Protein–RNA interactions for Protein: Q15699

ALX1, ALX homeobox protein 1, humanhuman

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Length 326 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ALX1Q15699 SETD6-202ENST00000310682 2042 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
ALX1Q15699 PAQR6-205ENST00000368270 1765 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
ALX1Q15699 SEC61A2-205ENST00000379033 2462 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
ALX1Q15699 SMCO4-201ENST00000298966 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
ALX1Q15699 CFD-201ENST00000327726 1201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
ALX1Q15699 SLC22A15-201ENST00000369502 1230 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
ALX1Q15699 PGPEP1L-201ENST00000378919 995 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
ALX1Q15699 RPL29-209ENST00000495383 713 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
ALX1Q15699 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
ALX1Q15699 CAPZB-205ENST00000433834 1462 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
ALX1Q15699 HNRNPLL-204ENST00000409328 1908 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
ALX1Q15699 FAM69B-202ENST00000371692 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
ALX1Q15699 SNX24-211ENST00000513881 1563 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
ALX1Q15699 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
ALX1Q15699 GAS8-202ENST00000536122 1687 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
ALX1Q15699 MTHFS-201ENST00000258874 907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
ALX1Q15699 CDKN2A-205ENST00000479692 544 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
ALX1Q15699 TMEM41B-205ENST00000533723 723 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
ALX1Q15699 MYO19-221ENST00000620640 1186 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
ALX1Q15699 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
ALX1Q15699 CENPU-201ENST00000281453 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
ALX1Q15699 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
ALX1Q15699 ADCK2-201ENST00000072869 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
ALX1Q15699 TRIM3-214ENST00000536344 2704 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
ALX1Q15699 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
ALX1Q15699 TAF9-201ENST00000217893 1283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
ALX1Q15699 AIDA-202ENST00000355727 1072 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
ALX1Q15699 C2orf50-202ENST00000405022 980 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
ALX1Q15699 HAGH-203ENST00000455446 1276 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
ALX1Q15699 PPP1R14BP3-201ENST00000509033 445 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
ALX1Q15699 TMEM218-207ENST00000528724 1117 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
ALX1Q15699 TMEM218-214ENST00000532156 954 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
ALX1Q15699 AC016405.3-201ENST00000607710 860 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
ALX1Q15699 FAM21FP-204ENST00000608637 956 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
ALX1Q15699 GATA6-AS1-202ENST00000583490 1788 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
ALX1Q15699 FDXR-219ENST00000583917 1762 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
ALX1Q15699 NELFE-202ENST00000375429 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
ALX1Q15699 WDR88-201ENST00000355868 1718 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
ALX1Q15699 PMPCA-203ENST00000399219 1987 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
ALX1Q15699 TMPRSS5-208ENST00000544476 1320 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
ALX1Q15699 CHN1-203ENST00000409156 1761 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
ALX1Q15699 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
ALX1Q15699 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
ALX1Q15699 XBP1-202ENST00000344347 1131 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
ALX1Q15699 CYP2T1P-201ENST00000432607 1285 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
ALX1Q15699 PBX1-209ENST00000485769 834 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
ALX1Q15699 FAM47E-204ENST00000510328 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
ALX1Q15699 DHRS4-207ENST00000559632 1003 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
ALX1Q15699 Z92544.1-201ENST00000567091 730 ntTSL 3 BASIC24.65■■□□□ 1.54
ALX1Q15699 AC133552.2-202ENST00000575694 574 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
ALX1Q15699 AC116050.2-201ENST00000612102 1779 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
ALX1Q15699 ARSA-202ENST00000356098 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
ALX1Q15699 RGS20-202ENST00000297313 2104 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
ALX1Q15699 HRASLS-201ENST00000264735 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
ALX1Q15699 RNPS1-201ENST00000301730 1276 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
ALX1Q15699 MIR663A-201ENST00000385250 93 ntBASIC24.64■■□□□ 1.54
ALX1Q15699 BET1L-204ENST00000410108 637 ntTSL 3 BASIC24.64■■□□□ 1.54
ALX1Q15699 C19orf81-201ENST00000425202 765 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
ALX1Q15699 ARL5A-202ENST00000428992 747 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
ALX1Q15699 AC025754.1-201ENST00000507566 407 ntTSL 3 BASIC24.64■■□□□ 1.54
ALX1Q15699 VIL1-204ENST00000440053 1454 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
ALX1Q15699 AF106564.1-201ENST00000607058 2553 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
ALX1Q15699 SLC38A7-205ENST00000564010 1437 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
ALX1Q15699 IKBKG-206ENST00000594239 2299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
ALX1Q15699 RTCA-201ENST00000260563 1534 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
ALX1Q15699 OIP5-201ENST00000220514 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
ALX1Q15699 ZNF644-203ENST00000361321 1253 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
ALX1Q15699 EIF5A-205ENST00000419711 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
ALX1Q15699 AC007322.3-201ENST00000426526 701 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
ALX1Q15699 NCF1B-203ENST00000435988 1254 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
ALX1Q15699 MAP2K4P1-201ENST00000438453 1195 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
ALX1Q15699 CDV3P1-201ENST00000471403 739 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
ALX1Q15699 CASP6-205ENST00000505486 538 ntTSL 4 BASIC24.63■■□□□ 1.53
ALX1Q15699 RARRES2P4-201ENST00000514074 484 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
ALX1Q15699 TK2-208ENST00000545043 1120 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
ALX1Q15699 SQLE-206ENST00000523430 1879 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
ALX1Q15699 SLC9A3R1-201ENST00000262613 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
ALX1Q15699 NEURL3-204ENST00000451794 1461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
ALX1Q15699 PDE9A-212ENST00000398234 1783 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
ALX1Q15699 SLC2A7-201ENST00000400906 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
ALX1Q15699 AC011484.1-201ENST00000377652 1995 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
ALX1Q15699 CCDC185-201ENST00000366875 2054 ntAPPRIS P1 BASIC24.62■■□□□ 1.53
ALX1Q15699 ASIP-201ENST00000374954 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
ALX1Q15699 C4orf48-202ENST00000409860 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
ALX1Q15699 ALG5-202ENST00000443765 1119 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
ALX1Q15699 POLE4-205ENST00000483063 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
ALX1Q15699 AC007114.1-201ENST00000576871 713 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
ALX1Q15699 OR10C1-204ENST00000622521 1039 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
ALX1Q15699 GRTP1-203ENST00000375431 1384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
ALX1Q15699 SAC3D1-205ENST00000531072 1362 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
ALX1Q15699 NUDT16L1-202ENST00000405142 2040 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
ALX1Q15699 AC090360.1-201ENST00000569722 2218 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
ALX1Q15699 AC007375.3-201ENST00000600936 2314 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
ALX1Q15699 OR10C1-203ENST00000444197 1672 ntAPPRIS P1 BASIC24.62■■□□□ 1.53
ALX1Q15699 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC24.62■■□□□ 1.53
ALX1Q15699 GPR108-201ENST00000264080 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
ALX1Q15699 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
ALX1Q15699 GPAA1-202ENST00000361036 1840 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
ALX1Q15699 ZNF584-201ENST00000306910 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
ALX1Q15699 AL512625.2-201ENST00000417533 625 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
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