Protein–RNA interactions for Protein: Q15904

ATP6AP1, V-type proton ATPase subunit S1, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP6AP1Q15904 AL161756.1-202ENST00000359491 1717 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
ATP6AP1Q15904 DOK7-206ENST00000515886 2263 ntTSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
ATP6AP1Q15904 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
ATP6AP1Q15904 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
ATP6AP1Q15904 NXN-201ENST00000336868 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
ATP6AP1Q15904 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
ATP6AP1Q15904 FP700111.2-201ENST00000619190 1892 ntBASIC19.35■□□□□ 0.69
ATP6AP1Q15904 OTUB1-210ENST00000541478 1803 ntTSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
ATP6AP1Q15904 AP3S1-201ENST00000316788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
ATP6AP1Q15904 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
ATP6AP1Q15904 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
ATP6AP1Q15904 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC19.35■□□□□ 0.69
ATP6AP1Q15904 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
ATP6AP1Q15904 ZFP69-202ENST00000372706 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
ATP6AP1Q15904 USP25-202ENST00000285681 5216 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
ATP6AP1Q15904 POLD2-202ENST00000406581 2158 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
ATP6AP1Q15904 HS3ST3A1-201ENST00000284110 2527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
ATP6AP1Q15904 AVPR2-202ENST00000358927 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
ATP6AP1Q15904 PLBD1-201ENST00000240617 2426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
ATP6AP1Q15904 LEFTY2-202ENST00000420304 2085 ntTSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
ATP6AP1Q15904 SYTL1-211ENST00000618673 1712 ntTSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
ATP6AP1Q15904 CYB5R2-212ENST00000533558 1658 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
ATP6AP1Q15904 STARD10-213ENST00000538536 1678 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
ATP6AP1Q15904 ILDR2-207ENST00000529071 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
ATP6AP1Q15904 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
ATP6AP1Q15904 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
ATP6AP1Q15904 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
ATP6AP1Q15904 UPF1-207ENST00000599848 5311 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
ATP6AP1Q15904 SOX4-201ENST00000244745 5852 ntAPPRIS P1 BASIC19.34■□□□□ 0.69
ATP6AP1Q15904 NUP160-203ENST00000526870 1537 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
ATP6AP1Q15904 P2RY2-201ENST00000311131 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
ATP6AP1Q15904 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
ATP6AP1Q15904 CSPG5-201ENST00000264723 4080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
ATP6AP1Q15904 PAIP1-203ENST00000436644 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
ATP6AP1Q15904 DDX59-201ENST00000331314 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
ATP6AP1Q15904 VSTM2A-203ENST00000404951 2521 ntTSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.69
ATP6AP1Q15904 OIP5-AS1-202ENST00000501665 1384 ntTSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.69
ATP6AP1Q15904 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.69
ATP6AP1Q15904 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
ATP6AP1Q15904 PTPN11-202ENST00000392597 1876 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
ATP6AP1Q15904 NTN4-207ENST00000553059 1818 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
ATP6AP1Q15904 PAX1-201ENST00000398485 2838 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.69
ATP6AP1Q15904 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.68
ATP6AP1Q15904 MCRIP1-204ENST00000570507 765 ntTSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.68
ATP6AP1Q15904 MCRIP1-208ENST00000575061 618 ntTSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
ATP6AP1Q15904 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
ATP6AP1Q15904 MMP11-201ENST00000215743 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
ATP6AP1Q15904 SHANK1-203ENST00000391813 4785 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
ATP6AP1Q15904 UBE2I-205ENST00000402301 1708 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
ATP6AP1Q15904 SLC6A7-203ENST00000524041 2431 ntTSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
ATP6AP1Q15904 ITPKB-202ENST00000366784 3146 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
ATP6AP1Q15904 NSUN5-204ENST00000438747 1663 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
ATP6AP1Q15904 CEP78-202ENST00000376597 2618 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
ATP6AP1Q15904 SHROOM1-202ENST00000378676 2352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
ATP6AP1Q15904 SMARCD2-212ENST00000613943 2342 ntTSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
ATP6AP1Q15904 TTYH3-201ENST00000258796 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
ATP6AP1Q15904 FGFR1-241ENST00000619564 5482 ntTSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
ATP6AP1Q15904 LRRC1-202ENST00000370888 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
ATP6AP1Q15904 SLC2A11-202ENST00000316185 1555 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
ATP6AP1Q15904 UBE2Z-201ENST00000360943 3122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
ATP6AP1Q15904 GTF3C5-202ENST00000372097 2406 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
ATP6AP1Q15904 PLSCR3-212ENST00000576201 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
ATP6AP1Q15904 WIPF1-203ENST00000392546 2180 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
ATP6AP1Q15904 PRKCD-202ENST00000394729 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
ATP6AP1Q15904 TMEM151A-201ENST00000327259 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
ATP6AP1Q15904 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
ATP6AP1Q15904 MAFF-202ENST00000407965 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
ATP6AP1Q15904 GNB2-209ENST00000436220 1479 ntTSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
ATP6AP1Q15904 FGFRL1-203ENST00000504138 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
ATP6AP1Q15904 ZNF12-201ENST00000342651 2921 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
ATP6AP1Q15904 C3orf18-203ENST00000426034 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
ATP6AP1Q15904 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
ATP6AP1Q15904 COL13A1-201ENST00000354547 3027 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
ATP6AP1Q15904 OXER1-201ENST00000378661 1781 ntAPPRIS P1 BASIC19.32■□□□□ 0.68
ATP6AP1Q15904 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
ATP6AP1Q15904 SMPD5-201ENST00000528912 1390 ntTSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
ATP6AP1Q15904 ENTPD6-201ENST00000354989 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
ATP6AP1Q15904 CALY-201ENST00000252939 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
ATP6AP1Q15904 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
ATP6AP1Q15904 TMEM11-201ENST00000317635 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
ATP6AP1Q15904 PCDHB12-202ENST00000622978 2093 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
ATP6AP1Q15904 ZBTB7A-201ENST00000322357 5422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
ATP6AP1Q15904 PLSCR3-201ENST00000324822 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
ATP6AP1Q15904 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
ATP6AP1Q15904 CIRBP-225ENST00000589710 1835 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
ATP6AP1Q15904 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
ATP6AP1Q15904 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
ATP6AP1Q15904 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
ATP6AP1Q15904 BRSK1-201ENST00000309383 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
ATP6AP1Q15904 HIBADH-201ENST00000265395 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
ATP6AP1Q15904 KCNH2-201ENST00000262186 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
ATP6AP1Q15904 AC116562.4-201ENST00000641316 2276 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
ATP6AP1Q15904 SMIM10L2A-201ENST00000417443 5230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
ATP6AP1Q15904 FOXL2-201ENST00000330315 2917 ntAPPRIS P1 BASIC19.31■□□□□ 0.68
ATP6AP1Q15904 ACBD4-204ENST00000431281 2026 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
ATP6AP1Q15904 FBXW8-201ENST00000309909 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
ATP6AP1Q15904 AC098818.2-201ENST00000564925 2320 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
ATP6AP1Q15904 RNH1-222ENST00000533410 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
ATP6AP1Q15904 ITGBL1-202ENST00000376180 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
ATP6AP1Q15904 STIM2-211ENST00000639195 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
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