Protein–RNA interactions for Protein: Q14134

TRIM29, Tripartite motif-containing protein 29, humanhuman

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Length 588 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM29Q14134 TUSC3-203ENST00000503731 1498 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
TRIM29Q14134 DNAJB5-201ENST00000312316 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
TRIM29Q14134 PAQR6-213ENST00000612424 2037 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
TRIM29Q14134 NAA10-208ENST00000464845 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
TRIM29Q14134 UCHL1-201ENST00000284440 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
TRIM29Q14134 SLC35A2-205ENST00000376529 865 ntTSL 3 BASIC24.07■■□□□ 1.44
TRIM29Q14134 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
TRIM29Q14134 UCHL1-210ENST00000512788 785 ntTSL 3 BASIC24.07■■□□□ 1.44
TRIM29Q14134 AP006621.1-202ENST00000528982 464 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
TRIM29Q14134 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
TRIM29Q14134 AP001160.5-201ENST00000636508 485 ntAPPRIS P1 BASIC24.07■■□□□ 1.44
TRIM29Q14134 AC004854.2-201ENST00000608450 1441 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
TRIM29Q14134 DUX4-204ENST00000569241 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
TRIM29Q14134 TPD52L1-203ENST00000368402 1308 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
TRIM29Q14134 D2HGDH-201ENST00000321264 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
TRIM29Q14134 HHIPL1-202ENST00000357223 2241 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
TRIM29Q14134 TNIP1-205ENST00000518977 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
TRIM29Q14134 TMEM204-201ENST00000253934 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
TRIM29Q14134 UCN-201ENST00000296099 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
TRIM29Q14134 NAA20-201ENST00000310450 920 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
TRIM29Q14134 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
TRIM29Q14134 PYY-201ENST00000360085 1053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
TRIM29Q14134 LINC01816-201ENST00000414141 662 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
TRIM29Q14134 PLCL1-201ENST00000428675 5125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
TRIM29Q14134 KRT16P2-201ENST00000414673 1423 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
TRIM29Q14134 FOXD4L3-201ENST00000342833 2039 ntAPPRIS P1 BASIC24.06■■□□□ 1.44
TRIM29Q14134 RSPO1-201ENST00000356545 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
TRIM29Q14134 KCNK6-201ENST00000263372 5722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
TRIM29Q14134 FAM3A-208ENST00000419205 1763 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
TRIM29Q14134 SLC25A22-216ENST00000531214 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
TRIM29Q14134 SLC16A10-202ENST00000368851 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
TRIM29Q14134 FAM118B-209ENST00000533050 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
TRIM29Q14134 HOXA11-AS-204ENST00000522674 1549 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
TRIM29Q14134 FAM20C-201ENST00000313766 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
TRIM29Q14134 SPRN-201ENST00000414069 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
TRIM29Q14134 AC243965.2-201ENST00000612576 2671 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
TRIM29Q14134 GSPT1-203ENST00000439887 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
TRIM29Q14134 POMGNT2-202ENST00000441964 2531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.05■■□□□ 1.44
TRIM29Q14134 PRR25-201ENST00000301698 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
TRIM29Q14134 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
TRIM29Q14134 YBEY-204ENST00000397692 433 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
TRIM29Q14134 ALG1-201ENST00000262374 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
TRIM29Q14134 MIF4GD-202ENST00000325102 1306 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
TRIM29Q14134 NR1H2-204ENST00000593926 1828 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
TRIM29Q14134 RELA-201ENST00000308639 2681 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
TRIM29Q14134 SNX27-204ENST00000458013 6403 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
TRIM29Q14134 TFAP2A-202ENST00000379608 2576 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
TRIM29Q14134 HFE2-202ENST00000357836 2123 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
TRIM29Q14134 KCNH2-201ENST00000262186 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
TRIM29Q14134 NKX6-1-202ENST00000515820 2194 ntTSL 3 BASIC24.04■■□□□ 1.44
