Protein–RNA interactions for Protein: Q3LI58

KRTAP21-1, Keratin-associated protein 21-1, humanhuman

Predictions only

Length 79 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRTAP21-1Q3LI58 AL445433.2-201ENST00000425113 2544 ntTSL 2 BASIC3.19□□□□□ -1.9
KRTAP21-1Q3LI58 SH2B1-216ENST00000618521 2935 ntTSL 1 (best) BASIC3.19□□□□□ -1.9
KRTAP21-1Q3LI58 DMRTA2-201ENST00000404795 3137 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.19□□□□□ -1.9
KRTAP21-1Q3LI58 SPIRE2-201ENST00000378247 3235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC3.19□□□□□ -1.9
KRTAP21-1Q3LI58 XBP1-202ENST00000344347 1131 ntTSL 5 BASIC3.19□□□□□ -1.9
KRTAP21-1Q3LI58 PYY-201ENST00000360085 1053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC3.19□□□□□ -1.9
KRTAP21-1Q3LI58 STYXL1-204ENST00000360591 1127 ntTSL 5 BASIC3.19□□□□□ -1.9
KRTAP21-1Q3LI58 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC3.19□□□□□ -1.9
KRTAP21-1Q3LI58 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.19□□□□□ -1.9
KRTAP21-1Q3LI58 GADD45A-201ENST00000370985 803 ntTSL 1 (best) BASIC3.19□□□□□ -1.9
KRTAP21-1Q3LI58 EIF6-203ENST00000374450 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.19□□□□□ -1.9
KRTAP21-1Q3LI58 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC3.19□□□□□ -1.9
KRTAP21-1Q3LI58 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.19□□□□□ -1.9
KRTAP21-1Q3LI58 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC3.19□□□□□ -1.9
KRTAP21-1Q3LI58 AC026185.1-201ENST00000445748 174 ntBASIC3.19□□□□□ -1.9
KRTAP21-1Q3LI58 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC3.19□□□□□ -1.9
KRTAP21-1Q3LI58 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC3.19□□□□□ -1.9
KRTAP21-1Q3LI58 AC093627.4-202ENST00000479592 591 ntTSL 4 BASIC3.19□□□□□ -1.9
KRTAP21-1Q3LI58 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC3.19□□□□□ -1.9
KRTAP21-1Q3LI58 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC3.19□□□□□ -1.9
KRTAP21-1Q3LI58 BNIP3L-204ENST00000520409 739 ntTSL 2 BASIC3.19□□□□□ -1.9
KRTAP21-1Q3LI58 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC3.19□□□□□ -1.9
KRTAP21-1Q3LI58 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC3.19□□□□□ -1.9
KRTAP21-1Q3LI58 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC3.19□□□□□ -1.9
KRTAP21-1Q3LI58 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC3.19□□□□□ -1.9
KRTAP21-1Q3LI58 PDCD2L-203ENST00000587065 492 ntTSL 3 BASIC3.19□□□□□ -1.9
KRTAP21-1Q3LI58 NEDD4L-225ENST00000589054 1033 ntTSL 3 BASIC3.19□□□□□ -1.9
KRTAP21-1Q3LI58 TRAPPC5-203ENST00000595985 411 ntTSL 3 BASIC3.19□□□□□ -1.9
KRTAP21-1Q3LI58 AC008687.6-201ENST00000596318 630 ntBASIC3.19□□□□□ -1.9
KRTAP21-1Q3LI58 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC3.19□□□□□ -1.9
KRTAP21-1Q3LI58 AL109923.1-201ENST00000618799 583 ntBASIC3.19□□□□□ -1.9
KRTAP21-1Q3LI58 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC3.19□□□□□ -1.9
KRTAP21-1Q3LI58 AL121906.2-201ENST00000621597 723 ntBASIC3.19□□□□□ -1.9
KRTAP21-1Q3LI58 AL831711.1-201ENST00000636824 569 ntTSL 4 BASIC3.19□□□□□ -1.9
KRTAP21-1Q3LI58 AL032819.3-201ENST00000640283 925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.19□□□□□ -1.9
KRTAP21-1Q3LI58 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.19□□□□□ -1.9
KRTAP21-1Q3LI58 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.19□□□□□ -1.9
KRTAP21-1Q3LI58 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.19□□□□□ -1.9
KRTAP21-1Q3LI58 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.19□□□□□ -1.9
KRTAP21-1Q3LI58 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC3.19□□□□□ -1.9
KRTAP21-1Q3LI58 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC3.19□□□□□ -1.9
KRTAP21-1Q3LI58 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC3.19□□□□□ -1.9
KRTAP21-1Q3LI58 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.19□□□□□ -1.9
KRTAP21-1Q3LI58 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC3.19□□□□□ -1.9
KRTAP21-1Q3LI58 GCGR-202ENST00000570996 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC3.19□□□□□ -1.9
KRTAP21-1Q3LI58 NBL1-209ENST00000548815 1953 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC3.19□□□□□ -1.9
KRTAP21-1Q3LI58 AP005212.1-201ENST00000581547 1997 ntBASIC3.19□□□□□ -1.9
KRTAP21-1Q3LI58 SLC44A3-203ENST00000446120 2094 ntTSL 2 BASIC3.19□□□□□ -1.9
KRTAP21-1Q3LI58 ZNF800-208ENST00000619291 2099 ntTSL 5 BASIC3.19□□□□□ -1.9
KRTAP21-1Q3LI58 DMRT3-201ENST00000190165 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.19□□□□□ -1.9
KRTAP21-1Q3LI58 TOLLIP-201ENST00000263646 2283 ntTSL 5 BASIC3.19□□□□□ -1.9
KRTAP21-1Q3LI58 NGEF-202ENST00000373552 2286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.19□□□□□ -1.9
