Protein–RNA interactions for Protein: Q14993

COL19A1, Collagen alpha-1(XIX) chain, humanhuman

Predictions only

Length 1,142 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COL19A1Q14993 GAL3ST4-204ENST00000423751 1695 ntTSL 3 BASIC21.8■■□□□ 1.08
COL19A1Q14993 ACSL1-205ENST00000504900 1583 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
COL19A1Q14993 KCNE5-201ENST00000372101 1473 ntAPPRIS P1 BASIC21.8■■□□□ 1.08
COL19A1Q14993 SUGCT-202ENST00000401647 1369 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
COL19A1Q14993 SIVA1-203ENST00000535554 1244 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
COL19A1Q14993 TMEM191C-212ENST00000536718 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
COL19A1Q14993 SLC25A11-202ENST00000544061 952 ntTSL 3 BASIC21.8■■□□□ 1.08
COL19A1Q14993 TMEM191B-203ENST00000613597 366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
COL19A1Q14993 AL023875.1-201ENST00000640777 796 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
COL19A1Q14993 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
COL19A1Q14993 AC091729.3-201ENST00000423008 1401 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
COL19A1Q14993 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
COL19A1Q14993 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
COL19A1Q14993 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
COL19A1Q14993 SPATA25-201ENST00000372519 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
COL19A1Q14993 ANKRD54-204ENST00000411961 946 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
COL19A1Q14993 AC239809.2-201ENST00000415381 517 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
COL19A1Q14993 LINC00969-218ENST00000452844 583 ntTSL 3 BASIC21.79■■□□□ 1.08
COL19A1Q14993 LINC00969-221ENST00000457233 1279 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
COL19A1Q14993 KRT18P35-201ENST00000510488 1269 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
COL19A1Q14993 CNOT8-224ENST00000523698 862 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
COL19A1Q14993 CBLN3-202ENST00000555436 718 ntTSL 3 BASIC21.79■■□□□ 1.08
COL19A1Q14993 UBL5-202ENST00000586895 432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
COL19A1Q14993 AC007786.1-201ENST00000587859 709 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
COL19A1Q14993 AL353708.3-201ENST00000610272 989 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
COL19A1Q14993 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
COL19A1Q14993 PADI2-201ENST00000375481 1607 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
COL19A1Q14993 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
COL19A1Q14993 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC21.79■■□□□ 1.08
COL19A1Q14993 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
COL19A1Q14993 TUSC2-201ENST00000232496 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
COL19A1Q14993 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
COL19A1Q14993 NDUFV3-202ENST00000354250 1575 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
COL19A1Q14993 EGFR-204ENST00000420316 1570 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
COL19A1Q14993 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
COL19A1Q14993 LEF1-203ENST00000438313 1488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
COL19A1Q14993 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
COL19A1Q14993 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
COL19A1Q14993 SERPINB6-204ENST00000380529 1370 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
COL19A1Q14993 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
COL19A1Q14993 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
COL19A1Q14993 ACP1-205ENST00000407983 703 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
COL19A1Q14993 TMPOP1-202ENST00000424642 1267 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
COL19A1Q14993 AC007322.3-201ENST00000426526 701 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
COL19A1Q14993 AL590666.2-201ENST00000448869 758 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
COL19A1Q14993 CDKN2A-205ENST00000479692 544 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
COL19A1Q14993 CA3-AS1-201ENST00000517697 559 ntTSL 4 BASIC21.78■■□□□ 1.08
COL19A1Q14993 CES1P1-204ENST00000574030 877 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
COL19A1Q14993 HOXA11-AS-204ENST00000522674 1549 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
COL19A1Q14993 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
COL19A1Q14993 RARG-201ENST00000338561 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
COL19A1Q14993 DDRGK1-201ENST00000354488 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
COL19A1Q14993 SHISA4-201ENST00000362011 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
COL19A1Q14993 AC027031.2-201ENST00000521369 1318 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
COL19A1Q14993 POFUT1-201ENST00000375730 1507 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
COL19A1Q14993 SLC2A7-201ENST00000400906 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
COL19A1Q14993 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
COL19A1Q14993 PYCR1-216ENST00000619204 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
COL19A1Q14993 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
COL19A1Q14993 TSTD1-201ENST00000318289 626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
COL19A1Q14993 NDUFB1-201ENST00000329559 528 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
COL19A1Q14993 AC008443.1-203ENST00000505151 886 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
COL19A1Q14993 OPA3-203ENST00000544371 1146 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
COL19A1Q14993 AC020922.2-201ENST00000596786 359 ntTSL 4 BASIC21.77■■□□□ 1.08
COL19A1Q14993 AL353593.2-202ENST00000602947 550 ntTSL 4 BASIC21.77■■□□□ 1.08
COL19A1Q14993 AC120498.8-201ENST00000614275 531 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
COL19A1Q14993 SYNC-201ENST00000373484 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
COL19A1Q14993 DBNL-207ENST00000440166 1415 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
COL19A1Q14993 MADCAM1-201ENST00000215637 1572 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
COL19A1Q14993 LRP5L-203ENST00000444995 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
COL19A1Q14993 TSTA3-201ENST00000425753 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
COL19A1Q14993 PPCS-203ENST00000372561 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
COL19A1Q14993 SUV39H2-204ENST00000378325 1292 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
COL19A1Q14993 METTL21A-206ENST00000432416 869 ntTSL 3 BASIC21.76■■□□□ 1.07
COL19A1Q14993 RNF135-204ENST00000443677 1261 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
COL19A1Q14993 THEM4-205ENST00000489410 643 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
COL19A1Q14993 AC015712.2-203ENST00000560461 688 ntTSL 3 BASIC21.76■■□□□ 1.07
COL19A1Q14993 HPCAL1-201ENST00000307845 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
COL19A1Q14993 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
COL19A1Q14993 TPD52L1-201ENST00000304877 1468 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
COL19A1Q14993 BIRC7-202ENST00000342412 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
COL19A1Q14993 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
COL19A1Q14993 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
COL19A1Q14993 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
COL19A1Q14993 CAV3-201ENST00000343849 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
COL19A1Q14993 MEIS3-202ENST00000441740 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
COL19A1Q14993 LINC01743-201ENST00000366308 964 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
COL19A1Q14993 CCDC103-202ENST00000410006 921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
COL19A1Q14993 AL133410.2-201ENST00000425499 696 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
COL19A1Q14993 ZNRF2P2-202ENST00000442865 590 ntTSL 4 BASIC21.75■■□□□ 1.07
COL19A1Q14993 PENK-204ENST00000518770 863 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
COL19A1Q14993 AZIN1-AS1-215ENST00000522939 644 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
COL19A1Q14993 PRKY-204ENST00000533551 1019 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
COL19A1Q14993 C2orf69P4-201ENST00000565394 541 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
COL19A1Q14993 RN7SL850P-201ENST00000579959 291 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
COL19A1Q14993 NT5C-211ENST00000582170 653 ntTSL 3 BASIC21.75■■□□□ 1.07
COL19A1Q14993 C17orf62-238ENST00000585064 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
COL19A1Q14993 GCH1-202ENST00000395514 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
COL19A1Q14993 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
COL19A1Q14993 MGAT4D-208ENST00000515354 1806 ntTSL 3 BASIC21.75■■□□□ 1.07
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