Protein–RNA interactions for Protein: Q15788

NCOA1, Nuclear receptor coactivator 1, humanhuman

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Length 1,441 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NCOA1Q15788 SAPCD2P1-201ENST00000395413 1184 ntBASIC31.27■■■□□ 2.6
NCOA1Q15788 OR2A1-AS1-201ENST00000462305 773 ntBASIC31.27■■■□□ 2.6
NCOA1Q15788 AC004889.1-204ENST00000474656 773 ntTSL 3 BASIC31.27■■■□□ 2.6
NCOA1Q15788 ST20-202ENST00000485386 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.27■■■□□ 2.6
NCOA1Q15788 AC006435.1-201ENST00000571775 1065 ntTSL 5 BASIC31.27■■■□□ 2.6
NCOA1Q15788 ACBD4-202ENST00000376955 1453 ntTSL 2 BASIC31.27■■■□□ 2.6
NCOA1Q15788 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.27■■■□□ 2.6
NCOA1Q15788 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.27■■■□□ 2.6
NCOA1Q15788 FOXN3-209ENST00000555353 1595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.27■■■□□ 2.6
NCOA1Q15788 NUF2-208ENST00000524800 1845 ntTSL 5 BASIC31.27■■■□□ 2.6
NCOA1Q15788 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.26■■■□□ 2.6
NCOA1Q15788 BOLA1-203ENST00000369153 1096 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC31.26■■■□□ 2.6
NCOA1Q15788 CD99-203ENST00000381184 918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.26■■■□□ 2.6
NCOA1Q15788 FAM207A-202ENST00000397826 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC31.26■■■□□ 2.6
NCOA1Q15788 LINC01962-201ENST00000513771 411 ntTSL 2 BASIC31.26■■■□□ 2.6
NCOA1Q15788 FBXL8-203ENST00000518148 1054 ntTSL 2 BASIC31.26■■■□□ 2.6
NCOA1Q15788 LINC01301-204ENST00000530725 577 ntTSL 4 BASIC31.26■■■□□ 2.6
NCOA1Q15788 MAGIX-206ENST00000615626 1057 ntTSL 1 (best) BASIC31.26■■■□□ 2.6
NCOA1Q15788 DUSP18-205ENST00000404885 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.26■■■□□ 2.6
NCOA1Q15788 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.26■■■□□ 2.59
NCOA1Q15788 ATP8A1-207ENST00000510289 2238 ntTSL 1 (best) BASIC31.26■■■□□ 2.59
NCOA1Q15788 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.26■■■□□ 2.59
NCOA1Q15788 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC31.25■■■□□ 2.59
NCOA1Q15788 SLC25A39-212ENST00000590194 1542 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC31.25■■■□□ 2.59
NCOA1Q15788 GNB4-204ENST00000468623 1360 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.25■■■□□ 2.59
NCOA1Q15788 RPS20-210ENST00000523936 899 ntTSL 2 BASIC31.25■■■□□ 2.59
NCOA1Q15788 AC007493.2-201ENST00000568427 478 ntTSL 3 BASIC31.25■■■□□ 2.59
NCOA1Q15788 AF274858.3-202ENST00000569906 755 ntTSL 3 BASIC31.25■■■□□ 2.59
NCOA1Q15788 HAND1-201ENST00000231121 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.25■■■□□ 2.59
NCOA1Q15788 AC133555.3-201ENST00000549950 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC31.25■■■□□ 2.59
NCOA1Q15788 AC106782.1-201ENST00000550538 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC31.25■■■□□ 2.59
NCOA1Q15788 RHBDL1-202ENST00000352681 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.25■■■□□ 2.59
NCOA1Q15788 OLFM1-202ENST00000277415 1014 ntTSL 1 (best) BASIC31.24■■■□□ 2.59
NCOA1Q15788 CLDN3-201ENST00000395145 1274 ntAPPRIS P1 BASIC31.24■■■□□ 2.59
NCOA1Q15788 UBB-203ENST00000395839 1012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.24■■■□□ 2.59
NCOA1Q15788 PTPA-214ENST00000423100 988 ntTSL 2 BASIC31.24■■■□□ 2.59
NCOA1Q15788 AC008667.2-201ENST00000504413 469 ntTSL 3 BASIC31.24■■■□□ 2.59
NCOA1Q15788 AC092143.2-201ENST00000554623 985 ntTSL 3 BASIC31.24■■■□□ 2.59
NCOA1Q15788 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.24■■■□□ 2.59
NCOA1Q15788 SCRN2-212ENST00000584123 1745 ntTSL 1 (best) BASIC31.24■■■□□ 2.59
NCOA1Q15788 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC31.24■■■□□ 2.59
NCOA1Q15788 DPF1-201ENST00000355526 1632 ntTSL 1 (best) BASIC31.24■■■□□ 2.59
NCOA1Q15788 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.24■■■□□ 2.59
NCOA1Q15788 CLDN5-204ENST00000618236 1374 ntAPPRIS P1 BASIC31.24■■■□□ 2.59
NCOA1Q15788 PRAF2-202ENST00000553851 1334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.24■■■□□ 2.59
NCOA1Q15788 AL390719.1-201ENST00000427998 977 ntTSL 1 (best) BASIC31.24■■■□□ 2.59
NCOA1Q15788 GAL3ST3-201ENST00000312006 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.23■■■□□ 2.59
NCOA1Q15788 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.23■■■□□ 2.59
NCOA1Q15788 MAF1-205ENST00000534585 1754 ntTSL 5 BASIC31.23■■■□□ 2.59
NCOA1Q15788 TPST1-201ENST00000304842 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.23■■■□□ 2.59
