Protein–RNA interactions for Protein: Q17RB0

RTL8B, Retrotransposon Gag-like protein 8B, humanhuman

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Length 113 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RTL8BQ17RB0 TRIB3-201ENST00000217233 2499 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
RTL8BQ17RB0 MTSS1L-201ENST00000338779 4992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
RTL8BQ17RB0 CNOT6-201ENST00000261951 6176 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
RTL8BQ17RB0 FGFR1-203ENST00000341462 6054 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
RTL8BQ17RB0 NUDT16L1-202ENST00000405142 2040 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
RTL8BQ17RB0 ZC3HAV1L-201ENST00000275766 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
RTL8BQ17RB0 VPS29-206ENST00000549578 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
RTL8BQ17RB0 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
RTL8BQ17RB0 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
RTL8BQ17RB0 ARHGAP24-206ENST00000503995 1273 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
RTL8BQ17RB0 CHTF8-210ENST00000523421 766 ntTSL 3 BASIC16.93■□□□□ 0.3
RTL8BQ17RB0 GLI4-210ENST00000523522 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
RTL8BQ17RB0 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
RTL8BQ17RB0 AC053503.5-201ENST00000601508 636 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
RTL8BQ17RB0 DYRK3-202ENST00000367108 2218 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
RTL8BQ17RB0 TRIM15-210ENST00000619857 2217 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
RTL8BQ17RB0 TTC34-201ENST00000401095 8814 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
RTL8BQ17RB0 LPAR1-201ENST00000358883 2687 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
RTL8BQ17RB0 NOC4L-201ENST00000330579 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
RTL8BQ17RB0 TYMP-202ENST00000395678 1614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
RTL8BQ17RB0 LINC00094-201ENST00000432807 2300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
RTL8BQ17RB0 C14orf79-207ENST00000550614 1912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
RTL8BQ17RB0 TCP11-203ENST00000373974 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
RTL8BQ17RB0 PANO1-201ENST00000620120 1680 ntAPPRIS P1 BASIC16.92■□□□□ 0.3
RTL8BQ17RB0 ITGBL1-206ENST00000618057 2368 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
RTL8BQ17RB0 CASP9-210ENST00000546424 4463 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
RTL8BQ17RB0 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
RTL8BQ17RB0 GNB1-209ENST00000610897 3145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
RTL8BQ17RB0 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.92■□□□□ 0.3
RTL8BQ17RB0 SLAIN1-206ENST00000418532 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
RTL8BQ17RB0 SQLE-206ENST00000523430 1879 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
RTL8BQ17RB0 DUSP7-202ENST00000495880 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
RTL8BQ17RB0 CLDN23-201ENST00000519106 2169 ntAPPRIS P1 BASIC16.92■□□□□ 0.3
RTL8BQ17RB0 DR1-201ENST00000370267 1647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
RTL8BQ17RB0 DACT2-203ENST00000607983 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
RTL8BQ17RB0 TNIP1-205ENST00000518977 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
RTL8BQ17RB0 RARA-201ENST00000254066 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
RTL8BQ17RB0 FAM118B-209ENST00000533050 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
RTL8BQ17RB0 AGO4-201ENST00000373210 7116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
RTL8BQ17RB0 ANAPC13-204ENST00000510994 1840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
RTL8BQ17RB0 S1PR5-204ENST00000617721 1698 ntTSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
RTL8BQ17RB0 JDP2-201ENST00000267569 1700 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
RTL8BQ17RB0 BCAT2-207ENST00000597011 1579 ntTSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
RTL8BQ17RB0 PML-217ENST00000567543 1404 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
RTL8BQ17RB0 AC138649.1-201ENST00000619611 1449 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
RTL8BQ17RB0 PHF12-202ENST00000332830 4759 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
RTL8BQ17RB0 LRRC3C-201ENST00000377924 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.91■□□□□ 0.3
RTL8BQ17RB0 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
RTL8BQ17RB0 CPT2-209ENST00000636935 803 ntTSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
RTL8BQ17RB0 CAMK2B-216ENST00000440254 2097 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
