Protein–RNA interactions for Protein: Q14139

UBE4A, Ubiquitin conjugation factor E4 A, humanhuman

Predictions only

Length 1,066 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBE4AQ14139 CLDN5-204ENST00000618236 1374 ntAPPRIS P1 BASIC25.41■■□□□ 1.66
UBE4AQ14139 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
UBE4AQ14139 ZGPAT-204ENST00000369967 1890 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
UBE4AQ14139 BCAT2-208ENST00000598162 1329 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
UBE4AQ14139 NELFE-202ENST00000375429 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
UBE4AQ14139 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
UBE4AQ14139 RPLP0-201ENST00000228306 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
UBE4AQ14139 ASMTL-AS1-203ENST00000425740 840 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
UBE4AQ14139 TMEM9-209ENST00000485839 938 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
UBE4AQ14139 PLEKHB1-216ENST00000543085 632 ntTSL 3 BASIC25.4■■□□□ 1.66
UBE4AQ14139 DDN-AS1-201ENST00000547395 858 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
UBE4AQ14139 AF274858.3-202ENST00000569906 755 ntTSL 3 BASIC25.4■■□□□ 1.66
UBE4AQ14139 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
UBE4AQ14139 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
UBE4AQ14139 DCTD-202ENST00000438320 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
UBE4AQ14139 THOC3-201ENST00000265097 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
UBE4AQ14139 NAPSA-201ENST00000253719 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
UBE4AQ14139 ENTPD2-201ENST00000312665 1500 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
UBE4AQ14139 SNX21-201ENST00000342644 1506 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
UBE4AQ14139 C20orf196-202ENST00000378979 585 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
UBE4AQ14139 AC092143.2-201ENST00000554623 985 ntTSL 3 BASIC25.39■■□□□ 1.66
UBE4AQ14139 CLN6-207ENST00000566347 981 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
UBE4AQ14139 FAM32A-205ENST00000589852 1168 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
UBE4AQ14139 C7orf49-213ENST00000617987 1727 ntTSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.65
UBE4AQ14139 AL645608.1-202ENST00000417705 1389 ntTSL 3 BASIC25.39■■□□□ 1.65
UBE4AQ14139 BAG4-202ENST00000432471 1943 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
UBE4AQ14139 AC009014.1-201ENST00000607574 1667 ntAPPRIS P1 BASIC25.39■■□□□ 1.65
UBE4AQ14139 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
UBE4AQ14139 SLC25A22-216ENST00000531214 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.65
UBE4AQ14139 SSTR3-202ENST00000617123 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
UBE4AQ14139 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
UBE4AQ14139 HLA-C-201ENST00000376228 1536 ntAPPRIS P2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
UBE4AQ14139 CKLF-201ENST00000264001 669 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
UBE4AQ14139 TPSAB1-201ENST00000338844 1175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
UBE4AQ14139 STPG4-207ENST00000445927 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
UBE4AQ14139 C14orf28-204ENST00000557112 1097 ntTSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
UBE4AQ14139 ANAPC11-208ENST00000572851 686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
UBE4AQ14139 AL589743.5-201ENST00000616611 1050 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
UBE4AQ14139 INO80E-214ENST00000620599 515 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
UBE4AQ14139 SUGCT-202ENST00000401647 1369 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
UBE4AQ14139 ACBD4-202ENST00000376955 1453 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
UBE4AQ14139 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
UBE4AQ14139 KATNAL2-208ENST00000592005 1348 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
UBE4AQ14139 NOXO1-202ENST00000356120 1539 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
UBE4AQ14139 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
UBE4AQ14139 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
UBE4AQ14139 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
UBE4AQ14139 AC116050.2-201ENST00000612102 1779 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
UBE4AQ14139 PRSS33-202ENST00000570702 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
UBE4AQ14139 MAP1LC3A-201ENST00000360668 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
UBE4AQ14139 IKBIP-203ENST00000393042 1368 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
UBE4AQ14139 GCK-205ENST00000437084 1385 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
UBE4AQ14139 MRPL12-201ENST00000333676 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
UBE4AQ14139 KRT18P68-201ENST00000392293 1000 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
UBE4AQ14139 CCDC74B-203ENST00000409128 789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
UBE4AQ14139 RPL29-209ENST00000495383 713 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
UBE4AQ14139 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
UBE4AQ14139 CCNL1-203ENST00000461804 1998 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
UBE4AQ14139 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
UBE4AQ14139 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
UBE4AQ14139 GNB2-206ENST00000424361 1478 ntTSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
UBE4AQ14139 PYCR1-216ENST00000619204 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
UBE4AQ14139 THAP7-201ENST00000215742 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
UBE4AQ14139 NENF-201ENST00000366988 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
UBE4AQ14139 GAS7-202ENST00000396115 929 ntTSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
UBE4AQ14139 NME6-213ENST00000451657 871 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
UBE4AQ14139 ZNF346-203ENST00000503425 1191 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
UBE4AQ14139 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
UBE4AQ14139 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
UBE4AQ14139 PRAF2-202ENST00000553851 1334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
UBE4AQ14139 TUSC2-201ENST00000232496 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
UBE4AQ14139 TPM1-208ENST00000404484 1568 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
UBE4AQ14139 SPOP-206ENST00000504102 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
UBE4AQ14139 SERF1A-201ENST00000317633 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
UBE4AQ14139 RBP4-201ENST00000371464 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
UBE4AQ14139 ANKRD39-201ENST00000393537 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
UBE4AQ14139 AC114730.1-201ENST00000400768 472 ntTSL 4 BASIC25.35■■□□□ 1.65
UBE4AQ14139 GATS-209ENST00000454084 1030 ntTSL 3 BASIC25.35■■□□□ 1.65
UBE4AQ14139 ADM-205ENST00000528544 586 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
UBE4AQ14139 IGFBP6-203ENST00000548547 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
UBE4AQ14139 RFXAP-201ENST00000255476 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
UBE4AQ14139 RRNAD1-202ENST00000368218 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.35■■□□□ 1.65
UBE4AQ14139 HOXA4-202ENST00000428284 1595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
UBE4AQ14139 QTRT1-201ENST00000250237 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
UBE4AQ14139 TMPRSS5-208ENST00000544476 1320 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
UBE4AQ14139 AK4-208ENST00000546702 1335 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
UBE4AQ14139 PAGR1-201ENST00000320330 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
UBE4AQ14139 CYP21A1P-202ENST00000354927 1481 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
UBE4AQ14139 NEURL3-204ENST00000451794 1461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
UBE4AQ14139 PYURF-201ENST00000273968 1361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
UBE4AQ14139 ST3GAL4-201ENST00000227495 1790 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
UBE4AQ14139 EIF2B4-211ENST00000616081 1754 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
UBE4AQ14139 ETHE1-201ENST00000292147 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
UBE4AQ14139 AC007285.1-201ENST00000422239 893 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
UBE4AQ14139 OTUB1-203ENST00000428192 1296 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
UBE4AQ14139 AC090527.2-201ENST00000564080 1060 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.34■■□□□ 1.65
UBE4AQ14139 RPS15-206ENST00000589656 473 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
UBE4AQ14139 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
UBE4AQ14139 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
UBE4AQ14139 CEBPE-201ENST00000206513 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
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