Protein–RNA interactions for Protein: Q3B726

TWISTNB, DNA-directed RNA polymerase I subunit RPA43, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 338 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TWISTNBQ3B726 RUNDC3B-207ENST00000493037 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
TWISTNBQ3B726 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC26.77■■□□□ 1.88
TWISTNBQ3B726 RITA1-201ENST00000548278 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
TWISTNBQ3B726 BAG4-202ENST00000432471 1943 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
TWISTNBQ3B726 RNH1-222ENST00000533410 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
TWISTNBQ3B726 SSTR3-202ENST00000617123 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
TWISTNBQ3B726 CDCA4-202ENST00000392590 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
TWISTNBQ3B726 DHRS4L2-204ENST00000537912 918 ntTSL 2 BASIC26.77■■□□□ 1.88
TWISTNBQ3B726 DHRS4-207ENST00000559632 1003 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
TWISTNBQ3B726 AC007375.3-201ENST00000600936 2314 ntBASIC26.77■■□□□ 1.88
TWISTNBQ3B726 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
TWISTNBQ3B726 NAE1-203ENST00000379463 1909 ntTSL 2 BASIC26.77■■□□□ 1.88
TWISTNBQ3B726 PUF60-203ENST00000453551 1842 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.88
TWISTNBQ3B726 SNX24-211ENST00000513881 1563 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
TWISTNBQ3B726 LINC01140-202ENST00000467438 2375 ntTSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.87
TWISTNBQ3B726 CFD-201ENST00000327726 1201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
TWISTNBQ3B726 HMX1-202ENST00000506970 651 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
TWISTNBQ3B726 PPP1R14BP3-201ENST00000509033 445 ntBASIC26.76■■□□□ 1.87
TWISTNBQ3B726 TMEM41B-205ENST00000533723 723 ntTSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.87
TWISTNBQ3B726 C12orf75-205ENST00000549893 719 ntTSL 3 BASIC26.76■■□□□ 1.87
TWISTNBQ3B726 ETHE1-205ENST00000600651 1052 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
TWISTNBQ3B726 AL049796.1-201ENST00000565336 1766 ntBASIC26.76■■□□□ 1.87
TWISTNBQ3B726 NAAA-201ENST00000286733 1900 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
TWISTNBQ3B726 STEAP1-201ENST00000297205 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
TWISTNBQ3B726 HRASLS-201ENST00000264735 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
TWISTNBQ3B726 AL591742.1-201ENST00000604433 565 ntBASIC26.75■■□□□ 1.87
TWISTNBQ3B726 DAPK3-202ENST00000545797 2257 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
TWISTNBQ3B726 AC009126.1-201ENST00000501338 2245 ntTSL 2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
TWISTNBQ3B726 YBX3-202ENST00000279550 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
TWISTNBQ3B726 SETD6-202ENST00000310682 2042 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
TWISTNBQ3B726 ADCK2-201ENST00000072869 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
TWISTNBQ3B726 VIL1-204ENST00000440053 1454 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
TWISTNBQ3B726 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
TWISTNBQ3B726 FDXR-219ENST00000583917 1762 ntTSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
TWISTNBQ3B726 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
TWISTNBQ3B726 ATP6AP1-201ENST00000369762 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
TWISTNBQ3B726 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC26.74■■□□□ 1.87
TWISTNBQ3B726 EXOC3-AS1-202ENST00000623673 1663 ntBASIC26.74■■□□□ 1.87
TWISTNBQ3B726 PTPA-214ENST00000423100 988 ntTSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
TWISTNBQ3B726 CYP2T1P-201ENST00000432607 1285 ntBASIC26.74■■□□□ 1.87
TWISTNBQ3B726 AC006970.2-201ENST00000450065 779 ntBASIC26.74■■□□□ 1.87
TWISTNBQ3B726 TK2-208ENST00000545043 1120 ntTSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
TWISTNBQ3B726 VIM-AS1-202ENST00000605833 918 ntTSL 3 BASIC26.74■■□□□ 1.87
TWISTNBQ3B726 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
TWISTNBQ3B726 LAG3-202ENST00000441671 1576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
TWISTNBQ3B726 NOXO1-202ENST00000356120 1539 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
TWISTNBQ3B726 TSC22D3-205ENST00000372390 1812 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
TWISTNBQ3B726 NUF2-208ENST00000524800 1845 ntTSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
TWISTNBQ3B726 RGS20-202ENST00000297313 2104 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
TWISTNBQ3B726 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
