Protein–RNA interactions for Protein: Q15822

CHRNA2, Neuronal acetylcholine receptor subunit alpha-2, humanhuman

Predictions only

Length 529 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHRNA2Q15822 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC27.92■■■□□ 2.06
CHRNA2Q15822 EXTL3-213ENST00000523149 1779 ntTSL 5 BASIC27.92■■■□□ 2.06
CHRNA2Q15822 NDUFV3-202ENST00000354250 1575 ntTSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
CHRNA2Q15822 CYP21A1P-202ENST00000354927 1481 ntBASIC27.92■■■□□ 2.06
CHRNA2Q15822 PPP1R14A-202ENST00000347262 637 ntTSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
CHRNA2Q15822 TMSB4X-201ENST00000380633 495 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.92■■■□□ 2.06
CHRNA2Q15822 LINC01659-202ENST00000449711 917 ntTSL 3 BASIC27.92■■■□□ 2.06
CHRNA2Q15822 TMEM72-203ENST00000544540 1018 ntTSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
CHRNA2Q15822 AC027682.2-201ENST00000563083 336 ntTSL 5 BASIC27.92■■■□□ 2.06
CHRNA2Q15822 CDKN2A-213ENST00000579122 666 ntTSL 3 BASIC27.92■■■□□ 2.06
CHRNA2Q15822 C17orf62-230ENST00000583617 866 ntTSL 5 BASIC27.92■■■□□ 2.06
CHRNA2Q15822 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.92■■■□□ 2.06
CHRNA2Q15822 TBC1D22A-206ENST00000407381 1949 ntTSL 5 BASIC27.92■■■□□ 2.06
CHRNA2Q15822 FAM66E-201ENST00000529252 1433 ntTSL 2 BASIC27.92■■■□□ 2.06
CHRNA2Q15822 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
CHRNA2Q15822 NPAS1-201ENST00000439365 1341 ntTSL 2 BASIC27.92■■■□□ 2.06
CHRNA2Q15822 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
CHRNA2Q15822 SUGCT-202ENST00000401647 1369 ntTSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
CHRNA2Q15822 SPATA2L-202ENST00000335360 1001 ntTSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
CHRNA2Q15822 AC007322.3-201ENST00000426526 701 ntBASIC27.91■■■□□ 2.06
CHRNA2Q15822 CDKN2A-205ENST00000479692 544 ntTSL 5 BASIC27.91■■■□□ 2.06
CHRNA2Q15822 FAM181A-203ENST00000556222 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
CHRNA2Q15822 NUBP2-206ENST00000565134 815 ntTSL 5 BASIC27.91■■■□□ 2.06
CHRNA2Q15822 AC009090.2-201ENST00000565829 472 ntTSL 3 BASIC27.91■■■□□ 2.06
CHRNA2Q15822 ARMC4P1-202ENST00000576034 643 ntTSL 2 BASIC27.91■■■□□ 2.06
CHRNA2Q15822 PRKACA-209ENST00000590853 1101 ntTSL 5 BASIC27.91■■■□□ 2.06
CHRNA2Q15822 FNIP1-204ENST00000511848 1720 ntTSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
CHRNA2Q15822 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
CHRNA2Q15822 NTSR2-201ENST00000306928 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
CHRNA2Q15822 DPF1-209ENST00000456296 1562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.9■■■□□ 2.06
CHRNA2Q15822 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
CHRNA2Q15822 MAST1-208ENST00000591495 1496 ntTSL 5 BASIC27.9■■■□□ 2.06
CHRNA2Q15822 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC27.9■■■□□ 2.06
CHRNA2Q15822 SNX21-212ENST00000491381 1607 ntTSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
CHRNA2Q15822 OR10H2-201ENST00000305899 1041 ntAPPRIS P1 BASIC27.9■■■□□ 2.06
CHRNA2Q15822 TCTEX1D2-201ENST00000325318 673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
CHRNA2Q15822 USF2-203ENST00000379134 648 ntTSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
CHRNA2Q15822 SAPCD2P1-201ENST00000395413 1184 ntBASIC27.9■■■□□ 2.06
CHRNA2Q15822 UBB-203ENST00000395839 1012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.9■■■□□ 2.06
CHRNA2Q15822 SIVA1-203ENST00000535554 1244 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.9■■■□□ 2.06
CHRNA2Q15822 BCL2L10-202ENST00000561198 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
CHRNA2Q15822 MAZ-215ENST00000569978 567 ntTSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
CHRNA2Q15822 AQP4-AS1-204ENST00000582605 525 ntTSL 4 BASIC27.9■■■□□ 2.06
CHRNA2Q15822 FBXO17-202ENST00000595329 1299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.9■■■□□ 2.06
CHRNA2Q15822 WT1-211ENST00000639907 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.9■■■□□ 2.06
CHRNA2Q15822 CITED2-202ENST00000536159 1797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.9■■■□□ 2.06
CHRNA2Q15822 CITED2-203ENST00000537332 1780 ntTSL 3 BASIC27.9■■■□□ 2.06
CHRNA2Q15822 FDXR-219ENST00000583917 1762 ntTSL 5 BASIC27.9■■■□□ 2.06
CHRNA2Q15822 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
