Protein–RNA interactions for Protein: Q149N8

SHPRH, E3 ubiquitin-protein ligase SHPRH, humanhuman

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Length 1,683 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SHPRHQ149N8 AL359710.1-201ENST00000427039 1544 ntTSL 2 BASIC28.97■■■□□ 2.23
SHPRHQ149N8 FOXN3-209ENST00000555353 1595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
SHPRHQ149N8 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC28.97■■■□□ 2.23
SHPRHQ149N8 PET117-201ENST00000432901 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
SHPRHQ149N8 CD44-222ENST00000526025 1052 ntTSL 2 BASIC28.96■■■□□ 2.23
SHPRHQ149N8 AL355075.4-201ENST00000554988 638 ntBASIC28.96■■■□□ 2.23
SHPRHQ149N8 KLF2-202ENST00000592003 564 ntTSL 3 BASIC28.96■■■□□ 2.23
SHPRHQ149N8 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
SHPRHQ149N8 CBLC-201ENST00000270279 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
SHPRHQ149N8 C22orf34-203ENST00000405854 1593 ntTSL 5 BASIC28.96■■■□□ 2.23
SHPRHQ149N8 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC28.96■■■□□ 2.23
SHPRHQ149N8 LINC01881-205ENST00000456398 1235 ntTSL 5 BASIC28.96■■■□□ 2.23
SHPRHQ149N8 AC136628.4-201ENST00000520758 535 ntTSL 2 BASIC28.96■■■□□ 2.23
SHPRHQ149N8 AL034346.1-201ENST00000568244 1277 ntBASIC28.96■■■□□ 2.23
SHPRHQ149N8 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.23
SHPRHQ149N8 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.23
SHPRHQ149N8 RNASET2-203ENST00000366855 1417 ntTSL 5 BASIC28.95■■■□□ 2.23
SHPRHQ149N8 KRT16P2-201ENST00000414673 1423 ntBASIC28.95■■■□□ 2.23
SHPRHQ149N8 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.23
SHPRHQ149N8 NPDC1-202ENST00000371601 1494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.23
SHPRHQ149N8 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC28.95■■■□□ 2.22
SHPRHQ149N8 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
SHPRHQ149N8 CLDND2-201ENST00000291715 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
SHPRHQ149N8 USF2-203ENST00000379134 648 ntTSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
SHPRHQ149N8 FBXL8-203ENST00000518148 1054 ntTSL 2 BASIC28.95■■■□□ 2.22
SHPRHQ149N8 PTCRA-204ENST00000616441 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.95■■■□□ 2.22
SHPRHQ149N8 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC28.95■■■□□ 2.22
SHPRHQ149N8 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.95■■■□□ 2.22
SHPRHQ149N8 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
SHPRHQ149N8 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC28.94■■■□□ 2.22
SHPRHQ149N8 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
SHPRHQ149N8 GAR1-201ENST00000226796 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
SHPRHQ149N8 GCHFR-201ENST00000260447 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
SHPRHQ149N8 MIEF2-207ENST00000578621 540 ntTSL 4 BASIC28.94■■■□□ 2.22
SHPRHQ149N8 AC120498.10-201ENST00000621827 505 ntBASIC28.94■■■□□ 2.22
SHPRHQ149N8 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
SHPRHQ149N8 MFSD3-201ENST00000301327 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
SHPRHQ149N8 KLF1-201ENST00000264834 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
SHPRHQ149N8 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
SHPRHQ149N8 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
SHPRHQ149N8 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
SHPRHQ149N8 TBC1D22A-206ENST00000407381 1949 ntTSL 5 BASIC28.93■■■□□ 2.22
SHPRHQ149N8 AGTRAP-203ENST00000376629 1100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
SHPRHQ149N8 TMPOP1-202ENST00000424642 1267 ntBASIC28.93■■■□□ 2.22
SHPRHQ149N8 OAF-202ENST00000531220 815 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.93■■■□□ 2.22
SHPRHQ149N8 MAPK9-206ENST00000425491 2266 ntTSL 5 BASIC28.93■■■□□ 2.22
SHPRHQ149N8 AKR7A2-201ENST00000235835 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
SHPRHQ149N8 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
SHPRHQ149N8 FASTK-212ENST00000482571 1764 ntTSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
SHPRHQ149N8 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC28.93■■■□□ 2.22
