Protein–RNA interactions for Protein: Q495C1

RNF212, Probable E3 SUMO-protein ligase RNF212, humanhuman

Predictions only

Length 297 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNF212Q495C1 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
RNF212Q495C1 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
RNF212Q495C1 SEMA7A-203ENST00000543145 2304 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
RNF212Q495C1 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
RNF212Q495C1 FBXL16-203ENST00000562563 2257 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
RNF212Q495C1 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
RNF212Q495C1 TFEB-211ENST00000420312 1996 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
RNF212Q495C1 PITPNC1-201ENST00000299954 6359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
RNF212Q495C1 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
RNF212Q495C1 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
RNF212Q495C1 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
RNF212Q495C1 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
RNF212Q495C1 LRFN4-201ENST00000309602 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
RNF212Q495C1 MSLN-202ENST00000545450 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
RNF212Q495C1 RBBP7-202ENST00000380084 2036 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
RNF212Q495C1 USP39-203ENST00000409470 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
RNF212Q495C1 IRGQ-205ENST00000602269 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
RNF212Q495C1 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC16.51■□□□□ 0.23
RNF212Q495C1 USP25-204ENST00000400183 5341 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
RNF212Q495C1 TPST2-202ENST00000398110 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
RNF212Q495C1 ZNF771-201ENST00000319296 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
RNF212Q495C1 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
RNF212Q495C1 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
RNF212Q495C1 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
RNF212Q495C1 WDR86-207ENST00000621812 1542 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
RNF212Q495C1 CNTNAP3B-203ENST00000377561 5379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
RNF212Q495C1 SPNS1-204ENST00000352260 1948 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
RNF212Q495C1 ADORA2A-213ENST00000610595 2736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
RNF212Q495C1 SUSD1-204ENST00000374270 3124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
RNF212Q495C1 FBXL3-201ENST00000355619 3503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
RNF212Q495C1 PABPC4-204ENST00000372862 2470 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
RNF212Q495C1 KAZN-203ENST00000376030 6030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
RNF212Q495C1 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
RNF212Q495C1 ZNF37BP-201ENST00000435805 1695 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
RNF212Q495C1 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
RNF212Q495C1 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
RNF212Q495C1 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
RNF212Q495C1 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
RNF212Q495C1 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
RNF212Q495C1 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
RNF212Q495C1 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
RNF212Q495C1 E4F1-206ENST00000565090 2028 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
RNF212Q495C1 UCHL5-205ENST00000367454 1815 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
RNF212Q495C1 TTLL3-209ENST00000426895 2767 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
RNF212Q495C1 RAB4A-205ENST00000618010 2799 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
RNF212Q495C1 MAPKAPK3-208ENST00000621469 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
RNF212Q495C1 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
RNF212Q495C1 ACAA1-202ENST00000333167 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
RNF212Q495C1 AC104581.1-201ENST00000324348 2852 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
RNF212Q495C1 MARK4-210ENST00000620044 2105 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
RNF212Q495C1 MAP3K14-AS1-203ENST00000585780 2475 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
RNF212Q495C1 NEFHP1-201ENST00000412845 2629 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
RNF212Q495C1 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
RNF212Q495C1 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC16.5■□□□□ 0.23
RNF212Q495C1 RNF146-203ENST00000368314 2369 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
RNF212Q495C1 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
RNF212Q495C1 CCNL1-203ENST00000461804 1998 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
RNF212Q495C1 ITGB5-201ENST00000296181 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
RNF212Q495C1 SNX21-212ENST00000491381 1607 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
RNF212Q495C1 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
RNF212Q495C1 CCDC34-201ENST00000317945 2109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
RNF212Q495C1 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
RNF212Q495C1 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
RNF212Q495C1 DIP2A-203ENST00000435722 2760 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
RNF212Q495C1 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
RNF212Q495C1 OBSL1-203ENST00000373876 5503 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
RNF212Q495C1 RTN4RL2-201ENST00000335099 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
RNF212Q495C1 SHANK1-202ENST00000359082 6459 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
RNF212Q495C1 TMEM178A-201ENST00000281961 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
RNF212Q495C1 ZNF12-201ENST00000342651 2921 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
RNF212Q495C1 PRSS23-201ENST00000280258 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
RNF212Q495C1 AC116562.4-201ENST00000641316 2276 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
RNF212Q495C1 SMAD4-201ENST00000342988 8769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
RNF212Q495C1 NOC2LP1-202ENST00000452600 2235 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
RNF212Q495C1 AC073314.1-201ENST00000568729 2216 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
RNF212Q495C1 TTC12-202ENST00000393020 2541 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
RNF212Q495C1 AC007040.2-201ENST00000606025 4170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
RNF212Q495C1 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
RNF212Q495C1 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
RNF212Q495C1 PAX1-202ENST00000444366 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
RNF212Q495C1 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
RNF212Q495C1 TESMIN-201ENST00000255087 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
RNF212Q495C1 MXD3-202ENST00000427908 2269 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
RNF212Q495C1 FUT5-202ENST00000588525 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
RNF212Q495C1 GJB6-203ENST00000400065 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
RNF212Q495C1 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC16.49■□□□□ 0.23
RNF212Q495C1 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
RNF212Q495C1 PCDHAC2-201ENST00000289269 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
RNF212Q495C1 ME3-202ENST00000393324 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
RNF212Q495C1 RBL2-201ENST00000262133 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
RNF212Q495C1 TCERG1L-201ENST00000368642 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
RNF212Q495C1 ME2-216ENST00000639850 2331 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
RNF212Q495C1 CYP1B1-207ENST00000614273 2174 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
RNF212Q495C1 KAT2A-201ENST00000225916 3109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
RNF212Q495C1 FDFT1-210ENST00000525954 1890 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
RNF212Q495C1 CDK17-203ENST00000543119 2442 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
RNF212Q495C1 NEURL3-201ENST00000310865 1710 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
RNF212Q495C1 STIM2-211ENST00000639195 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
RNF212Q495C1 CDCA7L-203ENST00000406877 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
RNF212Q495C1 TMEM179-201ENST00000341595 2513 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.7 ms