RTL8BQ17RB0 SLC1A5-203ENST00000542575 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
RTL8BQ17RB0 TMEM161A-202ENST00000450333 1930 ntTSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
RTL8BQ17RB0 TXNRD3-204ENST00000640433 1932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
RTL8BQ17RB0 ACOT2-201ENST00000238651 1774 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
RTL8BQ17RB0 RANBP10-201ENST00000317506 5341 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
RTL8BQ17RB0 RANBP10-209ENST00000630626 5305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
RTL8BQ17RB0 OSR2-203ENST00000457907 2126 ntTSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
RTL8BQ17RB0 PAQR4-201ENST00000293978 2644 ntTSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
RTL8BQ17RB0 TRMT2A-204ENST00000439169 2473 ntTSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
RTL8BQ17RB0 ARHGAP23-222ENST00000622683 5964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
RTL8BQ17RB0 EPHA6-202ENST00000470610 2058 ntTSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
RTL8BQ17RB0 DUSP28-201ENST00000343217 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
RTL8BQ17RB0 CTCF-202ENST00000401394 2978 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
RTL8BQ17RB0 FAM91A1-201ENST00000334705 5511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
RTL8BQ17RB0 ADAMTS13-204ENST00000371911 1155 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
RTL8BQ17RB0 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
RTL8BQ17RB0 AC079140.4-201ENST00000507448 529 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
RTL8BQ17RB0 EEF1DP3-203ENST00000566025 782 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
RTL8BQ17RB0 TPRG1LP1-201ENST00000598702 760 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
RTL8BQ17RB0 FP565260.3-201ENST00000612610 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
RTL8BQ17RB0 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
RTL8BQ17RB0 EPHA8-202ENST00000374644 1802 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
RTL8BQ17RB0 KCTD12-201ENST00000377474 6225 ntAPPRIS P1 BASIC16.9■□□□□ 0.3
RTL8BQ17RB0 AP004607.4-201ENST00000530158 1459 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
RTL8BQ17RB0 GJC2-201ENST00000366714 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
RTL8BQ17RB0 FDFT1-210ENST00000525954 1890 ntTSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
RTL8BQ17RB0 DLG3-202ENST00000374355 5074 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
RTL8BQ17RB0 ILKAP-211ENST00000612675 1335 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
RTL8BQ17RB0 SMTNL2-202ENST00000389313 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
RTL8BQ17RB0 MAP7-206ENST00000611373 2317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
RTL8BQ17RB0 CDK5R2-201ENST00000302625 2508 ntAPPRIS P1 BASIC16.9■□□□□ 0.3
RTL8BQ17RB0 TMC7-205ENST00000569532 2738 ntTSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
RTL8BQ17RB0 SPRN-201ENST00000414069 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
RTL8BQ17RB0 CSNK1G3-206ENST00000511130 1356 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.3
RTL8BQ17RB0 RABL2B-206ENST00000395598 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
RTL8BQ17RB0 DENND1A-203ENST00000373624 5010 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
RTL8BQ17RB0 SCOC-207ENST00000506597 1838 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
RTL8BQ17RB0 GMPPA-205ENST00000373917 1630 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
RTL8BQ17RB0 NAA20-203ENST00000398602 1604 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
RTL8BQ17RB0 GALNT10-201ENST00000297107 5961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
RTL8BQ17RB0 AC006128.1-201ENST00000624704 1661 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
RTL8BQ17RB0 POMGNT2-201ENST00000344697 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
RTL8BQ17RB0 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
RTL8BQ17RB0 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
RTL8BQ17RB0 MOSPD3-202ENST00000379527 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
RTL8BQ17RB0 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC16.89■□□□□ 0.29
RTL8BQ17RB0 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
RTL8BQ17RB0 VGLL4-208ENST00000424529 1025 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
RTL8BQ17RB0 AC008175.2-201ENST00000612840 297 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
RTL8BQ17RB0 CMTM4-201ENST00000330687 3414 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
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