Protein–RNA interactions for Protein: Q16647

PTGIS, Prostacyclin synthase, humanhuman

Predictions only

Length 500 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTGISQ16647 AL359182.2-201ENST00000457720 606 ntTSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
PTGISQ16647 FAM66A-201ENST00000525829 921 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
PTGISQ16647 CD44-222ENST00000526025 1052 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
PTGISQ16647 IGFBP6-203ENST00000548547 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
PTGISQ16647 AF274858.3-202ENST00000569906 755 ntTSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
PTGISQ16647 TIMM50-213ENST00000599794 786 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
PTGISQ16647 INO80E-214ENST00000620599 515 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
PTGISQ16647 LINC01140-202ENST00000467438 2375 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
PTGISQ16647 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
PTGISQ16647 QTRT1-201ENST00000250237 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
PTGISQ16647 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
PTGISQ16647 ALG1-202ENST00000544428 1419 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
PTGISQ16647 SMUG1-202ENST00000337581 1571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
PTGISQ16647 SYNGR2-203ENST00000588282 1553 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
PTGISQ16647 SLC35A3-210ENST00000638371 2298 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
PTGISQ16647 MAD2L2-204ENST00000376667 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
PTGISQ16647 AC114730.1-201ENST00000400768 472 ntTSL 4 BASIC23.23■■□□□ 1.31
PTGISQ16647 MMAB-206ENST00000540016 945 ntTSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
PTGISQ16647 AL049874.3-201ENST00000557618 868 ntTSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
PTGISQ16647 PLK5-204ENST00000588430 900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
PTGISQ16647 AC006058.3-201ENST00000606217 1069 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
PTGISQ16647 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
PTGISQ16647 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
PTGISQ16647 MPPED1-203ENST00000443721 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
PTGISQ16647 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
PTGISQ16647 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
PTGISQ16647 RARRES2-202ENST00000466675 1618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
PTGISQ16647 PGF-201ENST00000238607 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
PTGISQ16647 EPHX3-202ENST00000435261 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
PTGISQ16647 PDK3-201ENST00000379162 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
PTGISQ16647 B4GALNT1-202ENST00000418555 1861 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
PTGISQ16647 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
PTGISQ16647 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
PTGISQ16647 THAP7-201ENST00000215742 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
PTGISQ16647 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
PTGISQ16647 FAM72A-203ENST00000367129 676 ntTSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
PTGISQ16647 DUSP23-201ENST00000368107 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
PTGISQ16647 KRTAP5-8-201ENST00000398534 1183 ntAPPRIS P1 BASIC23.22■■□□□ 1.31
PTGISQ16647 LSM12P1-201ENST00000411836 588 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
PTGISQ16647 FAM72A-205ENST00000468509 629 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
PTGISQ16647 AC006252.1-201ENST00000483834 1101 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
PTGISQ16647 LINC01962-201ENST00000513771 411 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
PTGISQ16647 SCARA5-203ENST00000518030 1074 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
PTGISQ16647 AC006435.1-201ENST00000571775 1065 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
PTGISQ16647 AC016588.1-201ENST00000591533 542 ntTSL 4 BASIC23.22■■□□□ 1.31
PTGISQ16647 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
PTGISQ16647 PRAF2-202ENST00000553851 1334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
PTGISQ16647 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
PTGISQ16647 OIP5-AS1-202ENST00000501665 1384 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
PTGISQ16647 CCS-208ENST00000533244 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
PTGISQ16647 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
PTGISQ16647 SNX21-212ENST00000491381 1607 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
PTGISQ16647 LRP5L-203ENST00000444995 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
PTGISQ16647 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
PTGISQ16647 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
PTGISQ16647 GCH1-202ENST00000395514 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
PTGISQ16647 MEIS2-207ENST00000557796 2666 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
PTGISQ16647 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
PTGISQ16647 GCSHP5-201ENST00000443090 522 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
PTGISQ16647 YIF1B-213ENST00000591755 1077 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
PTGISQ16647 ATP6V0E2-211ENST00000606024 893 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
PTGISQ16647 AP006294.2-201ENST00000641667 209 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
PTGISQ16647 PAQR6-205ENST00000368270 1765 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
PTGISQ16647 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
PTGISQ16647 GPR27-201ENST00000304411 2447 ntAPPRIS P1 BASIC23.21■■□□□ 1.31
PTGISQ16647 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
PTGISQ16647 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
PTGISQ16647 DNAJB11-202ENST00000439351 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
PTGISQ16647 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
PTGISQ16647 TBC1D22A-206ENST00000407381 1949 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
PTGISQ16647 SAC3D1-205ENST00000531072 1362 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
PTGISQ16647 SYNE2-201ENST00000341472 1132 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
PTGISQ16647 UPK3B-203ENST00000394849 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
PTGISQ16647 HAGLR-207ENST00000452365 661 ntTSL 4 BASIC23.2■■□□□ 1.3
PTGISQ16647 AC128676.1-201ENST00000454392 318 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
PTGISQ16647 PLEKHB1-216ENST00000543085 632 ntTSL 3 BASIC23.2■■□□□ 1.3
PTGISQ16647 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC23.2■■□□□ 1.3
PTGISQ16647 CDKN1C-204ENST00000440480 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
PTGISQ16647 HLA-C-203ENST00000383329 1554 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
PTGISQ16647 ACSL1-205ENST00000504900 1583 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
PTGISQ16647 IRAK3-203ENST00000545837 1579 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
PTGISQ16647 GAR1-201ENST00000226796 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
PTGISQ16647 ANKRD39-201ENST00000393537 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
PTGISQ16647 CD99P1-203ENST00000431582 602 ntTSL 4 BASIC23.19■■□□□ 1.3
PTGISQ16647 STPG4-207ENST00000445927 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
PTGISQ16647 AC092143.2-201ENST00000554623 985 ntTSL 3 BASIC23.19■■□□□ 1.3
PTGISQ16647 PRKAA1-202ENST00000354209 1918 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
PTGISQ16647 SH2D5-202ENST00000444387 1934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
PTGISQ16647 GFI1-203ENST00000427103 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
PTGISQ16647 TGIF1-207ENST00000407501 1585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.18■■□□□ 1.3
PTGISQ16647 FOXN3-209ENST00000555353 1595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
PTGISQ16647 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
PTGISQ16647 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
PTGISQ16647 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
PTGISQ16647 GSX2-201ENST00000326902 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
PTGISQ16647 RPS14-201ENST00000312037 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
PTGISQ16647 NENF-201ENST00000366988 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
PTGISQ16647 AL158047.1-201ENST00000445918 881 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
PTGISQ16647 AC000035.1-201ENST00000634116 343 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
PTGISQ16647 SLC41A3-202ENST00000346785 1705 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.2 ms