Protein–RNA interactions for Protein: Q15116

PDCD1, Programmed cell death protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 288 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDCD1Q15116 AC009237.3-201ENST00000393279 1427 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
PDCD1Q15116 FAM219A-205ENST00000379084 893 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
PDCD1Q15116 ASMT-202ENST00000381233 989 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
PDCD1Q15116 CCDC92B-201ENST00000575506 885 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
PDCD1Q15116 MIF4GD-211ENST00000580571 952 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
PDCD1Q15116 SLC35A3-213ENST00000638988 1286 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
PDCD1Q15116 ZMYND11-210ENST00000403354 1664 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
PDCD1Q15116 VEGFA-204ENST00000372064 2909 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
PDCD1Q15116 TRIM15-210ENST00000619857 2217 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
PDCD1Q15116 ADRM1-204ENST00000491935 1530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
PDCD1Q15116 AC055733.4-201ENST00000638462 1354 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
PDCD1Q15116 AR-204ENST00000504326 3615 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
PDCD1Q15116 RELT-202ENST00000393580 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
PDCD1Q15116 SLC25A24-204ENST00000569674 2357 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
PDCD1Q15116 NXN-201ENST00000336868 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
PDCD1Q15116 MAP1LC3A-201ENST00000360668 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
PDCD1Q15116 COL15A1-201ENST00000375001 5496 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
PDCD1Q15116 MAP3K15-201ENST00000338883 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
PDCD1Q15116 CLPB-202ENST00000340729 2071 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
PDCD1Q15116 RASD1-202ENST00000579152 1404 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
PDCD1Q15116 AC005224.4-201ENST00000583262 1652 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
PDCD1Q15116 HNRNPLL-204ENST00000409328 1908 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
PDCD1Q15116 MEIS3-212ENST00000561293 1918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
PDCD1Q15116 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
PDCD1Q15116 LINC01678-201ENST00000411694 863 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
PDCD1Q15116 RPLP2-207ENST00000530797 637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
PDCD1Q15116 FRMD8-208ENST00000531296 366 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
PDCD1Q15116 KRT18P14-201ENST00000534205 1250 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
PDCD1Q15116 TERF1P2-201ENST00000583350 1212 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
PDCD1Q15116 LGI4-206ENST00000591633 1113 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
PDCD1Q15116 TMEM8A-204ENST00000431232 3691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
PDCD1Q15116 NDUFAF3-202ENST00000326925 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
PDCD1Q15116 GPR35-204ENST00000430267 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
PDCD1Q15116 SMPD5-201ENST00000528912 1390 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
PDCD1Q15116 NES-201ENST00000368223 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
PDCD1Q15116 RAB1B-201ENST00000311481 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
PDCD1Q15116 ELOA3B-201ENST00000611323 1641 ntAPPRIS P1 BASIC17.74■□□□□ 0.43
PDCD1Q15116 ELOA3D-201ENST00000620881 1641 ntAPPRIS P1 BASIC17.74■□□□□ 0.43
PDCD1Q15116 SPI1-201ENST00000227163 1168 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
PDCD1Q15116 GZMM-201ENST00000264553 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
PDCD1Q15116 TSPAN2-201ENST00000369515 793 ntTSL 3 BASIC17.74■□□□□ 0.43
PDCD1Q15116 EIF6-203ENST00000374450 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
PDCD1Q15116 SDHAP3-201ENST00000436493 736 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
PDCD1Q15116 GATA3-AS1-204ENST00000438755 675 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
PDCD1Q15116 DIAPH1-203ENST00000389057 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
PDCD1Q15116 PRR7-201ENST00000323249 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
PDCD1Q15116 PRKCD-202ENST00000394729 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
PDCD1Q15116 CEBPE-201ENST00000206513 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
PDCD1Q15116 AC110285.2-201ENST00000571724 1565 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
