN2Q52LD8 POLR2E-214ENST00000619917 932 ntTSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
RFTN2Q52LD8 SDHAF3-202ENST00000432641 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
RFTN2Q52LD8 CA7-201ENST00000338437 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
RFTN2Q52LD8 NSUN2-206ENST00000506139 2619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
RFTN2Q52LD8 ZFP69B-202ENST00000411995 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
RFTN2Q52LD8 CXCR3-201ENST00000373691 1861 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
RFTN2Q52LD8 TTYH1-202ENST00000376530 1885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
RFTN2Q52LD8 EYA2-202ENST00000327619 2702 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
RFTN2Q52LD8 DGKZ-214ENST00000527911 3337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
RFTN2Q52LD8 SNX32-201ENST00000308342 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
RFTN2Q52LD8 CHRNA3-202ENST00000348639 2030 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
RFTN2Q52LD8 KCNMB4-201ENST00000258111 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
RFTN2Q52LD8 CATSPER2-201ENST00000321596 1820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
RFTN2Q52LD8 HSF4-215ENST00000521374 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
RFTN2Q52LD8 CYP1B1-207ENST00000614273 2174 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
RFTN2Q52LD8 DENND6A-201ENST00000311128 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
RFTN2Q52LD8 DNAAF3-207ENST00000527223 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
RFTN2Q52LD8 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
RFTN2Q52LD8 CHTF8-210ENST00000523421 766 ntTSL 3 BASIC19.93■□□□□ 0.78
RFTN2Q52LD8 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC19.93■□□□□ 0.78
RFTN2Q52LD8 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
RFTN2Q52LD8 CPT2-209ENST00000636935 803 ntTSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
RFTN2Q52LD8 CALY-201ENST00000252939 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
RFTN2Q52LD8 NAA20-203ENST00000398602 1604 ntTSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
RFTN2Q52LD8 EPO-201ENST00000252723 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
RFTN2Q52LD8 CACNA1B-201ENST00000277549 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
RFTN2Q52LD8 CACNA1B-202ENST00000277551 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20 ms