Protein–RNA interactions for Protein: Q14406

CSHL1, Chorionic somatomammotropin hormone-like 1, humanhuman

Predictions only

Length 222 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSHL1Q14406 SLC43A3-225ENST00000533524 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
CSHL1Q14406 KCTD13-207ENST00000568000 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
CSHL1Q14406 PMS1-222ENST00000639501 2506 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
CSHL1Q14406 ADAM9-203ENST00000466936 2053 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
CSHL1Q14406 LYN-202ENST00000519728 2297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
CSHL1Q14406 NTN4-207ENST00000553059 1818 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
CSHL1Q14406 CCNE1-201ENST00000262643 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
CSHL1Q14406 SMIM10L2A-201ENST00000417443 5230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
CSHL1Q14406 MFF-207ENST00000409565 1548 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
CSHL1Q14406 CERS1-202ENST00000542296 1947 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
CSHL1Q14406 ANKLE1-204ENST00000594072 2294 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
CSHL1Q14406 SLC35E4-202ENST00000406566 2081 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
CSHL1Q14406 RXFP3-201ENST00000330120 1852 ntAPPRIS P1 BASIC20.59■□□□□ 0.89
CSHL1Q14406 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
CSHL1Q14406 AC092675.2-201ENST00000413274 541 ntTSL 4 BASIC20.59■□□□□ 0.89
CSHL1Q14406 PRKCQ-AS1-204ENST00000455810 920 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
CSHL1Q14406 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC20.59■□□□□ 0.89
CSHL1Q14406 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC20.59■□□□□ 0.89
CSHL1Q14406 EEF1DP3-203ENST00000566025 782 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
CSHL1Q14406 TPRG1LP1-201ENST00000598702 760 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
CSHL1Q14406 POLR2E-214ENST00000619917 932 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
CSHL1Q14406 UBR2-203ENST00000372903 2423 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
CSHL1Q14406 GPAA1-202ENST00000361036 1840 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
CSHL1Q14406 NDUFAF6-203ENST00000396124 1798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
CSHL1Q14406 UGP2-201ENST00000337130 2338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
CSHL1Q14406 BCAT2-207ENST00000597011 1579 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
CSHL1Q14406 FBLN5-202ENST00000342058 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
CSHL1Q14406 DYRK2-202ENST00000344096 8912 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
CSHL1Q14406 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
CSHL1Q14406 NEK3-208ENST00000618534 2414 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
CSHL1Q14406 RCN3-201ENST00000270645 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
CSHL1Q14406 NEUROG1-201ENST00000314744 1668 ntAPPRIS P1 BASIC20.58■□□□□ 0.89
CSHL1Q14406 KREMEN2-201ENST00000303746 2326 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
CSHL1Q14406 TMED4-203ENST00000457408 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
CSHL1Q14406 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
CSHL1Q14406 PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 1133 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
CSHL1Q14406 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
CSHL1Q14406 AC053503.5-201ENST00000601508 636 ntBASIC20.58■□□□□ 0.89
CSHL1Q14406 MIR6084-201ENST00000622012 110 ntBASIC20.58■□□□□ 0.89
CSHL1Q14406 WDSUB1-202ENST00000359774 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.88
CSHL1Q14406 FAM72B-202ENST00000369390 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
CSHL1Q14406 HOXA11-AS-204ENST00000522674 1549 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
CSHL1Q14406 LAYN-202ENST00000375615 1836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
CSHL1Q14406 AC092667.1-201ENST00000434301 2586 ntBASIC20.57■□□□□ 0.88
CSHL1Q14406 HLA-G-204ENST00000376828 1490 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
CSHL1Q14406 RAVER2-201ENST00000294428 4398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
CSHL1Q14406 BICRA-204ENST00000614245 5697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
CSHL1Q14406 DTX3-201ENST00000337737 2029 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
CSHL1Q14406 DUSP28-201ENST00000343217 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
CSHL1Q14406 NUDT14-202ENST00000392568 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
CSHL1Q14406 CHTF8-210ENST00000523421 766 ntTSL 3 BASIC20.57■□□□□ 0.88
CSHL1Q14406 KCNMA1-252ENST00000639120 2308 ntTSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
CSHL1Q14406 SMIM10L2B-201ENST00000433425 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
CSHL1Q14406 TPCN2-209ENST00000637504 2736 ntTSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
CSHL1Q14406 DYNC1I1-211ENST00000537881 2146 ntTSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
CSHL1Q14406 WAS-201ENST00000376701 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
CSHL1Q14406 RNH1-222ENST00000533410 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
CSHL1Q14406 HSF4-215ENST00000521374 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
CSHL1Q14406 DMRTA2-202ENST00000418121 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
CSHL1Q14406 KANK3-203ENST00000593649 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
CSHL1Q14406 EPO-201ENST00000252723 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
CSHL1Q14406 AC135048.1-201ENST00000566056 1318 ntTSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
CSHL1Q14406 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
CSHL1Q14406 AC061975.6-201ENST00000579045 1553 ntBASIC20.56■□□□□ 0.88
CSHL1Q14406 AP004608.1-201ENST00000531319 1402 ntTSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
CSHL1Q14406 RLBP1-201ENST00000268125 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
CSHL1Q14406 AC090360.1-201ENST00000569722 2218 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
CSHL1Q14406 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
CSHL1Q14406 GLI4-210ENST00000523522 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
CSHL1Q14406 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
CSHL1Q14406 GLIPR2-203ENST00000396613 1917 ntTSL 4 BASIC20.56■□□□□ 0.88
CSHL1Q14406 RNF32-207ENST00000405335 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
CSHL1Q14406 C19orf35-201ENST00000342063 2574 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
CSHL1Q14406 CNTNAP3B-212ENST00000617422 2170 ntTSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
CSHL1Q14406 GATA6-AS1-202ENST00000583490 1788 ntTSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
CSHL1Q14406 NF2-201ENST00000334961 2020 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
CSHL1Q14406 NAA20-203ENST00000398602 1604 ntTSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
CSHL1Q14406 HGH1-201ENST00000347708 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
CSHL1Q14406 CELF2-211ENST00000632065 1952 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
CSHL1Q14406 TUBGCP3-204ENST00000464139 2461 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
CSHL1Q14406 ILKAP-211ENST00000612675 1335 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
CSHL1Q14406 PKIB-206ENST00000392490 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
CSHL1Q14406 UBE2H-201ENST00000355621 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
CSHL1Q14406 TEAD2-210ENST00000601519 2167 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
CSHL1Q14406 ESRRA-202ENST00000405666 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
CSHL1Q14406 NAA10-208ENST00000464845 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
CSHL1Q14406 SLC25A22-216ENST00000531214 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
CSHL1Q14406 PPCS-202ENST00000372560 793 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
CSHL1Q14406 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
CSHL1Q14406 LRRC3C-201ENST00000377924 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.55■□□□□ 0.88
CSHL1Q14406 IL17RC-205ENST00000413608 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
CSHL1Q14406 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC20.55■□□□□ 0.88
CSHL1Q14406 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
CSHL1Q14406 ARHGAP24-206ENST00000503995 1273 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
CSHL1Q14406 FP565260.3-201ENST00000612610 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
CSHL1Q14406 CPT2-209ENST00000636935 803 ntTSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
CSHL1Q14406 DACT2-203ENST00000607983 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
CSHL1Q14406 SMIM3-201ENST00000526627 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
CSHL1Q14406 EPHA8-202ENST00000374644 1802 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
CSHL1Q14406 EMILIN2-201ENST00000254528 5910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 60.8 ms