Protein–RNA interactions for Protein: Q15435

PPP1R7, Protein phosphatase 1 regulatory subunit 7, humanhuman

Predictions only

Length 360 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PPP1R7Q15435 DPP10-203ENST00000393147 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
PPP1R7Q15435 NR6A1-202ENST00000373584 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
PPP1R7Q15435 SLC43A3-225ENST00000533524 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
PPP1R7Q15435 ZIM2-206ENST00000599935 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
PPP1R7Q15435 CBWD3-202ENST00000377342 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
PPP1R7Q15435 RUSC1-AS1-203ENST00000450199 1636 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
PPP1R7Q15435 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
PPP1R7Q15435 ANKRD63-201ENST00000434396 1143 ntAPPRIS P1 BASIC21.6■■□□□ 1.05
PPP1R7Q15435 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
PPP1R7Q15435 PXK-203ENST00000383715 1756 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
PPP1R7Q15435 RXFP3-201ENST00000330120 1852 ntAPPRIS P1 BASIC21.6■■□□□ 1.05
PPP1R7Q15435 ZGPAT-204ENST00000369967 1890 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
PPP1R7Q15435 CYP21A1P-201ENST00000342991 1971 ntTSL 3 BASIC21.59■■□□□ 1.05
PPP1R7Q15435 CPAMD8-202ENST00000388925 5355 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
PPP1R7Q15435 HDAC2-201ENST00000368632 2084 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
PPP1R7Q15435 UBE2B-201ENST00000265339 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
PPP1R7Q15435 CD2AP-201ENST00000359314 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
PPP1R7Q15435 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
PPP1R7Q15435 RCN3-201ENST00000270645 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
PPP1R7Q15435 DUSP15-201ENST00000278979 1732 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
PPP1R7Q15435 SUSD1-203ENST00000374264 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
PPP1R7Q15435 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
PPP1R7Q15435 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC21.59■■□□□ 1.05
PPP1R7Q15435 AP003356.1-202ENST00000517910 2770 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
PPP1R7Q15435 MARK1-205ENST00000611084 5321 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
PPP1R7Q15435 AC121338.2-201ENST00000622535 1744 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
PPP1R7Q15435 BLCAP-208ENST00000414542 2205 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.59■■□□□ 1.05
PPP1R7Q15435 ADAMTS19-205ENST00000638972 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
PPP1R7Q15435 DR1-201ENST00000370267 1647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
PPP1R7Q15435 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
PPP1R7Q15435 FDXR-201ENST00000293195 1875 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
PPP1R7Q15435 ALDOA-221ENST00000566897 2448 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
PPP1R7Q15435 LACTB-202ENST00000413507 2978 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
PPP1R7Q15435 IRF7-201ENST00000330243 1992 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
PPP1R7Q15435 SREBF2-209ENST00000612482 5365 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
PPP1R7Q15435 MZF1-203ENST00000594234 2385 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
PPP1R7Q15435 C16orf86-201ENST00000403458 1267 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
PPP1R7Q15435 LINC02136-201ENST00000567469 530 ntTSL 4 BASIC21.58■■□□□ 1.05
PPP1R7Q15435 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
PPP1R7Q15435 CHST1-201ENST00000308064 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
PPP1R7Q15435 MYO1D-213ENST00000583621 1916 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
PPP1R7Q15435 TSPAN17-202ENST00000310032 2550 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.04
PPP1R7Q15435 CYP1B1-207ENST00000614273 2174 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.04
PPP1R7Q15435 TMEM163-201ENST00000281924 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
PPP1R7Q15435 ZGPAT-206ENST00000448100 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
PPP1R7Q15435 SUDS3-204ENST00000543473 4897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
PPP1R7Q15435 UQCR11-203ENST00000591899 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
PPP1R7Q15435 AP000679.1-202ENST00000319763 2081 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
PPP1R7Q15435 KCNQ5-202ENST00000355194 6566 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
PPP1R7Q15435 KCNQ5-206ENST00000402622 6596 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
PPP1R7Q15435 TCP11-203ENST00000373974 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
PPP1R7Q15435 IFNGR2-203ENST00000405436 1684 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
PPP1R7Q15435 S1PR5-204ENST00000617721 1698 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
PPP1R7Q15435 RELL2-205ENST00000518856 1419 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
PPP1R7Q15435 FSTL3-201ENST00000166139 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
PPP1R7Q15435 TERF2IP-201ENST00000300086 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
PPP1R7Q15435 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
PPP1R7Q15435 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
PPP1R7Q15435 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
PPP1R7Q15435 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
PPP1R7Q15435 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
PPP1R7Q15435 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
PPP1R7Q15435 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
PPP1R7Q15435 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC21.57■■□□□ 1.04
PPP1R7Q15435 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
PPP1R7Q15435 SP3-208ENST00000640958 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
PPP1R7Q15435 GTPBP3-222ENST00000600625 2493 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
PPP1R7Q15435 ACHE-204ENST00000412389 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
PPP1R7Q15435 SHCBP1L-201ENST00000367547 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
PPP1R7Q15435 HAND1-201ENST00000231121 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
PPP1R7Q15435 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
PPP1R7Q15435 TRIM58-201ENST00000366481 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
PPP1R7Q15435 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
PPP1R7Q15435 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
PPP1R7Q15435 PLEKHB1-204ENST00000398494 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
PPP1R7Q15435 ZIM2-208ENST00000629319 2253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
PPP1R7Q15435 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
PPP1R7Q15435 AL590128.2-201ENST00000442889 415 ntTSL 3 BASIC21.56■■□□□ 1.04
PPP1R7Q15435 MRAS-202ENST00000423968 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
PPP1R7Q15435 PABPC4-204ENST00000372862 2470 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
PPP1R7Q15435 CHRNA3-202ENST00000348639 2030 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
PPP1R7Q15435 WDR4-202ENST00000398208 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
PPP1R7Q15435 SHB-201ENST00000377707 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
PPP1R7Q15435 TPBGL-201ENST00000562197 2793 ntAPPRIS P1 BASIC21.56■■□□□ 1.04
PPP1R7Q15435 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
PPP1R7Q15435 DHRS2-202ENST00000344777 1678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
PPP1R7Q15435 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
PPP1R7Q15435 CXXC5-201ENST00000302517 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
PPP1R7Q15435 SERBP1-202ENST00000370990 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
PPP1R7Q15435 WNK2-204ENST00000427277 6108 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
PPP1R7Q15435 KLF16-201ENST00000250916 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
PPP1R7Q15435 UBE2I-205ENST00000402301 1708 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
PPP1R7Q15435 GPAA1-202ENST00000361036 1840 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
PPP1R7Q15435 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
PPP1R7Q15435 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
PPP1R7Q15435 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
PPP1R7Q15435 LRRC75A-AS1-202ENST00000470491 1057 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
PPP1R7Q15435 AL390816.2-201ENST00000554252 737 ntTSL 3 BASIC21.55■■□□□ 1.04
PPP1R7Q15435 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
PPP1R7Q15435 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.3 ms