Protein–RNA interactions for Protein: Q15878

CACNA1E, Voltage-dependent R-type calcium channel subunit alpha-1E, humanhuman

Predictions only

Length 2,313 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CACNA1EQ15878 RAC3-201ENST00000306897 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
CACNA1EQ15878 PPP1R14A-202ENST00000347262 637 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
CACNA1EQ15878 OTUB1-203ENST00000428192 1296 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.86
CACNA1EQ15878 GRAMD1B-209ENST00000533341 707 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.86
CACNA1EQ15878 TNNT1-208ENST00000587465 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.86
CACNA1EQ15878 RBM38-203ENST00000356208 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
CACNA1EQ15878 PDE9A-212ENST00000398234 1783 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
CACNA1EQ15878 TPD52L1-201ENST00000304877 1468 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.86
CACNA1EQ15878 NGLY1-204ENST00000396649 2024 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
CACNA1EQ15878 PADI2-201ENST00000375481 1607 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
CACNA1EQ15878 AC012146.1-202ENST00000413077 474 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
CACNA1EQ15878 CNOT8-224ENST00000523698 862 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
CACNA1EQ15878 ABHD1-201ENST00000316470 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
CACNA1EQ15878 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
CACNA1EQ15878 HP1BP3-202ENST00000375000 928 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
CACNA1EQ15878 HPF1-201ENST00000393381 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
CACNA1EQ15878 BAALC-AS1-206ENST00000521383 736 ntTSL 3 BASIC20.38■□□□□ 0.85
CACNA1EQ15878 ASGR1-204ENST00000572879 797 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
CACNA1EQ15878 REXO1L12P-201ENST00000622156 912 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
CACNA1EQ15878 TACO1-201ENST00000258975 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
CACNA1EQ15878 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
CACNA1EQ15878 C16orf59-201ENST00000361837 1662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
CACNA1EQ15878 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
CACNA1EQ15878 HOXA4-202ENST00000428284 1595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
CACNA1EQ15878 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
CACNA1EQ15878 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
CACNA1EQ15878 KRT18P68-201ENST00000392293 1000 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
CACNA1EQ15878 AC105020.6-201ENST00000621523 1217 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
CACNA1EQ15878 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
CACNA1EQ15878 SERPINB6-204ENST00000380529 1370 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
CACNA1EQ15878 PHLDB2-210ENST00000478922 1861 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
CACNA1EQ15878 TMEM204-201ENST00000253934 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
CACNA1EQ15878 AC013269.1-201ENST00000409259 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
CACNA1EQ15878 TISP43-206ENST00000623376 1653 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
CACNA1EQ15878 GORASP1-220ENST00000479927 1345 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
CACNA1EQ15878 PTS-201ENST00000280362 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
CACNA1EQ15878 TPSAB1-201ENST00000338844 1175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
CACNA1EQ15878 RALGPS1-206ENST00000394011 819 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
CACNA1EQ15878 AC073316.3-201ENST00000437354 982 ntTSL 3 BASIC20.37■□□□□ 0.85
CACNA1EQ15878 AC108025.1-201ENST00000453678 1058 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
CACNA1EQ15878 BX088651.1-201ENST00000540551 451 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
CACNA1EQ15878 YPEL3-207ENST00000566134 761 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
CACNA1EQ15878 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
CACNA1EQ15878 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
CACNA1EQ15878 EXTL3-213ENST00000523149 1779 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
CACNA1EQ15878 MTFP1-202ENST00000355143 891 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
CACNA1EQ15878 ADCYAP1-202ENST00000450565 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
CACNA1EQ15878 PPOX-219ENST00000544598 813 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
CACNA1EQ15878 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC20.37■□□□□ 0.85
CACNA1EQ15878 SCARB2-219ENST00000639738 1517 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
CACNA1EQ15878 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
CACNA1EQ15878 SPATA2L-202ENST00000335360 1001 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
CACNA1EQ15878 CNIH4-203ENST00000366858 702 ntTSL 3 BASIC20.36■□□□□ 0.85
CACNA1EQ15878 POMC-202ENST00000380794 1295 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
CACNA1EQ15878 HES2-205ENST00000487437 968 ntTSL 3 BASIC20.36■□□□□ 0.85
CACNA1EQ15878 AP001972.3-201ENST00000530792 495 ntTSL 3 BASIC20.36■□□□□ 0.85
CACNA1EQ15878 C20orf204-205ENST00000636176 961 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
CACNA1EQ15878 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
CACNA1EQ15878 NIPAL4-202ENST00000435489 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
CACNA1EQ15878 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
CACNA1EQ15878 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
CACNA1EQ15878 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
CACNA1EQ15878 C12orf76-203ENST00000546651 1755 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
CACNA1EQ15878 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
CACNA1EQ15878 PRTN3-201ENST00000234347 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
CACNA1EQ15878 REXO2-201ENST00000265881 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
CACNA1EQ15878 N4BP2L1-203ENST00000380133 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
CACNA1EQ15878 AL162258.1-201ENST00000497086 753 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
CACNA1EQ15878 DIMT1-202ENST00000506390 1208 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
CACNA1EQ15878 REXO2-208ENST00000539754 791 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
CACNA1EQ15878 REXO2-216ENST00000544196 452 ntTSL 3 BASIC20.36■□□□□ 0.85
CACNA1EQ15878 AC122129.2-201ENST00000583598 466 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
CACNA1EQ15878 IMPA2-208ENST00000589238 923 ntTSL 3 BASIC20.36■□□□□ 0.85
CACNA1EQ15878 PTCRA-204ENST00000616441 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
CACNA1EQ15878 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC20.35■□□□□ 0.85
CACNA1EQ15878 AC093620.1-201ENST00000342963 583 ntTSL 3 BASIC20.35■□□□□ 0.85
CACNA1EQ15878 PLEKHB2-203ENST00000404460 1167 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
CACNA1EQ15878 GPX1-202ENST00000419783 1146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
CACNA1EQ15878 NDUFAF3-204ENST00000451378 774 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
CACNA1EQ15878 AC133681.1-201ENST00000465482 601 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
CACNA1EQ15878 NDUFS6-202ENST00000469176 550 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
CACNA1EQ15878 ZNF529-AS1-202ENST00000475219 1033 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
CACNA1EQ15878 AC073896.1-201ENST00000549318 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
CACNA1EQ15878 MTDHP1-201ENST00000605323 784 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
CACNA1EQ15878 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
CACNA1EQ15878 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
CACNA1EQ15878 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
CACNA1EQ15878 CDC123-201ENST00000281141 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
CACNA1EQ15878 SPOCK2-209ENST00000536168 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
CACNA1EQ15878 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
CACNA1EQ15878 PXYLP1-203ENST00000502783 2066 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
CACNA1EQ15878 HSF2BP-201ENST00000291560 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
CACNA1EQ15878 GNB1L-202ENST00000403325 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
CACNA1EQ15878 LINC00708-201ENST00000428165 916 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
CACNA1EQ15878 SFXN1-203ENST00000502393 637 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
CACNA1EQ15878 AC011446.2-202ENST00000592882 756 ntTSL 3 BASIC20.35■□□□□ 0.85
CACNA1EQ15878 GCH1-205ENST00000536224 1805 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
CACNA1EQ15878 TERF1-202ENST00000276603 1677 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
CACNA1EQ15878 MADCAM1-201ENST00000215637 1572 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
CACNA1EQ15878 FBL-201ENST00000221801 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
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