PDCD1Q15116 RAB1A-202ENST00000409751 1333 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
PDCD1Q15116 ASCL2-201ENST00000331289 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
PDCD1Q15116 GPR157-201ENST00000377411 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
PDCD1Q15116 PML-217ENST00000567543 1404 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
PDCD1Q15116 PRKG2-207ENST00000628926 2623 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
PDCD1Q15116 UBA5-211ENST00000493720 2058 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
PDCD1Q15116 GAS2-202ENST00000454584 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
PDCD1Q15116 MRAS-202ENST00000423968 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
PDCD1Q15116 HDAC11-211ENST00000433119 2043 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
PDCD1Q15116 KRTAP17-1-201ENST00000334202 779 ntAPPRIS P1 BASIC17.73■□□□□ 0.43
PDCD1Q15116 AL355102.2-201ENST00000553811 600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
PDCD1Q15116 DUX4L2-201ENST00000561772 1275 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
PDCD1Q15116 DUX4-206ENST00000616166 1275 ntAPPRIS P2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
PDCD1Q15116 DUX4L6-201ENST00000626483 1275 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
PDCD1Q15116 DUX4L1-201ENST00000627662 1275 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
PDCD1Q15116 DUX4L8-201ENST00000629013 1275 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
PDCD1Q15116 DUX4L3-201ENST00000630187 1275 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
PDCD1Q15116 DUX4L7-201ENST00000630678 1275 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
PDCD1Q15116 DUX4L5-201ENST00000630834 1275 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
PDCD1Q15116 MED17-221ENST00000639724 2317 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
PDCD1Q15116 STX5-203ENST00000394690 1568 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
PDCD1Q15116 TPM1-208ENST00000404484 1568 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
PDCD1Q15116 ARL6IP4-220ENST00000543566 1591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
PDCD1Q15116 FUT4-201ENST00000358752 6059 ntAPPRIS P1 BASIC17.73■□□□□ 0.43
PDCD1Q15116 LRRC3B-201ENST00000396641 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
PDCD1Q15116 DLX2-201ENST00000234198 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
PDCD1Q15116 PLEKHM2-202ENST00000375799 4122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
PDCD1Q15116 MARCH9-201ENST00000266643 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
PDCD1Q15116 TALDO1-201ENST00000319006 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
PDCD1Q15116 ZNF821-202ENST00000425432 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
PDCD1Q15116 E4F1-206ENST00000565090 2028 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
PDCD1Q15116 UBR2-203ENST00000372903 2423 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
PDCD1Q15116 LINC01006-201ENST00000333319 2292 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
PDCD1Q15116 CLDN23-201ENST00000519106 2169 ntAPPRIS P1 BASIC17.72■□□□□ 0.43
PDCD1Q15116 KIRREL2-201ENST00000262625 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
PDCD1Q15116 PGAM5-204ENST00000543955 1773 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
PDCD1Q15116 HMCES-203ENST00000417226 1490 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
PDCD1Q15116 AC108002.2-201ENST00000519782 340 ntTSL 4 BASIC17.72■□□□□ 0.43
PDCD1Q15116 AC145207.2-202ENST00000576554 565 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
PDCD1Q15116 KCNMA1-224ENST00000618048 1269 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
PDCD1Q15116 KRT3-201ENST00000417996 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
PDCD1Q15116 NAAA-201ENST00000286733 1900 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
PDCD1Q15116 TMEM204-202ENST00000566264 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
PDCD1Q15116 LINC00969-219ENST00000453324 1439 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
PDCD1Q15116 DCAF8-211ENST00000475733 1426 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
PDCD1Q15116 ABLIM2-204ENST00000407564 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
PDCD1Q15116 GLI4-201ENST00000340042 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
PDCD1Q15116 PACRGL-227ENST00000513459 1773 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
PDCD1Q15116 MPST-205ENST00000404802 1453 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.71■□□□□ 0.43
PDCD1Q15116 CHRNA10-204ENST00000534359 1474 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
PDCD1Q15116 RAB24-202ENST00000303270 1385 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.1 ms