Protein–RNA interactions for Protein: Q16828

DUSP6, Dual specificity protein phosphatase 6, humanhuman

Predictions only

Length 381 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DUSP6Q16828 PHOSPHO2-208ENST00000617738 1053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
DUSP6Q16828 TMEM204-201ENST00000253934 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
DUSP6Q16828 PYCR1-216ENST00000619204 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
DUSP6Q16828 FBXO6-201ENST00000376753 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
DUSP6Q16828 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
DUSP6Q16828 CYP21A1P-202ENST00000354927 1481 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
DUSP6Q16828 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
DUSP6Q16828 FAM58A-204ENST00000576892 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
DUSP6Q16828 RBM42-204ENST00000589559 1328 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.1
DUSP6Q16828 GCFC2-207ENST00000470503 1066 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
DUSP6Q16828 RPS20-210ENST00000523936 899 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
DUSP6Q16828 FOXN3-AS1-201ENST00000555562 1077 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
DUSP6Q16828 KLF2-202ENST00000592003 564 ntTSL 3 BASIC21.89■■□□□ 1.09
DUSP6Q16828 C20orf204-205ENST00000636176 961 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
DUSP6Q16828 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
DUSP6Q16828 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
DUSP6Q16828 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
DUSP6Q16828 ABHD1-201ENST00000316470 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
DUSP6Q16828 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC21.89■■□□□ 1.09
DUSP6Q16828 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
DUSP6Q16828 GPSM1-201ENST00000291775 2114 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
DUSP6Q16828 TRIM73-202ENST00000430211 1321 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
DUSP6Q16828 ARRB2-216ENST00000574954 1348 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
DUSP6Q16828 SPATA2L-202ENST00000335360 1001 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
DUSP6Q16828 LYPD1-201ENST00000345008 1033 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
DUSP6Q16828 ISG20-202ENST00000379224 540 ntTSL 3 BASIC21.88■■□□□ 1.09
DUSP6Q16828 LINC01023-201ENST00000606054 436 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
DUSP6Q16828 AC105020.6-201ENST00000621523 1217 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
DUSP6Q16828 MAST1-208ENST00000591495 1496 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
DUSP6Q16828 AC013269.1-201ENST00000409259 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
DUSP6Q16828 TISP43-206ENST00000623376 1653 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
DUSP6Q16828 NFS1-214ENST00000541387 1436 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
DUSP6Q16828 SERPINB6-204ENST00000380529 1370 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
DUSP6Q16828 AL645608.1-202ENST00000417705 1389 ntTSL 3 BASIC21.87■■□□□ 1.09
DUSP6Q16828 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
DUSP6Q16828 RNF180-201ENST00000296615 1727 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
DUSP6Q16828 HPF1-201ENST00000393381 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
DUSP6Q16828 ZFYVE1-202ENST00000394207 1183 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
DUSP6Q16828 AC012618.2-201ENST00000428058 849 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
DUSP6Q16828 PAIP2-208ENST00000511706 468 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
DUSP6Q16828 NUBP2-206ENST00000565134 815 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
DUSP6Q16828 AC009090.2-201ENST00000565829 472 ntTSL 3 BASIC21.87■■□□□ 1.09
DUSP6Q16828 AC233702.5-201ENST00000584107 538 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
DUSP6Q16828 TACO1-201ENST00000258975 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
DUSP6Q16828 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
DUSP6Q16828 IKBIP-203ENST00000393042 1368 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
DUSP6Q16828 MMEL1-206ENST00000502556 1943 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
DUSP6Q16828 SLC1A7-201ENST00000371491 1306 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
DUSP6Q16828 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
DUSP6Q16828 NUF2-208ENST00000524800 1845 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
DUSP6Q16828 TSTD1-202ENST00000368023 574 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
DUSP6Q16828 SPATA25-201ENST00000372519 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
DUSP6Q16828 LINC00708-201ENST00000428165 916 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
DUSP6Q16828 COX4I1-202ENST00000561569 716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
DUSP6Q16828 PTOV1-212ENST00000599732 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
DUSP6Q16828 NSMF-203ENST00000371472 1852 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
DUSP6Q16828 TUSC2-201ENST00000232496 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
DUSP6Q16828 MFSD6L-201ENST00000329805 2188 ntAPPRIS P1 BASIC21.85■■□□□ 1.09
DUSP6Q16828 LEF1-203ENST00000438313 1488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
DUSP6Q16828 TSPAN14-205ENST00000372158 1095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
DUSP6Q16828 BX088651.1-201ENST00000540551 451 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
DUSP6Q16828 MAZ-215ENST00000569978 567 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
DUSP6Q16828 FAM66E-201ENST00000529252 1433 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
DUSP6Q16828 AUNIP-203ENST00000538789 1392 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
DUSP6Q16828 GNB1L-202ENST00000403325 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
DUSP6Q16828 NARF-202ENST00000345415 1487 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
DUSP6Q16828 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
DUSP6Q16828 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
DUSP6Q16828 MADCAM1-201ENST00000215637 1572 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
DUSP6Q16828 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
DUSP6Q16828 AC091729.3-201ENST00000423008 1401 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
DUSP6Q16828 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
DUSP6Q16828 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
DUSP6Q16828 VKORC1-202ENST00000319788 1077 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
DUSP6Q16828 RPS2P55-201ENST00000397318 883 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
DUSP6Q16828 ZNRF2P2-202ENST00000442865 590 ntTSL 4 BASIC21.84■■□□□ 1.09
DUSP6Q16828 MRPL2-207ENST00000487429 905 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
DUSP6Q16828 AC107956.1-201ENST00000494359 873 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
DUSP6Q16828 AC027682.2-201ENST00000563083 336 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
DUSP6Q16828 HAGHL-213ENST00000564545 663 ntTSL 3 BASIC21.84■■□□□ 1.09
DUSP6Q16828 C17orf62-230ENST00000583617 866 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
DUSP6Q16828 CD55-205ENST00000367067 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
DUSP6Q16828 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
DUSP6Q16828 SPHK2-213ENST00000601712 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
DUSP6Q16828 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
DUSP6Q16828 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
DUSP6Q16828 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
DUSP6Q16828 UBE2I-205ENST00000402301 1708 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
DUSP6Q16828 CA7-201ENST00000338437 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
DUSP6Q16828 TRADD-202ENST00000486556 1833 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
DUSP6Q16828 CHRAC1-203ENST00000519533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
DUSP6Q16828 CHRDL2-210ENST00000622063 1691 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
DUSP6Q16828 AC026471.6-201ENST00000622954 1905 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
DUSP6Q16828 ABHD14A-201ENST00000273596 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
DUSP6Q16828 KIAA1522-201ENST00000294521 878 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
DUSP6Q16828 TNFRSF18-204ENST00000486728 727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
DUSP6Q16828 BCL2L10-202ENST00000561198 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
DUSP6Q16828 IRF3-222ENST00000599144 1117 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
DUSP6Q16828 MTDHP1-201ENST00000605323 784 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
DUSP6Q16828 AC010331.1-201ENST00000611423 582 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
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