Protein–RNA interactions for Protein: Q16654

PDK4, [Pyruvate dehydrogenase (acetyl-transferring)] kinase isozyme 4, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 411 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDK4Q16654 PGAM5-203ENST00000498926 2834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.92
PDK4Q16654 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
PDK4Q16654 SERPINF2-201ENST00000324015 2284 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.92
PDK4Q16654 MBD1-216ENST00000587605 1945 ntTSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
PDK4Q16654 COPS7A-222ENST00000626119 1768 ntTSL 3 BASIC20.82■□□□□ 0.92
PDK4Q16654 CHRNA10-204ENST00000534359 1474 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
PDK4Q16654 IL17RE-206ENST00000454190 2757 ntTSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
PDK4Q16654 GFER-201ENST00000248114 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
PDK4Q16654 DDIT4-201ENST00000307365 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
PDK4Q16654 RASGRP1-201ENST00000310803 5023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
PDK4Q16654 RASGRP1-204ENST00000539159 5021 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
PDK4Q16654 B4GALT5-201ENST00000371711 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
PDK4Q16654 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
PDK4Q16654 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
PDK4Q16654 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC20.82■□□□□ 0.92
PDK4Q16654 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC20.82■□□□□ 0.92
PDK4Q16654 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
PDK4Q16654 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC20.82■□□□□ 0.92
PDK4Q16654 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC20.82■□□□□ 0.92
PDK4Q16654 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
PDK4Q16654 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC20.82■□□□□ 0.92
PDK4Q16654 BACE2-201ENST00000328735 2824 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
PDK4Q16654 CD55-205ENST00000367067 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
PDK4Q16654 BRD4-202ENST00000360016 3240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
PDK4Q16654 PANO1-201ENST00000620120 1680 ntAPPRIS P1 BASIC20.82■□□□□ 0.92
PDK4Q16654 AC020907.5-201ENST00000624372 1936 ntBASIC20.82■□□□□ 0.92
PDK4Q16654 PQLC2-201ENST00000375153 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
PDK4Q16654 PON1-201ENST00000222381 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
PDK4Q16654 GRB14-201ENST00000263915 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
PDK4Q16654 TPST2-202ENST00000398110 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
PDK4Q16654 GNB1L-202ENST00000403325 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
PDK4Q16654 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC20.81■□□□□ 0.92
PDK4Q16654 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC20.81■□□□□ 0.92
PDK4Q16654 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC20.81■□□□□ 0.92
PDK4Q16654 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
PDK4Q16654 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC20.81■□□□□ 0.92
PDK4Q16654 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC20.81■□□□□ 0.92
PDK4Q16654 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.81■□□□□ 0.92
PDK4Q16654 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC20.81■□□□□ 0.92
PDK4Q16654 EIPR1-206ENST00000443925 1771 ntTSL 3 BASIC20.81■□□□□ 0.92
PDK4Q16654 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
PDK4Q16654 CDO1-201ENST00000250535 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
PDK4Q16654 SOCS2-206ENST00000549122 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
PDK4Q16654 MAP3K14-AS1-203ENST00000585780 2475 ntTSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
PDK4Q16654 DDX55-205ENST00000538744 1735 ntTSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
PDK4Q16654 C7orf49-213ENST00000617987 1727 ntTSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
PDK4Q16654 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
PDK4Q16654 MGEA5-205ENST00000439817 5043 ntTSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
PDK4Q16654 SYNC-201ENST00000373484 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
PDK4Q16654 HMOX2-218ENST00000619913 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
PDK4Q16654 PKM-215ENST00000565154 2004 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
PDK4Q16654 AC008105.1-201ENST00000587534 2003 ntTSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
PDK4Q16654 SRSF4-201ENST00000373795 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
PDK4Q16654 POLE2-202ENST00000539565 1792 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
PDK4Q16654 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
PDK4Q16654 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
PDK4Q16654 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
PDK4Q16654 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
PDK4Q16654 MYDGF-203ENST00000599630 713 ntTSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
PDK4Q16654 NFIB-207ENST00000397579 3129 ntTSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
PDK4Q16654 GPAA1-202ENST00000361036 1840 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
PDK4Q16654 MAP7D2-203ENST00000443379 2476 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
PDK4Q16654 MAGI2-202ENST00000419488 6800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
PDK4Q16654 AP004607.7-201ENST00000527152 1677 ntBASIC20.8■□□□□ 0.92
PDK4Q16654 SOCS2-201ENST00000340600 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
PDK4Q16654 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
PDK4Q16654 CHD1L-201ENST00000361293 2484 ntTSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
PDK4Q16654 PACSIN3-211ENST00000539589 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
PDK4Q16654 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
PDK4Q16654 FDX2-202ENST00000393708 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
PDK4Q16654 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
PDK4Q16654 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
PDK4Q16654 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
PDK4Q16654 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
PDK4Q16654 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
PDK4Q16654 ZNF419-203ENST00000354197 1569 ntTSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
PDK4Q16654 EYA2-210ENST00000611592 2612 ntTSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
PDK4Q16654 SOX8-201ENST00000293894 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
PDK4Q16654 AC025164.2-201ENST00000501008 1898 ntTSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
PDK4Q16654 NGEF-202ENST00000373552 2286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
PDK4Q16654 FAM189B-201ENST00000350210 2379 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
PDK4Q16654 GTPBP3-222ENST00000600625 2493 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
PDK4Q16654 BCL7A-201ENST00000261822 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
PDK4Q16654 ARHGDIA-201ENST00000269321 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
PDK4Q16654 KANK4-202ENST00000354381 2103 ntTSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
PDK4Q16654 NKX2-1-202ENST00000498187 2338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
PDK4Q16654 TUBA4A-202ENST00000392088 2499 ntTSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
PDK4Q16654 ZNF771-201ENST00000319296 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
PDK4Q16654 CNTNAP3B-212ENST00000617422 2170 ntTSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
PDK4Q16654 CNR1-203ENST00000369501 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
PDK4Q16654 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
PDK4Q16654 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
PDK4Q16654 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC20.78■□□□□ 0.92
PDK4Q16654 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC20.78■□□□□ 0.92
PDK4Q16654 CTAG1A-201ENST00000593606 993 ntTSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
PDK4Q16654 COL15A1-205ENST00000610452 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
PDK4Q16654 DTX3-201ENST00000337737 2029 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
PDK4Q16654 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
PDK4Q16654 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
PDK4Q16654 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
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