Protein–RNA interactions for Protein: Q16518

RPE65, Retinoid isomerohydrolase, humanhuman

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Length 533 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPE65Q16518 PBX1-209ENST00000485769 834 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
RPE65Q16518 LINC00605-201ENST00000514902 1558 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
RPE65Q16518 TRIM35-203ENST00000521253 1215 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
RPE65Q16518 CAMTA1-216ENST00000557126 486 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
RPE65Q16518 AC027307.1-201ENST00000590252 457 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
RPE65Q16518 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
RPE65Q16518 CHRNA7-203ENST00000454250 2093 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
RPE65Q16518 ZIM2-201ENST00000593711 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
RPE65Q16518 NAGPA-202ENST00000381955 2100 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
RPE65Q16518 GPC1-202ENST00000420138 1835 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
RPE65Q16518 SPIRE2-202ENST00000393062 2172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
RPE65Q16518 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
RPE65Q16518 UNC119-202ENST00000335765 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
RPE65Q16518 PAQR6-205ENST00000368270 1765 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
RPE65Q16518 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
RPE65Q16518 ASIP-201ENST00000374954 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
RPE65Q16518 MPV17L-202ENST00000396385 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
RPE65Q16518 GUSBP6-202ENST00000438529 1198 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
RPE65Q16518 TSPY6P-201ENST00000448518 926 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
RPE65Q16518 AC025754.1-201ENST00000507566 407 ntTSL 3 BASIC20.22■□□□□ 0.83
RPE65Q16518 AC093762.2-201ENST00000641700 291 ntAPPRIS P1 BASIC20.22■□□□□ 0.83
RPE65Q16518 CD247-201ENST00000362089 1609 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
RPE65Q16518 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC20.22■□□□□ 0.83
RPE65Q16518 PDXDC1-205ENST00000535621 2048 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
RPE65Q16518 MAN2C1-244ENST00000618257 1346 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
RPE65Q16518 DEDD2-201ENST00000336034 1882 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
RPE65Q16518 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
RPE65Q16518 FAM3A-202ENST00000359889 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
RPE65Q16518 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
RPE65Q16518 PALM-207ENST00000590161 2137 ntTSL 4 BASIC20.21■□□□□ 0.83
RPE65Q16518 ERLEC1-203ENST00000405123 1756 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
RPE65Q16518 YY1AP1-214ENST00000407221 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
RPE65Q16518 SPTBN4-203ENST00000392023 2419 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
RPE65Q16518 NFS1-201ENST00000306750 738 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
RPE65Q16518 PTPA-214ENST00000423100 988 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
RPE65Q16518 AC093787.1-201ENST00000450396 207 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
RPE65Q16518 RARRES2P4-201ENST00000514074 484 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
RPE65Q16518 NCAPD3-204ENST00000526422 1060 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
RPE65Q16518 UNC119-201ENST00000301032 1653 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
RPE65Q16518 S1PR5-204ENST00000617721 1698 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
RPE65Q16518 ABCG4-204ENST00000615496 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
RPE65Q16518 C7orf49-213ENST00000617987 1727 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
RPE65Q16518 RASGRP2-210ENST00000394430 2174 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
RPE65Q16518 PDE9A-212ENST00000398234 1783 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
RPE65Q16518 SSTR3-202ENST00000617123 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
RPE65Q16518 C10orf91-202ENST00000392630 1846 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
RPE65Q16518 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
RPE65Q16518 CD8B-205ENST00000393761 932 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
RPE65Q16518 C2orf50-202ENST00000405022 980 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
RPE65Q16518 CD8B-206ENST00000431506 692 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
RPE65Q16518 CDV3P1-201ENST00000471403 739 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
RPE65Q16518 AC008443.6-201ENST00000512508 500 ntTSL 4 BASIC20.2■□□□□ 0.82
RPE65Q16518 SCO2-203ENST00000535425 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
RPE65Q16518 CD24-202ENST00000610952 802 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
RPE65Q16518 GAMT-205ENST00000640762 751 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
RPE65Q16518 TMEM17-201ENST00000335390 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
RPE65Q16518 PARN-205ENST00000539279 1557 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
RPE65Q16518 SYNGR2-201ENST00000225777 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
RPE65Q16518 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
RPE65Q16518 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
RPE65Q16518 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
RPE65Q16518 NT5C-201ENST00000245552 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
RPE65Q16518 HAGH-201ENST00000397353 1257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
RPE65Q16518 SLC29A4P1-201ENST00000398760 971 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
RPE65Q16518 AL512625.2-201ENST00000417533 625 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
RPE65Q16518 PET117-201ENST00000432901 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
RPE65Q16518 ZNF148-203ENST00000468369 1025 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
RPE65Q16518 CASP6-205ENST00000505486 538 ntTSL 4 BASIC20.19■□□□□ 0.82
RPE65Q16518 PTGER2-202ENST00000557436 643 ntTSL 3 BASIC20.19■□□□□ 0.82
RPE65Q16518 CIRBP-211ENST00000586773 942 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
RPE65Q16518 THOC3-201ENST00000265097 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
RPE65Q16518 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
RPE65Q16518 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
RPE65Q16518 FDXR-219ENST00000583917 1762 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
RPE65Q16518 DPYS-201ENST00000351513 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
RPE65Q16518 GNB2-206ENST00000424361 1478 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
RPE65Q16518 MPPED1-203ENST00000443721 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
RPE65Q16518 RTCA-201ENST00000260563 1534 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
RPE65Q16518 PAXIP1-AS1-201ENST00000608317 2256 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
RPE65Q16518 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
RPE65Q16518 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
RPE65Q16518 UHRF2-202ENST00000381373 802 ntTSL 3 BASIC20.18■□□□□ 0.82
RPE65Q16518 AL355802.2-201ENST00000402069 882 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
RPE65Q16518 ZCCHC9-204ENST00000438268 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
RPE65Q16518 SNAP23-210ENST00000564153 775 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
RPE65Q16518 FAM21FP-204ENST00000608637 956 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
RPE65Q16518 PABPC1L2A-201ENST00000373519 2237 ntAPPRIS P1 BASIC20.18■□□□□ 0.82
RPE65Q16518 NUF2-208ENST00000524800 1845 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
RPE65Q16518 NTN4-207ENST00000553059 1818 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
RPE65Q16518 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
RPE65Q16518 PAX1-202ENST00000444366 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
RPE65Q16518 CAPZB-205ENST00000433834 1462 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
RPE65Q16518 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
RPE65Q16518 BAG4-202ENST00000432471 1943 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
RPE65Q16518 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
RPE65Q16518 TMEM178A-201ENST00000281961 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
RPE65Q16518 EMC9-206ENST00000560403 872 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
RPE65Q16518 ULK4P1-204ENST00000565949 721 ntTSL 4 BASIC20.17■□□□□ 0.82
RPE65Q16518 CIRBP-214ENST00000587896 1081 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
RPE65Q16518 JUNB-201ENST00000302754 1820 ntAPPRIS P1 BASIC20.17■□□□□ 0.82
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