SHPRHQ149N8 CLDN3-201ENST00000395145 1274 ntAPPRIS P1 BASIC28.93■■■□□ 2.22
SHPRHQ149N8 AL355472.2-201ENST00000422958 438 ntBASIC28.93■■■□□ 2.22
SHPRHQ149N8 BX322234.1-201ENST00000444188 980 ntTSL 3 BASIC28.93■■■□□ 2.22
SHPRHQ149N8 BNIP3L-206ENST00000523515 915 ntTSL 2 BASIC28.93■■■□□ 2.22
SHPRHQ149N8 CD99-210ENST00000611428 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
SHPRHQ149N8 SNX21-213ENST00000614929 587 ntTSL 5 BASIC28.93■■■□□ 2.22
SHPRHQ149N8 SCARB1-211ENST00000546215 1597 ntTSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
SHPRHQ149N8 ACAT1-201ENST00000265838 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
SHPRHQ149N8 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC28.92■■■□□ 2.22
SHPRHQ149N8 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
SHPRHQ149N8 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
SHPRHQ149N8 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC28.92■■■□□ 2.22
SHPRHQ149N8 NEURL3-201ENST00000310865 1710 ntTSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
SHPRHQ149N8 TGIF1-207ENST00000407501 1585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.92■■■□□ 2.22
SHPRHQ149N8 FTCDNL1-202ENST00000420128 1021 ntTSL 5 BASIC28.92■■■□□ 2.22
SHPRHQ149N8 C2orf69P4-201ENST00000565394 541 ntBASIC28.92■■■□□ 2.22
SHPRHQ149N8 WDR88-203ENST00000592765 651 ntTSL 5 BASIC28.92■■■□□ 2.22
SHPRHQ149N8 CD177P1-201ENST00000606252 935 ntBASIC28.92■■■□□ 2.22
SHPRHQ149N8 FP565260.3-201ENST00000612610 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
SHPRHQ149N8 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
SHPRHQ149N8 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
SHPRHQ149N8 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC28.91■■■□□ 2.22
SHPRHQ149N8 AC092368.3-202ENST00000574180 1591 ntBASIC28.91■■■□□ 2.22
SHPRHQ149N8 IFNAR2-204ENST00000382264 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
SHPRHQ149N8 LIME1-201ENST00000309546 1178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
SHPRHQ149N8 SPATA2L-202ENST00000335360 1001 ntTSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
SHPRHQ149N8 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.91■■■□□ 2.22
SHPRHQ149N8 AL049637.2-201ENST00000641778 930 ntBASIC28.91■■■□□ 2.22
SHPRHQ149N8 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
SHPRHQ149N8 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.91■■■□□ 2.22
SHPRHQ149N8 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.91■■■□□ 2.22
SHPRHQ149N8 NFIX-205ENST00000585575 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.91■■■□□ 2.22
SHPRHQ149N8 PRKAA1-202ENST00000354209 1918 ntTSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
SHPRHQ149N8 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC28.9■■■□□ 2.22
SHPRHQ149N8 LINC00708-201ENST00000428165 916 ntTSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
SHPRHQ149N8 AL390728.5-201ENST00000428687 706 ntTSL 3 BASIC28.9■■■□□ 2.22
SHPRHQ149N8 WDR86-AS1-203ENST00000480632 704 ntTSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
SHPRHQ149N8 CXCL2-202ENST00000508487 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
SHPRHQ149N8 SOX15-202ENST00000538513 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
SHPRHQ149N8 SOX15-203ENST00000570788 1093 ntBASIC28.9■■■□□ 2.22
SHPRHQ149N8 TRAPPC6A-201ENST00000006275 805 ntTSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
SHPRHQ149N8 PACRGL-227ENST00000513459 1773 ntTSL 5 BASIC28.9■■■□□ 2.22
SHPRHQ149N8 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
SHPRHQ149N8 ALG1-202ENST00000544428 1419 ntTSL 2 BASIC28.9■■■□□ 2.22
SHPRHQ149N8 KRT17P2-201ENST00000300992 1314 ntBASIC28.9■■■□□ 2.22
SHPRHQ149N8 TRIM73-202ENST00000430211 1321 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.9■■■□□ 2.22
SHPRHQ149N8 PTCRA-201ENST00000304672 1080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
SHPRHQ149N8 SUV39H2-204ENST00000378325 1292 ntTSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
SHPRHQ149N8 ISG20-202ENST00000379224 540 ntTSL 3 BASIC28.89■■■□□ 2.22
SHPRHQ149N8 PTCRA-202ENST00000441198 1005 ntTSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
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