Protein–RNA interactions for Protein: Q14549

GBX1, Homeobox protein GBX-1, humanhuman

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Length 363 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GBX1Q14549 OSR2-203ENST00000457907 2126 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
GBX1Q14549 LINC00605-201ENST00000514902 1558 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
GBX1Q14549 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
GBX1Q14549 SPI1-202ENST00000378538 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
GBX1Q14549 RBM17P2-201ENST00000616397 1405 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
GBX1Q14549 C7orf49-213ENST00000617987 1727 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
GBX1Q14549 ME3-201ENST00000323418 1068 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
GBX1Q14549 HSCB-202ENST00000398941 955 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
GBX1Q14549 AC099681.3-201ENST00000421500 939 ntTSL 4 BASIC20.37■□□□□ 0.85
GBX1Q14549 AC012313.1-204ENST00000444227 462 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
GBX1Q14549 AC245052.3-201ENST00000450182 901 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
GBX1Q14549 ATP6V0B-205ENST00000472174 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
GBX1Q14549 TMEM206-205ENST00000535273 2119 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
GBX1Q14549 FGF7P6-201ENST00000377614 1890 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
GBX1Q14549 BX664615.2-202ENST00000639056 1888 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
GBX1Q14549 SPR-201ENST00000234454 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
GBX1Q14549 BX322557.1-202ENST00000400362 1460 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
GBX1Q14549 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
GBX1Q14549 PACSIN3-201ENST00000298838 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
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GBX1Q14549 PTDSS2-201ENST00000308020 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
GBX1Q14549 CCDC88B-203ENST00000359902 2326 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
GBX1Q14549 SLC9A3R1-201ENST00000262613 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
GBX1Q14549 HCFC1R1-201ENST00000248089 965 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
GBX1Q14549 SMCO4-201ENST00000298966 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
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GBX1Q14549 AC006015.1-201ENST00000429970 570 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
GBX1Q14549 LYRM9-206ENST00000508862 807 ntTSL 3 BASIC20.36■□□□□ 0.85
GBX1Q14549 HCFC1R1-207ENST00000574980 845 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
GBX1Q14549 ORAI3-201ENST00000318663 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
GBX1Q14549 GJC2-201ENST00000366714 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
GBX1Q14549 THOC3-201ENST00000265097 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
GBX1Q14549 AKT2-210ENST00000424901 5170 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
GBX1Q14549 RELL2-207ENST00000521367 1780 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
GBX1Q14549 SGTA-201ENST00000221566 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
GBX1Q14549 SLC16A10-202ENST00000368851 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
GBX1Q14549 BAG4-202ENST00000432471 1943 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
GBX1Q14549 SPINT2-202ENST00000454580 1367 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
GBX1Q14549 OTUB1-211ENST00000543004 1647 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
GBX1Q14549 FAM102B-201ENST00000370035 5600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
GBX1Q14549 SLC43A3-225ENST00000533524 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
GBX1Q14549 LIN7B-201ENST00000221459 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
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GBX1Q14549 TNFRSF18-202ENST00000379265 705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
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GBX1Q14549 INTS11-205ENST00000429572 1104 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
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GBX1Q14549 MVB12A-212ENST00000543795 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
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GBX1Q14549 THEM6-201ENST00000336138 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
GBX1Q14549 ZNF331-202ENST00000411977 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
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GBX1Q14549 GPR137-203ENST00000411458 1495 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
GBX1Q14549 KCNQ1-202ENST00000335475 2159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
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GBX1Q14549 HDAC11-211ENST00000433119 2043 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
GBX1Q14549 AC090360.1-201ENST00000569722 2218 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
GBX1Q14549 FAM3A-208ENST00000419205 1763 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
GBX1Q14549 SSTR3-202ENST00000617123 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
GBX1Q14549 TMEM204-202ENST00000566264 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
GBX1Q14549 PCMT1-201ENST00000367378 1293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
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GBX1Q14549 DTX3-201ENST00000337737 2029 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
GBX1Q14549 CD7-207ENST00000584284 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
GBX1Q14549 MAG-202ENST00000392213 2390 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
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GBX1Q14549 FAM193B-217ENST00000514747 2913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
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GBX1Q14549 TPD52L1-201ENST00000304877 1468 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
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GBX1Q14549 LINC02199-202ENST00000510067 1008 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
GBX1Q14549 ABHD1-207ENST00000621324 1078 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
GBX1Q14549 PLAGL1-207ENST00000417959 1645 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
GBX1Q14549 PLK5-205ENST00000642079 1969 ntBASIC20.33■□□□□ 0.84
GBX1Q14549 SLC38A7-205ENST00000564010 1437 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.84
GBX1Q14549 EPHX3-202ENST00000435261 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
GBX1Q14549 LAG3-202ENST00000441671 1576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
GBX1Q14549 FDFT1-210ENST00000525954 1890 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.84
GBX1Q14549 FOXD4L3-201ENST00000342833 2039 ntAPPRIS P1 BASIC20.32■□□□□ 0.84
GBX1Q14549 C3orf18-205ENST00000441239 1490 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
GBX1Q14549 ABLIM2-204ENST00000407564 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
GBX1Q14549 FAM118B-209ENST00000533050 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
GBX1Q14549 KDF1-201ENST00000320567 1793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
GBX1Q14549 AC091799.1-201ENST00000422823 811 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
GBX1Q14549 GXYLT1P2-201ENST00000433312 1230 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
GBX1Q14549 COL19A1-203ENST00000478620 589 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
GBX1Q14549 AC137761.2-201ENST00000561729 223 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
GBX1Q14549 LINC01976-201ENST00000565120 434 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
GBX1Q14549 AC145350.3-201ENST00000569033 163 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
GBX1Q14549 AC007114.1-201ENST00000576871 713 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
GBX1Q14549 PDCD5-204ENST00000586035 601 ntTSL 3 BASIC20.32■□□□□ 0.84
GBX1Q14549 CAPNS1-205ENST00000588780 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
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