TWISTNBQ3B726 GNB4-204ENST00000468623 1360 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
TWISTNBQ3B726 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
TWISTNBQ3B726 THOC3-201ENST00000265097 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
TWISTNBQ3B726 XBP1-202ENST00000344347 1131 ntTSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
TWISTNBQ3B726 C4orf48-201ENST00000409248 433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
TWISTNBQ3B726 MAP2K4P1-201ENST00000438453 1195 ntBASIC26.73■■□□□ 1.87
TWISTNBQ3B726 AC016405.3-201ENST00000607710 860 ntBASIC26.73■■□□□ 1.87
TWISTNBQ3B726 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
TWISTNBQ3B726 GNB2-206ENST00000424361 1478 ntTSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
TWISTNBQ3B726 ZNF669-201ENST00000343381 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
TWISTNBQ3B726 DR1-201ENST00000370267 1647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
TWISTNBQ3B726 PACSIN3-201ENST00000298838 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
TWISTNBQ3B726 SEPT1-201ENST00000321367 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
TWISTNBQ3B726 DUSP28-201ENST00000343217 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
TWISTNBQ3B726 UCHL5-204ENST00000367451 1346 ntTSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
TWISTNBQ3B726 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
TWISTNBQ3B726 CD58-201ENST00000369487 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
TWISTNBQ3B726 CD58-202ENST00000369489 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
TWISTNBQ3B726 EIF5A-205ENST00000419711 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
TWISTNBQ3B726 C19orf81-201ENST00000425202 765 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
TWISTNBQ3B726 ARSA-205ENST00000453344 1650 ntTSL 2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
TWISTNBQ3B726 GAS8-202ENST00000536122 1687 ntTSL 2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
TWISTNBQ3B726 ZNF584-201ENST00000306910 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
TWISTNBQ3B726 GPR108-201ENST00000264080 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
TWISTNBQ3B726 EPHX3-201ENST00000221730 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
TWISTNBQ3B726 IVD-206ENST00000487418 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
TWISTNBQ3B726 GPR27-201ENST00000304411 2447 ntAPPRIS P1 BASIC26.71■■□□□ 1.87
TWISTNBQ3B726 CLN3-240ENST00000631023 1586 ntTSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
TWISTNBQ3B726 PAQR6-205ENST00000368270 1765 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
TWISTNBQ3B726 ACHE-201ENST00000241069 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
TWISTNBQ3B726 MAN2C1-244ENST00000618257 1346 ntTSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
TWISTNBQ3B726 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
TWISTNBQ3B726 UNC93B1-201ENST00000227471 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
TWISTNBQ3B726 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
TWISTNBQ3B726 SQLE-206ENST00000523430 1879 ntTSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
TWISTNBQ3B726 CAPZB-205ENST00000433834 1462 ntTSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
TWISTNBQ3B726 MGST3-205ENST00000367889 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
TWISTNBQ3B726 ARL5A-202ENST00000428992 747 ntTSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
TWISTNBQ3B726 AL162412.1-201ENST00000567129 965 ntBASIC26.71■■□□□ 1.87
TWISTNBQ3B726 AC091138.1-202ENST00000578967 457 ntTSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
TWISTNBQ3B726 GXYLT1P5-201ENST00000614548 1189 ntBASIC26.71■■□□□ 1.87
TWISTNBQ3B726 MYO19-221ENST00000620640 1186 ntTSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
TWISTNBQ3B726 CD247-201ENST00000362089 1609 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
TWISTNBQ3B726 HNRNPLL-204ENST00000409328 1908 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
TWISTNBQ3B726 WDR88-201ENST00000355868 1718 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.87
TWISTNBQ3B726 FIP1L1-201ENST00000306932 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
TWISTNBQ3B726 OIP5-201ENST00000220514 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
TWISTNBQ3B726 FAM47E-204ENST00000510328 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.86
TWISTNBQ3B726 ANAPC11-219ENST00000583839 499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.86
TWISTNBQ3B726 TRAPPC3-208ENST00000616074 1114 ntTSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.2 ms