TRIM29Q14134 RAP1B-202ENST00000341355 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.04■■□□□ 1.44
TRIM29Q14134 BRD2-214ENST00000496118 735 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
TRIM29Q14134 YJEFN3-203ENST00000514277 995 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
TRIM29Q14134 MIF4GD-211ENST00000580571 952 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
TRIM29Q14134 AC093762.3-201ENST00000641918 318 ntAPPRIS P1 BASIC24.04■■□□□ 1.44
TRIM29Q14134 CASTOR1-201ENST00000404953 1460 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
TRIM29Q14134 FGFR2-211ENST00000369059 3003 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
TRIM29Q14134 STRADB-201ENST00000194530 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
TRIM29Q14134 NNT-AS1-206ENST00000606697 1945 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
TRIM29Q14134 NDUFAF3-202ENST00000326925 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
TRIM29Q14134 KCNQ5-207ENST00000403813 6539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
TRIM29Q14134 HRASLS5-201ENST00000301790 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
TRIM29Q14134 AC012414.4-201ENST00000560839 1074 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
TRIM29Q14134 AC060814.5-201ENST00000630916 1074 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
TRIM29Q14134 AC121338.2-201ENST00000622535 1744 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
TRIM29Q14134 EPN1-201ENST00000085079 2355 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
TRIM29Q14134 KCNQ1-202ENST00000335475 2159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
TRIM29Q14134 CCNE1-201ENST00000262643 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
TRIM29Q14134 PHOSPHO1-206ENST00000514112 1587 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
TRIM29Q14134 CFAP97-205ENST00000514798 2895 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
TRIM29Q14134 HDAC11-211ENST00000433119 2043 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
TRIM29Q14134 SMAGP-205ENST00000603864 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
TRIM29Q14134 TMEM54-202ENST00000373463 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
TRIM29Q14134 KRT19P1-201ENST00000405746 1186 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
TRIM29Q14134 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
TRIM29Q14134 AC245052.3-201ENST00000450182 901 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
TRIM29Q14134 GALNS-213ENST00000569433 723 ntTSL 3 BASIC24.02■■□□□ 1.44
TRIM29Q14134 AC008105.3-201ENST00000586376 844 ntTSL 3 BASIC24.02■■□□□ 1.44
TRIM29Q14134 NUTF2-201ENST00000219169 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
TRIM29Q14134 RAP2C-202ENST00000370874 2333 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
TRIM29Q14134 GSTM3-202ENST00000361066 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
TRIM29Q14134 ITGB1BP1-203ENST00000359712 2126 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
TRIM29Q14134 RABL2B-206ENST00000395598 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
TRIM29Q14134 CERS1-202ENST00000542296 1947 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
TRIM29Q14134 SLC25A27-202ENST00000411689 2526 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
TRIM29Q14134 SMTNL2-202ENST00000389313 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
TRIM29Q14134 CTCF-202ENST00000401394 2978 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
TRIM29Q14134 DUSP7-202ENST00000495880 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
TRIM29Q14134 ARID1B-220ENST00000636930 8246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
TRIM29Q14134 TRIB3-201ENST00000217233 2499 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
TRIM29Q14134 RARRES2-201ENST00000223271 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
TRIM29Q14134 KRTAP5-2-201ENST00000412090 1118 ntAPPRIS P1 BASIC24.01■■□□□ 1.43
TRIM29Q14134 HTATIP2-208ENST00000532505 595 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
TRIM29Q14134 HAUS4-205ENST00000541587 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
TRIM29Q14134 GPSM1-206ENST00000616132 2270 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
TRIM29Q14134 QKI-201ENST00000275262 6964 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
TRIM29Q14134 HTRA3-202ENST00000382512 2023 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
TRIM29Q14134 ITGBL1-206ENST00000618057 2368 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
TRIM29Q14134 DLGAP4-204ENST00000373913 5056 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
TRIM29Q14134 PACSIN3-201ENST00000298838 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
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