Protein–RNA interactions for Protein: Q16799

RTN1, Reticulon-1, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RTN1Q16799 AC009086.2-201ENST00000449759 610 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.21■■□□□ 1.47
RTN1Q16799 KLK9-202ENST00000594211 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
RTN1Q16799 AC243732.1-201ENST00000612648 864 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
RTN1Q16799 AC010616.1-201ENST00000597630 2078 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
RTN1Q16799 ZC3HAV1L-201ENST00000275766 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
RTN1Q16799 MAGI2-212ENST00000626691 4599 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
RTN1Q16799 EXOC3-AS1-202ENST00000623673 1663 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
RTN1Q16799 DAPK3-201ENST00000301264 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
RTN1Q16799 TPD52L1-201ENST00000304877 1468 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.47
RTN1Q16799 ALG1-202ENST00000544428 1419 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
RTN1Q16799 PACSIN3-201ENST00000298838 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
RTN1Q16799 EPHX3-204ENST00000602233 1805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
RTN1Q16799 ATPIF1-203ENST00000468425 539 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
RTN1Q16799 SSTR3-202ENST00000617123 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
RTN1Q16799 ACADVL-202ENST00000350303 2191 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
RTN1Q16799 TGFBR1-202ENST00000374994 6516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
RTN1Q16799 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
RTN1Q16799 PCED1A-202ENST00000360652 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
RTN1Q16799 TMC6-212ENST00000589553 2389 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
RTN1Q16799 CEACAM4-201ENST00000221954 1205 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
RTN1Q16799 BCL2L12-201ENST00000246784 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
RTN1Q16799 UQCRFS1P1-201ENST00000435169 820 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
RTN1Q16799 AL845552.2-201ENST00000553301 553 ntTSL 4 BASIC24.19■■□□□ 1.46
RTN1Q16799 LINC01976-201ENST00000565120 434 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
RTN1Q16799 CEACAM4-203ENST00000600925 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
RTN1Q16799 BID-214ENST00000617586 542 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
RTN1Q16799 CERS4-209ENST00000559450 1637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
RTN1Q16799 LINC00605-201ENST00000514902 1558 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
RTN1Q16799 CERS1-202ENST00000542296 1947 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
RTN1Q16799 TMEM129-206ENST00000536901 2172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
RTN1Q16799 CCSAP-201ENST00000284617 5121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
RTN1Q16799 ALDH16A1-202ENST00000455361 2470 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
RTN1Q16799 AVPI1-201ENST00000370626 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
RTN1Q16799 GNB2-206ENST00000424361 1478 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
RTN1Q16799 PHF7-201ENST00000327906 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
RTN1Q16799 C1QL4-201ENST00000334221 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
RTN1Q16799 AL121761.1-202ENST00000412571 415 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
RTN1Q16799 MELTF-AS1-202ENST00000415244 951 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
RTN1Q16799 ZNF717-203ENST00000477374 1169 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
RTN1Q16799 AC011767.1-201ENST00000617410 1153 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
RTN1Q16799 MAPRE3-203ENST00000405074 1801 ntTSL 3 BASIC24.18■■□□□ 1.46
RTN1Q16799 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
RTN1Q16799 RAB28-203ENST00000338176 1787 ntTSL 3 BASIC24.18■■□□□ 1.46
RTN1Q16799 CREB3L3-202ENST00000595923 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
RTN1Q16799 CELF2-211ENST00000632065 1952 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
RTN1Q16799 GJC2-201ENST00000366714 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
RTN1Q16799 AC090360.1-201ENST00000569722 2218 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
RTN1Q16799 KCNQ5-205ENST00000370398 6345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
RTN1Q16799 CAMK2B-207ENST00000358707 1895 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
RTN1Q16799 GATA6-AS1-202ENST00000583490 1788 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
RTN1Q16799 GGTLC1-202ENST00000286890 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
RTN1Q16799 UTF1-201ENST00000304477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
RTN1Q16799 TNFRSF18-201ENST00000328596 851 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
RTN1Q16799 SOCS1-201ENST00000332029 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
RTN1Q16799 TNFRSF18-203ENST00000379268 1179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
RTN1Q16799 DHRS4-202ENST00000397074 785 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
RTN1Q16799 TERF1P5-201ENST00000477545 1207 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
RTN1Q16799 AC037459.4-201ENST00000517384 585 ntTSL 4 BASIC24.17■■□□□ 1.46
RTN1Q16799 C17orf49-202ENST00000546495 996 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
RTN1Q16799 AC092143.4-201ENST00000570217 559 ntTSL 4 BASIC24.17■■□□□ 1.46
RTN1Q16799 AC005697.1-201ENST00000582441 582 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.17■■□□□ 1.46
RTN1Q16799 ZNF561-AS1-205ENST00000588765 579 ntTSL 4 BASIC24.17■■□□□ 1.46
RTN1Q16799 SMARCB1-202ENST00000344921 1728 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
RTN1Q16799 HENMT1-203ENST00000402983 1696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
RTN1Q16799 OAF-201ENST00000328965 2525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
RTN1Q16799 GPR108-201ENST00000264080 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
RTN1Q16799 FASTK-217ENST00000540185 1609 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
RTN1Q16799 GAS2L1P2-201ENST00000436355 1356 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
RTN1Q16799 LINC01184-201ENST00000499346 1380 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
RTN1Q16799 THOC3-201ENST00000265097 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
RTN1Q16799 LAG3-202ENST00000441671 1576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
RTN1Q16799 SCARB1-211ENST00000546215 1597 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
RTN1Q16799 SYT7-201ENST00000263846 4854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
RTN1Q16799 CCDC74A-201ENST00000295171 1543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
RTN1Q16799 CCDC74B-201ENST00000310463 1549 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
RTN1Q16799 AC091799.1-201ENST00000422823 811 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
RTN1Q16799 CMTM8-202ENST00000458535 996 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
RTN1Q16799 RAP1B-220ENST00000539091 977 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
RTN1Q16799 SEPT4-215ENST00000580809 952 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
RTN1Q16799 GPX1-204ENST00000620890 897 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
RTN1Q16799 UBE2J2-201ENST00000347370 2387 ntTSL 3 BASIC24.16■■□□□ 1.46
RTN1Q16799 EEF1D-204ENST00000423316 2378 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
RTN1Q16799 IRAK3-203ENST00000545837 1579 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
RTN1Q16799 BAG4-202ENST00000432471 1943 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
RTN1Q16799 CPNE2-201ENST00000290776 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
RTN1Q16799 E4F1-206ENST00000565090 2028 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
RTN1Q16799 TSC22D3-205ENST00000372390 1812 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
RTN1Q16799 RHOD-201ENST00000308831 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
RTN1Q16799 AP2S1-207ENST00000599990 829 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
RTN1Q16799 TMEM230-210ENST00000612323 1231 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
RTN1Q16799 CD99-212ENST00000624481 1089 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
RTN1Q16799 TRIM2-212ENST00000632856 656 ntTSL 3 BASIC24.15■■□□□ 1.46
RTN1Q16799 AL032819.3-201ENST00000640283 925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
RTN1Q16799 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
RTN1Q16799 EFHD1-201ENST00000264059 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
RTN1Q16799 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
RTN1Q16799 LRCH4-209ENST00000497245 2014 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
RTN1Q16799 GAS8-202ENST00000536122 1687 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
RTN1Q16799 IVD-206ENST00000487418 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
RTN1Q16799 SLC9A3R1-201ENST00000262613 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
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