NCOA1Q15788 VMO1-204ENST00000441199 741 ntTSL 2 BASIC31.23■■■□□ 2.59
NCOA1Q15788 HAGLR-207ENST00000452365 661 ntTSL 4 BASIC31.23■■■□□ 2.59
NCOA1Q15788 ACYP2-207ENST00000606082 713 ntTSL 5 BASIC31.23■■■□□ 2.59
NCOA1Q15788 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC31.23■■■□□ 2.59
NCOA1Q15788 MOK-226ENST00000522874 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.22■■■□□ 2.59
NCOA1Q15788 HPF1-201ENST00000393381 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.22■■■□□ 2.59
NCOA1Q15788 PHOSPHO2-206ENST00000616481 1252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC31.22■■■□□ 2.59
NCOA1Q15788 PHOSPHO2-208ENST00000617738 1053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.22■■■□□ 2.59
NCOA1Q15788 GJB6-203ENST00000400065 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.22■■■□□ 2.59
NCOA1Q15788 ENTPD2-201ENST00000312665 1500 ntTSL 1 (best) BASIC31.22■■■□□ 2.59
NCOA1Q15788 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC31.22■■■□□ 2.59
NCOA1Q15788 PLSCR3-201ENST00000324822 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.21■■■□□ 2.59
NCOA1Q15788 RPLP0-201ENST00000228306 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.21■■■□□ 2.59
NCOA1Q15788 MCAT-202ENST00000327555 1134 ntTSL 1 (best) BASIC31.21■■■□□ 2.59
NCOA1Q15788 AL360181.5-201ENST00000368554 1044 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.21■■■□□ 2.59
NCOA1Q15788 RBP4-201ENST00000371464 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.21■■■□□ 2.59
NCOA1Q15788 CDV3P1-201ENST00000471403 739 ntBASIC31.21■■■□□ 2.59
NCOA1Q15788 AC073111.3-201ENST00000478789 635 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC31.21■■■□□ 2.59
NCOA1Q15788 KRT18P21-201ENST00000515767 1272 ntBASIC31.21■■■□□ 2.59
NCOA1Q15788 PLEKHB1-216ENST00000543085 632 ntTSL 3 BASIC31.21■■■□□ 2.59
NCOA1Q15788 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC31.21■■■□□ 2.59
NCOA1Q15788 PIGH-201ENST00000216452 1420 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.21■■■□□ 2.59
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NCOA1Q15788 LINC00605-201ENST00000514902 1558 ntTSL 1 (best) BASIC31.2■■■□□ 2.59
NCOA1Q15788 HPCAL1-201ENST00000307845 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.2■■■□□ 2.59
NCOA1Q15788 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC31.2■■■□□ 2.59
NCOA1Q15788 NR2F2-204ENST00000453270 1712 ntTSL 1 (best) BASIC31.2■■■□□ 2.59
NCOA1Q15788 ZIM2-201ENST00000593711 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.2■■■□□ 2.59
NCOA1Q15788 KIAA1522-201ENST00000294521 878 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC31.2■■■□□ 2.59
NCOA1Q15788 UNC50-201ENST00000357765 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.2■■■□□ 2.59
NCOA1Q15788 PDCD6-206ENST00000507528 1088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC31.2■■■□□ 2.59
NCOA1Q15788 CERNA3-201ENST00000521403 557 ntTSL 3 BASIC31.2■■■□□ 2.59
NCOA1Q15788 RNF121-214ENST00000533380 870 ntTSL 3 BASIC31.2■■■□□ 2.59
NCOA1Q15788 CLN6-206ENST00000565471 1075 ntTSL 2 BASIC31.2■■■□□ 2.59
NCOA1Q15788 RRNAD1-202ENST00000368218 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC31.2■■■□□ 2.58
NCOA1Q15788 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.2■■■□□ 2.58
NCOA1Q15788 CHRNA10-204ENST00000534359 1474 ntTSL 1 (best) BASIC31.19■■■□□ 2.58
NCOA1Q15788 VKORC1-202ENST00000319788 1077 ntTSL 1 (best) BASIC31.19■■■□□ 2.58
NCOA1Q15788 C10orf91-201ENST00000321248 1257 ntTSL 1 (best) BASIC31.19■■■□□ 2.58
NCOA1Q15788 C15orf48-201ENST00000344300 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.19■■■□□ 2.58
NCOA1Q15788 NKAIN4-201ENST00000370307 793 ntTSL 5 BASIC31.19■■■□□ 2.58
NCOA1Q15788 RHOG-202ENST00000396978 1066 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC31.19■■■□□ 2.58
NCOA1Q15788 SERPINH1P1-201ENST00000419794 1249 ntBASIC31.19■■■□□ 2.58
NCOA1Q15788 AC004771.5-201ENST00000575985 542 ntTSL 4 BASIC31.19■■■□□ 2.58
NCOA1Q15788 JOSD2-202ENST00000595669 733 ntTSL 2 BASIC31.19■■■□□ 2.58
NCOA1Q15788 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC31.19■■■□□ 2.58
NCOA1Q15788 NSMF-203ENST00000371472 1852 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC31.19■■■□□ 2.58
NCOA1Q15788 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.19■■■□□ 2.58
NCOA1Q15788 FAM98C-201ENST00000252530 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.18■■■□□ 2.58
NCOA1Q15788 CXCL3-201ENST00000296026 1075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.18■■■□□ 2.58
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