KRTAP21-1Q3LI58 DVL3-203ENST00000431765 2294 ntTSL 5 BASIC3.19□□□□□ -1.9
KRTAP21-1Q3LI58 UQCC3-202ENST00000531323 2288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC3.19□□□□□ -1.9
KRTAP21-1Q3LI58 AC093503.3-201ENST00000624917 2352 ntBASIC3.19□□□□□ -1.9
KRTAP21-1Q3LI58 ICA1-206ENST00000402384 2458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC3.19□□□□□ -1.9
KRTAP21-1Q3LI58 PRKCB-202ENST00000321728 2689 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC3.19□□□□□ -1.9
KRTAP21-1Q3LI58 EVX1-202ENST00000496902 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.19□□□□□ -1.9
KRTAP21-1Q3LI58 CDCA7L-203ENST00000406877 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.19□□□□□ -1.9
KRTAP21-1Q3LI58 ADAM33-203ENST00000379861 3674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.19□□□□□ -1.9
KRTAP21-1Q3LI58 RAB8A-201ENST00000300935 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.19□□□□□ -1.9
KRTAP21-1Q3LI58 C16orf45-201ENST00000300006 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.19□□□□□ -1.9
KRTAP21-1Q3LI58 TCAF2-203ENST00000425618 2448 ntTSL 2 BASIC3.19□□□□□ -1.9
KRTAP21-1Q3LI58 FAM109B-201ENST00000321753 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.19□□□□□ -1.9
KRTAP21-1Q3LI58 ZDHHC8P1-204ENST00000433168 2309 ntTSL 2 BASIC3.19□□□□□ -1.9
KRTAP21-1Q3LI58 ELN-207ENST00000380562 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.19□□□□□ -1.9
KRTAP21-1Q3LI58 HMOX2-208ENST00000570646 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.19□□□□□ -1.9
KRTAP21-1Q3LI58 IKBKG-207ENST00000611071 2103 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.19□□□□□ -1.9
KRTAP21-1Q3LI58 KLF2-201ENST00000248071 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.19□□□□□ -1.9
KRTAP21-1Q3LI58 SLC16A3-221ENST00000617373 2048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.19□□□□□ -1.9
KRTAP21-1Q3LI58 CPQ-201ENST00000220763 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.19□□□□□ -1.9
KRTAP21-1Q3LI58 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC3.19□□□□□ -1.9
KRTAP21-1Q3LI58 AC084757.3-201ENST00000558061 1943 ntTSL 3 BASIC3.19□□□□□ -1.9
KRTAP21-1Q3LI58 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.19□□□□□ -1.9
KRTAP21-1Q3LI58 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.19□□□□□ -1.9
KRTAP21-1Q3LI58 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC3.19□□□□□ -1.9
KRTAP21-1Q3LI58 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC3.19□□□□□ -1.9
KRTAP21-1Q3LI58 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC3.19□□□□□ -1.9
KRTAP21-1Q3LI58 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC3.19□□□□□ -1.9
KRTAP21-1Q3LI58 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC3.19□□□□□ -1.9
KRTAP21-1Q3LI58 TMEM41B-207ENST00000611268 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.19□□□□□ -1.9
KRTAP21-1Q3LI58 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC3.19□□□□□ -1.9
KRTAP21-1Q3LI58 GSTM4-201ENST00000326729 1321 ntTSL 1 (best) BASIC3.19□□□□□ -1.9
KRTAP21-1Q3LI58 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC3.19□□□□□ -1.9
KRTAP21-1Q3LI58 SNX14-210ENST00000505648 3193 ntTSL 2 BASIC3.18□□□□□ -1.9
KRTAP21-1Q3LI58 EIF3C-211ENST00000566866 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.18□□□□□ -1.9
KRTAP21-1Q3LI58 EML2-203ENST00000536630 2791 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC3.18□□□□□ -1.9
KRTAP21-1Q3LI58 DNAJB5-201ENST00000312316 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.18□□□□□ -1.9
KRTAP21-1Q3LI58 KRT15-203ENST00000393976 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.18□□□□□ -1.9
KRTAP21-1Q3LI58 UMOD-203ENST00000396138 2399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.18□□□□□ -1.9
KRTAP21-1Q3LI58 PARP16-202ENST00000444347 2352 ntTSL 2 BASIC3.18□□□□□ -1.9
KRTAP21-1Q3LI58 KRT6C-201ENST00000252250 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.18□□□□□ -1.9
KRTAP21-1Q3LI58 KRT6B-201ENST00000252252 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.18□□□□□ -1.9
KRTAP21-1Q3LI58 PLEKHB1-203ENST00000398492 2275 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC3.18□□□□□ -1.9
KRTAP21-1Q3LI58 ZNF584-209ENST00000599238 2288 ntTSL 1 (best) BASIC3.18□□□□□ -1.9
KRTAP21-1Q3LI58 VSX1-202ENST00000376709 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.18□□□□□ -1.9
KRTAP21-1Q3LI58 NBL1-210ENST00000615215 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.18□□□□□ -1.9
KRTAP21-1Q3LI58 C8orf49-201ENST00000525043 1968 ntBASIC3.18□□□□□ -1.9
KRTAP21-1Q3LI58 HS3ST4-201ENST00000331351 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.18□□□□□ -1.9
KRTAP21-1Q3LI58 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC3.18□□□□□ -1.9
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