Protein–RNA interactions for Protein: Q16560

SNRNP35, U11/U12 small nuclear ribonucleoprotein 35 kDa protein, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 246 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNRNP35Q16560 TMC6-212ENST00000589553 2389 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
SNRNP35Q16560 EPHX3-204ENST00000602233 1805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
SNRNP35Q16560 UTF1-201ENST00000304477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
SNRNP35Q16560 TNFRSF18-203ENST00000379268 1179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
SNRNP35Q16560 AC037459.4-201ENST00000517384 585 ntTSL 4 BASIC22.6■■□□□ 1.21
SNRNP35Q16560 AC092143.4-201ENST00000570217 559 ntTSL 4 BASIC22.6■■□□□ 1.21
SNRNP35Q16560 SEPT4-215ENST00000580809 952 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
SNRNP35Q16560 AC011767.1-201ENST00000617410 1153 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
SNRNP35Q16560 BID-214ENST00000617586 542 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
SNRNP35Q16560 ZC3HAV1L-201ENST00000275766 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
SNRNP35Q16560 LINC01184-201ENST00000499346 1380 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
SNRNP35Q16560 CERS4-209ENST00000559450 1637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
SNRNP35Q16560 TPD52L1-201ENST00000304877 1468 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
SNRNP35Q16560 CELF2-211ENST00000632065 1952 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
SNRNP35Q16560 GJC2-201ENST00000366714 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
SNRNP35Q16560 C1QL4-201ENST00000334221 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
SNRNP35Q16560 TMEM129-206ENST00000536901 2172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
SNRNP35Q16560 CCDC74A-201ENST00000295171 1543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
SNRNP35Q16560 CCDC74B-201ENST00000310463 1549 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
SNRNP35Q16560 TNFRSF18-201ENST00000328596 851 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
SNRNP35Q16560 SOCS1-201ENST00000332029 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
SNRNP35Q16560 AL121761.1-202ENST00000412571 415 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
SNRNP35Q16560 UQCRFS1P1-201ENST00000435169 820 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
SNRNP35Q16560 ZNF717-203ENST00000477374 1169 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
SNRNP35Q16560 C17orf49-202ENST00000546495 996 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
SNRNP35Q16560 TRIM2-212ENST00000632856 656 ntTSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
SNRNP35Q16560 ALDH16A1-202ENST00000455361 2470 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
SNRNP35Q16560 AC090360.1-201ENST00000569722 2218 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
SNRNP35Q16560 SMARCB1-202ENST00000344921 1728 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
SNRNP35Q16560 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
SNRNP35Q16560 CREB3L3-202ENST00000595923 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
SNRNP35Q16560 THOC3-201ENST00000265097 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
SNRNP35Q16560 PHF7-201ENST00000327906 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
SNRNP35Q16560 RAB28-203ENST00000338176 1787 ntTSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.21
SNRNP35Q16560 CAMK2B-207ENST00000358707 1895 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
SNRNP35Q16560 GPR108-201ENST00000264080 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
SNRNP35Q16560 FASTK-217ENST00000540185 1609 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
SNRNP35Q16560 GGTLC1-202ENST00000286890 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
SNRNP35Q16560 RHOD-201ENST00000308831 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
SNRNP35Q16560 DHRS4-202ENST00000397074 785 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
SNRNP35Q16560 CMTM8-202ENST00000458535 996 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
SNRNP35Q16560 TERF1P5-201ENST00000477545 1207 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
SNRNP35Q16560 AC005697.1-201ENST00000582441 582 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.58■■□□□ 1.21
SNRNP35Q16560 ZNF561-AS1-205ENST00000588765 579 ntTSL 4 BASIC22.58■■□□□ 1.21
SNRNP35Q16560 AL032819.3-201ENST00000640283 925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
SNRNP35Q16560 SCARB1-211ENST00000546215 1597 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
SNRNP35Q16560 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
SNRNP35Q16560 HENMT1-203ENST00000402983 1696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
SNRNP35Q16560 GATA6-AS1-202ENST00000583490 1788 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.2
SNRNP35Q16560 OAF-201ENST00000328965 2525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
SNRNP35Q16560 CPNE2-201ENST00000290776 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
SNRNP35Q16560 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SNRNP35Q16560 ASRGL1-210ENST00000534571 639 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
SNRNP35Q16560 RAP1B-220ENST00000539091 977 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
SNRNP35Q16560 AP2S1-207ENST00000599990 829 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
SNRNP35Q16560 AL137784.2-201ENST00000607332 1000 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
SNRNP35Q16560 TMEM230-210ENST00000612323 1231 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SNRNP35Q16560 GPX1-204ENST00000620890 897 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
SNRNP35Q16560 CD99-212ENST00000624481 1089 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
SNRNP35Q16560 IRAK3-203ENST00000545837 1579 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SNRNP35Q16560 UBE2J2-201ENST00000347370 2387 ntTSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
SNRNP35Q16560 EEF1D-204ENST00000423316 2378 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
SNRNP35Q16560 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SNRNP35Q16560 E4F1-206ENST00000565090 2028 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SNRNP35Q16560 BAG4-202ENST00000432471 1943 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SNRNP35Q16560 MAPRE3-203ENST00000405074 1801 ntTSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
SNRNP35Q16560 CERKL-203ENST00000374969 1330 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SNRNP35Q16560 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
SNRNP35Q16560 ARNTL2-209ENST00000546179 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
SNRNP35Q16560 LAG3-202ENST00000441671 1576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
SNRNP35Q16560 MLNR-201ENST00000218721 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
SNRNP35Q16560 OLFM1-206ENST00000371799 961 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
SNRNP35Q16560 AC004911.1-201ENST00000416316 871 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
SNRNP35Q16560 GRPEL2-202ENST00000416916 1006 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
SNRNP35Q16560 AC091799.1-201ENST00000422823 811 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
SNRNP35Q16560 DUX4L16-201ENST00000555130 1264 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
SNRNP35Q16560 AC243773.2-201ENST00000616341 490 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
SNRNP35Q16560 SLC35A2-211ENST00000634461 533 ntTSL 4 BASIC22.56■■□□□ 1.2
SNRNP35Q16560 IVD-206ENST00000487418 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
SNRNP35Q16560 EFHD1-201ENST00000264059 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
SNRNP35Q16560 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
SNRNP35Q16560 SGTA-201ENST00000221566 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
SNRNP35Q16560 GAS8-202ENST00000536122 1687 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
SNRNP35Q16560 HDAC11-211ENST00000433119 2043 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
SNRNP35Q16560 TSC22D3-205ENST00000372390 1812 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
SNRNP35Q16560 WWTR1-AS1-202ENST00000479752 1700 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
SNRNP35Q16560 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
SNRNP35Q16560 ARL6IP4-205ENST00000412505 818 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
SNRNP35Q16560 AC105001.1-201ENST00000506149 821 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
SNRNP35Q16560 CD44-222ENST00000526025 1052 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
SNRNP35Q16560 DAZAP2-201ENST00000412716 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
SNRNP35Q16560 ALG1-201ENST00000262374 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
SNRNP35Q16560 PKIB-206ENST00000392490 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
SNRNP35Q16560 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
SNRNP35Q16560 ZNF800-208ENST00000619291 2099 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
SNRNP35Q16560 SLC9A3R1-201ENST00000262613 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
SNRNP35Q16560 TUBA1A-201ENST00000295766 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
SNRNP35Q16560 FGF7P6-201ENST00000377614 1890 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
SNRNP35Q16560 DNAJB11-202ENST00000439351 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
SNRNP35Q16560 BX664615.2-202ENST00000639056 1888 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
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