Protein–RNA interactions for Protein: Q2VPK5

CTU2, Cytoplasmic tRNA 2-thiolation protein 2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 515 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTU2Q2VPK5 ADAM9-203ENST00000466936 2053 ntTSL 2 BASIC19.44■□□□□ 0.7
CTU2Q2VPK5 PLCD1-201ENST00000334661 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
CTU2Q2VPK5 BRICD5-201ENST00000328540 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
CTU2Q2VPK5 SOCS2-201ENST00000340600 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
CTU2Q2VPK5 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC19.43■□□□□ 0.7
CTU2Q2VPK5 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
CTU2Q2VPK5 MIR6821-201ENST00000617625 74 ntBASIC19.43■□□□□ 0.7
CTU2Q2VPK5 PHOSPHO1-201ENST00000310544 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.43■□□□□ 0.7
CTU2Q2VPK5 MFSD7-209ENST00000515118 1556 ntTSL 5 BASIC19.43■□□□□ 0.7
CTU2Q2VPK5 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
CTU2Q2VPK5 C19orf66-201ENST00000253110 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.43■□□□□ 0.7
CTU2Q2VPK5 SMOC2-206ENST00000535039 1875 ntTSL 5 BASIC19.43■□□□□ 0.7
CTU2Q2VPK5 FSTL3-201ENST00000166139 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
CTU2Q2VPK5 CENPU-201ENST00000281453 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
CTU2Q2VPK5 NFIB-207ENST00000397579 3129 ntTSL 5 BASIC19.42■□□□□ 0.7
CTU2Q2VPK5 MSLN-205ENST00000563941 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
CTU2Q2VPK5 HLA-C-201ENST00000376228 1536 ntAPPRIS P2 BASIC19.42■□□□□ 0.7
CTU2Q2VPK5 SENP5-204ENST00000445299 2491 ntTSL 2 BASIC19.42■□□□□ 0.7
CTU2Q2VPK5 TAF15-215ENST00000605844 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
CTU2Q2VPK5 C22orf34-203ENST00000405854 1593 ntTSL 5 BASIC19.42■□□□□ 0.7
CTU2Q2VPK5 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
CTU2Q2VPK5 NXT1-201ENST00000254998 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
CTU2Q2VPK5 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
CTU2Q2VPK5 CRB3-202ENST00000356762 733 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
CTU2Q2VPK5 FAM219A-202ENST00000379078 770 ntTSL 3 BASIC19.42■□□□□ 0.7
CTU2Q2VPK5 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC19.42■□□□□ 0.7
CTU2Q2VPK5 PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 1133 ntTSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
CTU2Q2VPK5 LONRF3-202ENST00000371628 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
CTU2Q2VPK5 CDK18-203ENST00000429964 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
CTU2Q2VPK5 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
CTU2Q2VPK5 CDK13-207ENST00000613626 3099 ntTSL 5 BASIC19.42■□□□□ 0.7
CTU2Q2VPK5 BCKDK-201ENST00000219794 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
CTU2Q2VPK5 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
CTU2Q2VPK5 ZNF511-202ENST00000361518 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
CTU2Q2VPK5 REM2-201ENST00000267396 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
CTU2Q2VPK5 NRP2-206ENST00000417189 2386 ntTSL 2 BASIC19.41■□□□□ 0.7
CTU2Q2VPK5 PCBP4-212ENST00000484633 2009 ntTSL 5 BASIC19.41■□□□□ 0.7
CTU2Q2VPK5 ZNF398-202ENST00000475153 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
CTU2Q2VPK5 ME2-218ENST00000640965 2476 ntTSL 5 BASIC19.41■□□□□ 0.7
CTU2Q2VPK5 SAP30L-201ENST00000297109 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
CTU2Q2VPK5 SLC44A3-203ENST00000446120 2094 ntTSL 2 BASIC19.41■□□□□ 0.7
CTU2Q2VPK5 CBLN2-201ENST00000269503 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
CTU2Q2VPK5 TMEM178A-201ENST00000281961 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
CTU2Q2VPK5 FOSL1-201ENST00000312562 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
CTU2Q2VPK5 NDUFB2-201ENST00000247866 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
CTU2Q2VPK5 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
CTU2Q2VPK5 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
CTU2Q2VPK5 NT5C3AP1-201ENST00000394500 1012 ntBASIC19.41■□□□□ 0.7
CTU2Q2VPK5 C16orf86-201ENST00000403458 1267 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
CTU2Q2VPK5 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