CHRNA2Q15822 CA7-201ENST00000338437 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
CHRNA2Q15822 ARRB2-216ENST00000574954 1348 ntTSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
CHRNA2Q15822 MMEL1-206ENST00000502556 1943 ntTSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
CHRNA2Q15822 AC013269.1-201ENST00000409259 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
CHRNA2Q15822 TISP43-206ENST00000623376 1653 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
CHRNA2Q15822 COL11A2-204ENST00000395194 1194 ntTSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
CHRNA2Q15822 SERF2-207ENST00000409614 582 ntTSL 2 BASIC27.89■■■□□ 2.06
CHRNA2Q15822 AL390728.5-201ENST00000428687 706 ntTSL 3 BASIC27.89■■■□□ 2.06
CHRNA2Q15822 AC020913.2-201ENST00000601929 629 ntTSL 5 BASIC27.89■■■□□ 2.06
CHRNA2Q15822 MTDHP1-201ENST00000605323 784 ntBASIC27.89■■■□□ 2.06
CHRNA2Q15822 AL023875.1-201ENST00000640777 796 ntBASIC27.89■■■□□ 2.06
CHRNA2Q15822 AUNIP-203ENST00000538789 1392 ntTSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
CHRNA2Q15822 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
CHRNA2Q15822 LIME1-201ENST00000309546 1178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
CHRNA2Q15822 TPM1-208ENST00000404484 1568 ntTSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
CHRNA2Q15822 PTPA-214ENST00000423100 988 ntTSL 2 BASIC27.88■■■□□ 2.05
CHRNA2Q15822 LHFPL3-202ENST00000424859 1852 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
CHRNA2Q15822 ALG5-202ENST00000443765 1119 ntTSL 2 BASIC27.88■■■□□ 2.05
CHRNA2Q15822 KRT8P12-201ENST00000468527 998 ntTSL 2 BASIC27.88■■■□□ 2.05
CHRNA2Q15822 THEM4-205ENST00000489410 643 ntTSL 2 BASIC27.88■■■□□ 2.05
CHRNA2Q15822 LY6E-205ENST00000519611 635 ntTSL 3 BASIC27.88■■■□□ 2.05
CHRNA2Q15822 LY6E-212ENST00000522024 868 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.88■■■□□ 2.05
CHRNA2Q15822 AC090877.2-202ENST00000560363 574 ntTSL 2 BASIC27.88■■■□□ 2.05
CHRNA2Q15822 AC124016.1-201ENST00000609552 612 ntBASIC27.88■■■□□ 2.05
CHRNA2Q15822 AC133561.5-201ENST00000635547 218 ntBASIC27.88■■■□□ 2.05
CHRNA2Q15822 MIR222HG-202ENST00000602507 1758 ntTSL 5 BASIC27.88■■■□□ 2.05
CHRNA2Q15822 SEC11A-201ENST00000268220 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
CHRNA2Q15822 ABHD1-201ENST00000316470 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
CHRNA2Q15822 SPATA25-201ENST00000372519 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
CHRNA2Q15822 STXBP1-203ENST00000476182 566 ntTSL 5 BASIC27.87■■■□□ 2.05
CHRNA2Q15822 PTGIR-202ENST00000594275 699 ntTSL 3 BASIC27.87■■■□□ 2.05
CHRNA2Q15822 PTGIR-206ENST00000598865 724 ntTSL 3 BASIC27.87■■■□□ 2.05
CHRNA2Q15822 MADCAM1-201ENST00000215637 1572 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
CHRNA2Q15822 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC27.86■■■□□ 2.05
CHRNA2Q15822 PLPP2-201ENST00000269812 1228 ntTSL 3 BASIC27.86■■■□□ 2.05
CHRNA2Q15822 HES2-205ENST00000487437 968 ntTSL 3 BASIC27.86■■■□□ 2.05
CHRNA2Q15822 AC008750.8-201ENST00000600067 551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.86■■■□□ 2.05
CHRNA2Q15822 CLDND2-203ENST00000601435 575 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.86■■■□□ 2.05
CHRNA2Q15822 AC105020.6-201ENST00000621523 1217 ntBASIC27.86■■■□□ 2.05
CHRNA2Q15822 AL049637.2-201ENST00000641778 930 ntBASIC27.86■■■□□ 2.05
CHRNA2Q15822 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
CHRNA2Q15822 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC27.86■■■□□ 2.05
CHRNA2Q15822 AC010542.4-201ENST00000563151 1910 ntBASIC27.86■■■□□ 2.05
CHRNA2Q15822 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
CHRNA2Q15822 HAS3-201ENST00000219322 1163 ntTSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
CHRNA2Q15822 SLX1A-201ENST00000251303 1091 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
CHRNA2Q15822 POMC-201ENST00000264708 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.85■■■□□ 2.05
CHRNA2Q15822 SLX1B-201ENST00000330181 1165 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
CHRNA2Q15822 CCDC74B-204ENST00000409234 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
CHRNA2Q15822 AC087499.1-201ENST00000418141 1075 ntBASIC27.85■■■□□ 2.05
CHRNA2Q15822 MUC1-211ENST00000438413 927 ntTSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 84.6 ms