Protein–RNA interactions for Protein: Q15477

SKIV2L, Helicase SKI2W, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,246 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SKIV2LQ15477 CD44-222ENST00000526025 1052 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
SKIV2LQ15477 PRKY-204ENST00000533551 1019 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
SKIV2LQ15477 AL049597.2-201ENST00000565575 961 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
SKIV2LQ15477 RPS15-206ENST00000589656 473 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
SKIV2LQ15477 C16orf74-202ENST00000602583 1237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SKIV2LQ15477 SMN1-211ENST00000625245 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
SKIV2LQ15477 SMN2-215ENST00000628696 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
SKIV2LQ15477 C20orf204-205ENST00000636176 961 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
SKIV2LQ15477 RPS6KA2-201ENST00000265678 5824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SKIV2LQ15477 TACO1-201ENST00000258975 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SKIV2LQ15477 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
SKIV2LQ15477 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SKIV2LQ15477 SEPT1-201ENST00000321367 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SKIV2LQ15477 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SKIV2LQ15477 DDX31-206ENST00000480876 1333 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SKIV2LQ15477 NAPSA-201ENST00000253719 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SKIV2LQ15477 SPATA2L-202ENST00000335360 1001 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SKIV2LQ15477 BCL2L10-202ENST00000561198 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SKIV2LQ15477 LINC00304-202ENST00000562248 1095 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SKIV2LQ15477 AC010646.1-201ENST00000594059 515 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SKIV2LQ15477 PHF2-201ENST00000359246 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SKIV2LQ15477 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SKIV2LQ15477 CD247-201ENST00000362089 1609 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SKIV2LQ15477 EPHX3-202ENST00000435261 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SKIV2LQ15477 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SKIV2LQ15477 C22orf34-203ENST00000405854 1593 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SKIV2LQ15477 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
SKIV2LQ15477 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SKIV2LQ15477 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
SKIV2LQ15477 ARL2-201ENST00000246747 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SKIV2LQ15477 GCHFR-201ENST00000260447 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SKIV2LQ15477 PTCRA-201ENST00000304672 1080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SKIV2LQ15477 PRSS57-201ENST00000329267 1025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SKIV2LQ15477 MAGI2-AS3-203ENST00000424477 520 ntTSL 4 BASIC22.11■■□□□ 1.13
SKIV2LQ15477 AC073316.3-201ENST00000437354 982 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
SKIV2LQ15477 PTCRA-202ENST00000441198 1005 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SKIV2LQ15477 PTCRA-203ENST00000446507 759 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SKIV2LQ15477 BNIP3L-206ENST00000523515 915 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
SKIV2LQ15477 SIVA1-203ENST00000535554 1244 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
SKIV2LQ15477 PRSS57-202ENST00000613411 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SKIV2LQ15477 AL590326.2-201ENST00000625139 305 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
SKIV2LQ15477 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SKIV2LQ15477 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SKIV2LQ15477 GGA2-211ENST00000567468 1713 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
SKIV2LQ15477 GAL3ST4-204ENST00000423751 1695 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
SKIV2LQ15477 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
SKIV2LQ15477 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SKIV2LQ15477 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
SKIV2LQ15477 BACE1-203ENST00000428381 1333 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SKIV2LQ15477 TMEM53-205ENST00000372244 1472 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
SKIV2LQ15477 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SKIV2LQ15477 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SKIV2LQ15477 NTSR2-201ENST00000306928 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SKIV2LQ15477 HDAC11-203ENST00000402271 1018 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
SKIV2LQ15477 SLC29A4P2-201ENST00000504749 1089 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
SKIV2LQ15477 AC009090.2-201ENST00000565829 472 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
SKIV2LQ15477 RMI2-205ENST00000576027 818 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
SKIV2LQ15477 PTGIR-202ENST00000594275 699 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
SKIV2LQ15477 PTGIR-206ENST00000598865 724 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
SKIV2LQ15477 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SKIV2LQ15477 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SKIV2LQ15477 C20orf27-201ENST00000217195 1302 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SKIV2LQ15477 IRAK3-203ENST00000545837 1579 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SKIV2LQ15477 AL135905.2-201ENST00000584934 1404 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
SKIV2LQ15477 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SKIV2LQ15477 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SKIV2LQ15477 COX7A2L-201ENST00000234301 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SKIV2LQ15477 ETHE1-201ENST00000292147 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SKIV2LQ15477 RABL2A-202ENST00000393165 1118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SKIV2LQ15477 CDV3P1-201ENST00000471403 739 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
SKIV2LQ15477 FAM21FP-204ENST00000608637 956 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
SKIV2LQ15477 AC100791.3-201ENST00000617619 330 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
SKIV2LQ15477 APOC3-205ENST00000630701 541 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SKIV2LQ15477 AL023875.1-201ENST00000640777 796 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
SKIV2LQ15477 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SKIV2LQ15477 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SKIV2LQ15477 SERPINB6-204ENST00000380529 1370 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SKIV2LQ15477 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SKIV2LQ15477 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SKIV2LQ15477 FNIP1-204ENST00000511848 1720 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SKIV2LQ15477 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
SKIV2LQ15477 SYNGR2-203ENST00000588282 1553 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
SKIV2LQ15477 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC22.08■■□□□ 1.13
SKIV2LQ15477 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
SKIV2LQ15477 ENTPD2-201ENST00000312665 1500 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
SKIV2LQ15477 SLC25A39-212ENST00000590194 1542 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
SKIV2LQ15477 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
SKIV2LQ15477 ABHD14A-201ENST00000273596 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
SKIV2LQ15477 LINC00708-201ENST00000428165 916 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
SKIV2LQ15477 AL355075.4-201ENST00000554988 638 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
SKIV2LQ15477 NOXO1-205ENST00000566005 1144 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
SKIV2LQ15477 AC012306.2-201ENST00000609350 630 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
SKIV2LQ15477 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
SKIV2LQ15477 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
SKIV2LQ15477 LRP5-201ENST00000294304 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
SKIV2LQ15477 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
SKIV2LQ15477 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
SKIV2LQ15477 HRK-201ENST00000257572 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
SKIV2LQ15477 AC132008.2-203ENST00000418868 1552 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
SKIV2LQ15477 AC061975.6-201ENST00000579045 1553 ntBASIC22.08■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 68.4 ms