CTU2Q2VPK5 NEBL-AS1-202ENST00000439097 661 ntTSL 2 BASIC19.41■□□□□ 0.7
CTU2Q2VPK5 AL590128.2-201ENST00000442889 415 ntTSL 3 BASIC19.41■□□□□ 0.7
CTU2Q2VPK5 C1QTNF5-203ENST00000530681 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
CTU2Q2VPK5 MRM1-203ENST00000612760 1284 ntTSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
CTU2Q2VPK5 CT47B1-201ENST00000371311 1328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.41■□□□□ 0.7
CTU2Q2VPK5 SCUBE1-201ENST00000290460 2258 ntTSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
CTU2Q2VPK5 GPC1-202ENST00000420138 1835 ntTSL 5 BASIC19.41■□□□□ 0.7
CTU2Q2VPK5 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
CTU2Q2VPK5 SOX2-201ENST00000325404 2513 ntAPPRIS P1 BASIC19.41■□□□□ 0.7
CTU2Q2VPK5 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
CTU2Q2VPK5 BX005040.4-201ENST00000637145 1518 ntBASIC19.41■□□□□ 0.7
CTU2Q2VPK5 SDHAF3-202ENST00000432641 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
CTU2Q2VPK5 SP3-208ENST00000640958 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
CTU2Q2VPK5 TMPRSS5-212ENST00000545579 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
CTU2Q2VPK5 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
CTU2Q2VPK5 SPG7-202ENST00000341316 2288 ntTSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
CTU2Q2VPK5 DNAAF3-202ENST00000455045 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
CTU2Q2VPK5 PYCR3-207ENST00000495276 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
CTU2Q2VPK5 YTHDF3-213ENST00000621820 2363 ntTSL 2 BASIC19.4■□□□□ 0.7
CTU2Q2VPK5 MOSPD3-202ENST00000379527 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.4■□□□□ 0.7
CTU2Q2VPK5 AC123595.1-201ENST00000440769 1046 ntBASIC19.4■□□□□ 0.7
CTU2Q2VPK5 AC012313.1-203ENST00000597980 570 ntTSL 4 BASIC19.4■□□□□ 0.7
CTU2Q2VPK5 TPRG1LP1-201ENST00000598702 760 ntBASIC19.4■□□□□ 0.7
CTU2Q2VPK5 CAMKK2-208ENST00000412367 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
CTU2Q2VPK5 PDXDC1-205ENST00000535621 2048 ntTSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
CTU2Q2VPK5 TPCN2-205ENST00000542467 2000 ntTSL 2 BASIC19.4■□□□□ 0.7
CTU2Q2VPK5 HCN2-201ENST00000251287 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
CTU2Q2VPK5 ESRRA-202ENST00000405666 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
CTU2Q2VPK5 TUBA4A-202ENST00000392088 2499 ntTSL 2 BASIC19.4■□□□□ 0.7
CTU2Q2VPK5 AC009014.1-201ENST00000607574 1667 ntAPPRIS P1 BASIC19.4■□□□□ 0.7
CTU2Q2VPK5 WWTR1-AS1-202ENST00000479752 1700 ntTSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.7
CTU2Q2VPK5 ASL-203ENST00000380839 1765 ntTSL 5 BASIC19.39■□□□□ 0.7
CTU2Q2VPK5 PDCD2-204ENST00000453163 2657 ntTSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.7
CTU2Q2VPK5 NAB2-201ENST00000300131 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.7
CTU2Q2VPK5 TMEM204-202ENST00000566264 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.7
CTU2Q2VPK5 HERC2P8-204ENST00000567073 1988 ntTSL 5 BASIC19.39■□□□□ 0.7
CTU2Q2VPK5 TRMT2A-201ENST00000252136 2964 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.7
CTU2Q2VPK5 TANGO2-202ENST00000398042 2011 ntTSL 2 BASIC19.39■□□□□ 0.69
CTU2Q2VPK5 JMJD4-202ENST00000438896 2502 ntTSL 2 BASIC19.39■□□□□ 0.69
CTU2Q2VPK5 FAM219A-205ENST00000379084 893 ntTSL 5 BASIC19.39■□□□□ 0.69
CTU2Q2VPK5 CDKN2AIPNL-201ENST00000395009 800 ntTSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
CTU2Q2VPK5 VGLL4-208ENST00000424529 1025 ntTSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
CTU2Q2VPK5 BCAP29-209ENST00000465919 942 ntTSL 2 BASIC19.39■□□□□ 0.69
CTU2Q2VPK5 PLD4-205ENST00000553861 667 ntTSL 2 BASIC19.39■□□□□ 0.69
CTU2Q2VPK5 FAM222B-208ENST00000581381 556 ntTSL 4 BASIC19.39■□□□□ 0.69
CTU2Q2VPK5 AC087623.3-201ENST00000607047 1098 ntBASIC19.39■□□□□ 0.69
CTU2Q2VPK5 VPS53-201ENST00000291074 2656 ntTSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
CTU2Q2VPK5 ISLR2-204ENST00000453268 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
CTU2Q2VPK5 LINC00969-219ENST00000453324 1439 ntTSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
CTU2Q2VPK5 OR7E47P-201ENST00000546390 1422 ntBASIC19.39■□□□□ 0.69
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