Protein–RNA interactions for Protein: Q15306

IRF4, Interferon regulatory factor 4, humanhuman

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Length 451 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IRF4Q15306 PRICKLE3-206ENST00000599218 2062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
IRF4Q15306 DESI2-201ENST00000263831 859 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
IRF4Q15306 TRAPPC5-201ENST00000317378 790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
IRF4Q15306 SMUG1-202ENST00000337581 1571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
IRF4Q15306 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
IRF4Q15306 C4orf48-202ENST00000409860 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
IRF4Q15306 AC007322.3-201ENST00000426526 701 ntBASIC20.57■□□□□ 0.88
IRF4Q15306 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
IRF4Q15306 PXK-211ENST00000484288 2031 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
IRF4Q15306 DNAJA4-210ENST00000489435 947 ntTSL 3 BASIC20.57■□□□□ 0.88
IRF4Q15306 JOSD2-205ENST00000601423 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
IRF4Q15306 TFG-201ENST00000240851 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
IRF4Q15306 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
IRF4Q15306 TUB-203ENST00000534099 1759 ntTSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
IRF4Q15306 WDR88-201ENST00000355868 1718 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
IRF4Q15306 CUEDC2-201ENST00000369937 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
IRF4Q15306 LINC01191-201ENST00000412690 844 ntTSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
IRF4Q15306 LINC01637-201ENST00000444039 684 ntTSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
IRF4Q15306 AL691442.1-201ENST00000505139 1042 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
IRF4Q15306 GRK3-203ENST00000619906 2873 ntTSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
IRF4Q15306 CENPN-201ENST00000299572 1398 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
IRF4Q15306 BCKDK-201ENST00000219794 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
IRF4Q15306 SH2B2-202ENST00000536178 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
IRF4Q15306 C7orf49-213ENST00000617987 1727 ntTSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
IRF4Q15306 CEBPE-201ENST00000206513 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
IRF4Q15306 MEF2A-207ENST00000558812 2186 ntTSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
IRF4Q15306 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
IRF4Q15306 SSTR3-202ENST00000617123 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
IRF4Q15306 C16orf74-201ENST00000284245 906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
IRF4Q15306 CBY3-201ENST00000376974 785 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
IRF4Q15306 RAMP1-202ENST00000403885 650 ntTSL 3 BASIC20.55■□□□□ 0.88
IRF4Q15306 EIF4E3-203ENST00000421769 777 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
IRF4Q15306 AL355472.2-201ENST00000422958 438 ntBASIC20.55■□□□□ 0.88
IRF4Q15306 STAG3L3-201ENST00000423834 1262 ntTSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
IRF4Q15306 AL391244.2-201ENST00000428932 543 ntTSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
IRF4Q15306 VMO1-204ENST00000441199 741 ntTSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
IRF4Q15306 FADS3-204ENST00000525588 1254 ntTSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
IRF4Q15306 AC016588.1-201ENST00000591533 542 ntTSL 4 BASIC20.55■□□□□ 0.88
IRF4Q15306 AC068987.5-201ENST00000642069 987 ntAPPRIS P1 BASIC20.55■□□□□ 0.88
IRF4Q15306 LYPD1-202ENST00000397463 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
IRF4Q15306 AC007128.1-201ENST00000424460 1853 ntTSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
IRF4Q15306 FBXW4P1-201ENST00000426721 2239 ntBASIC20.55■□□□□ 0.88
IRF4Q15306 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
IRF4Q15306 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
IRF4Q15306 CLDN23-201ENST00000519106 2169 ntAPPRIS P1 BASIC20.55■□□□□ 0.88
IRF4Q15306 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
IRF4Q15306 ARL6IP4-220ENST00000543566 1591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
IRF4Q15306 FOXN3-209ENST00000555353 1595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
IRF4Q15306 AC084757.3-201ENST00000558061 1943 ntTSL 3 BASIC20.55■□□□□ 0.88
IRF4Q15306 TCP11-203ENST00000373974 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
IRF4Q15306 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
IRF4Q15306 TADA2B-204ENST00000512388 1343 ntTSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
IRF4Q15306 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
IRF4Q15306 AC244015.2-201ENST00000616358 1861 ntBASIC20.54■□□□□ 0.88
IRF4Q15306 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
IRF4Q15306 LINC00471-201ENST00000313064 1282 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
IRF4Q15306 NAA20-202ENST00000334982 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
IRF4Q15306 SAPCD2P1-201ENST00000395413 1184 ntBASIC20.54■□□□□ 0.88
IRF4Q15306 AP000282.1-201ENST00000454622 682 ntTSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
IRF4Q15306 OGFR-204ENST00000621591 1194 ntTSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
IRF4Q15306 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
IRF4Q15306 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC20.53■□□□□ 0.88
IRF4Q15306 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC20.53■□□□□ 0.88
IRF4Q15306 MDFI-203ENST00000373051 1622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
IRF4Q15306 BAG4-202ENST00000432471 1943 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
IRF4Q15306 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
IRF4Q15306 DYM-203ENST00000442713 2147 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
IRF4Q15306 ABHD17AP1-201ENST00000358206 933 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
IRF4Q15306 ART5-202ENST00000397067 1154 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
IRF4Q15306 FTCDNL1-202ENST00000420128 1021 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
IRF4Q15306 ZNF324-202ENST00000535298 1006 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
IRF4Q15306 DCTPP1-205ENST00000568973 878 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
IRF4Q15306 S1PR5-204ENST00000617721 1698 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
IRF4Q15306 DEDD2-201ENST00000336034 1882 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
IRF4Q15306 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
IRF4Q15306 CDKN2C-203ENST00000396148 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
IRF4Q15306 PHACTR3-202ENST00000359926 2252 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
IRF4Q15306 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
IRF4Q15306 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
IRF4Q15306 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
IRF4Q15306 GTPBP6-201ENST00000326153 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
IRF4Q15306 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
IRF4Q15306 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
IRF4Q15306 DOK3-202ENST00000357198 1729 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
IRF4Q15306 NOXO1-202ENST00000356120 1539 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
IRF4Q15306 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
IRF4Q15306 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
IRF4Q15306 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
IRF4Q15306 NELFE-202ENST00000375429 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
IRF4Q15306 C2orf82-203ENST00000409533 561 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC20.52■□□□□ 0.88
IRF4Q15306 ZNF295-AS1-201ENST00000412906 952 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
IRF4Q15306 DUSP5P2-201ENST00000426873 1033 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
IRF4Q15306 PLEKHJ1-205ENST00000587394 937 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
IRF4Q15306 AC083880.1-201ENST00000608266 535 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
IRF4Q15306 AC100791.3-201ENST00000617619 330 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
IRF4Q15306 TSC22D3-205ENST00000372390 1812 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
IRF4Q15306 PAGR1-201ENST00000320330 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
IRF4Q15306 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
IRF4Q15306 KRT17P1-201ENST00000399211 1546 ntBASIC20.52■□□□□ 0.87
IRF4Q15306 CNTFR-202ENST00000378980 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
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