Protein–RNA interactions for Protein: Q13761

RUNX3, Runt-related transcription factor 3, humanhuman

Predictions only

Length 415 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RUNX3Q13761 UNC93B4-201ENST00000505679 747 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
RUNX3Q13761 PNMA6B-201ENST00000538162 1200 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
RUNX3Q13761 ASB18-201ENST00000409749 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
RUNX3Q13761 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
RUNX3Q13761 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
RUNX3Q13761 SH3GL1-206ENST00000598564 2194 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
RUNX3Q13761 ANKRD19P-205ENST00000473204 2370 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
RUNX3Q13761 DTD1-201ENST00000377452 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
RUNX3Q13761 GOLGA4-212ENST00000617480 1545 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
RUNX3Q13761 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
RUNX3Q13761 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
RUNX3Q13761 CDC14A-203ENST00000370124 1883 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
RUNX3Q13761 GPX1-202ENST00000419783 1146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
RUNX3Q13761 TNIK-208ENST00000465393 750 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
RUNX3Q13761 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
RUNX3Q13761 AC073896.1-201ENST00000549318 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
RUNX3Q13761 AC113189.1-201ENST00000570444 327 ntTSL 3 BASIC21.25■□□□□ 0.99
RUNX3Q13761 AC092368.3-202ENST00000574180 1591 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
RUNX3Q13761 BCAT2-207ENST00000597011 1579 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
RUNX3Q13761 ATRAID-208ENST00000611786 1256 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
RUNX3Q13761 CYP21A1P-202ENST00000354927 1481 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
RUNX3Q13761 NXN-202ENST00000537628 1340 ntTSL 3 BASIC21.25■□□□□ 0.99
RUNX3Q13761 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
RUNX3Q13761 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
RUNX3Q13761 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
RUNX3Q13761 CDC123-201ENST00000281141 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
RUNX3Q13761 SCARB2-219ENST00000639738 1517 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
RUNX3Q13761 ZNF584-203ENST00000593920 2187 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
RUNX3Q13761 AL645608.1-202ENST00000417705 1389 ntTSL 3 BASIC21.24■□□□□ 0.99
RUNX3Q13761 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
RUNX3Q13761 NELFE-202ENST00000375429 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
RUNX3Q13761 PTPMT1-202ENST00000326674 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
RUNX3Q13761 MFF-205ENST00000354503 1085 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
RUNX3Q13761 ZDHHC20-204ENST00000415724 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
RUNX3Q13761 ZPBP-203ENST00000419417 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
RUNX3Q13761 AC226101.2-201ENST00000458252 747 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
RUNX3Q13761 HES2-205ENST00000487437 968 ntTSL 3 BASIC21.24■□□□□ 0.99
RUNX3Q13761 AC073912.1-201ENST00000546264 587 ntTSL 3 BASIC21.24■□□□□ 0.99
RUNX3Q13761 AC044860.1-201ENST00000560756 1160 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
RUNX3Q13761 RHBDD2-201ENST00000006777 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
RUNX3Q13761 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
RUNX3Q13761 MXRA8-203ENST00000445648 2001 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
RUNX3Q13761 DHRS4-204ENST00000543741 1340 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
RUNX3Q13761 PQLC2-203ENST00000400548 1548 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
RUNX3Q13761 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
RUNX3Q13761 HAND1-201ENST00000231121 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
RUNX3Q13761 DDIT4-201ENST00000307365 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
RUNX3Q13761 PAGR1-201ENST00000320330 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
RUNX3Q13761 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
RUNX3Q13761 IKBIP-203ENST00000393042 1368 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
RUNX3Q13761 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
RUNX3Q13761 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
RUNX3Q13761 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
RUNX3Q13761 PPCS-203ENST00000372561 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
RUNX3Q13761 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
RUNX3Q13761 GCC2-AS1-202ENST00000440975 574 ntTSL 4 BASIC21.23■□□□□ 0.99
RUNX3Q13761 LINC01301-204ENST00000530725 577 ntTSL 4 BASIC21.23■□□□□ 0.99
RUNX3Q13761 EIF3J-AS1-205ENST00000560750 1093 ntTSL 3 BASIC21.23■□□□□ 0.99
RUNX3Q13761 TUSC2-201ENST00000232496 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
RUNX3Q13761 ZIM2-201ENST00000593711 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
RUNX3Q13761 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC21.23■□□□□ 0.99
RUNX3Q13761 GAL3ST3-201ENST00000312006 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
RUNX3Q13761 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
RUNX3Q13761 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
RUNX3Q13761 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
RUNX3Q13761 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
RUNX3Q13761 HSD11B1L-218ENST00000581773 1687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
RUNX3Q13761 CHRDL2-210ENST00000622063 1691 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
RUNX3Q13761 P2RX2-201ENST00000343948 1494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
RUNX3Q13761 MAST1-208ENST00000591495 1496 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
RUNX3Q13761 PEX7-202ENST00000367756 680 ntTSL 3 BASIC21.22■□□□□ 0.99
RUNX3Q13761 BOLA1-203ENST00000369153 1096 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.22■□□□□ 0.99
RUNX3Q13761 F8A2-201ENST00000369505 1116 ntAPPRIS P1 BASIC21.22■□□□□ 0.99
RUNX3Q13761 OGG1-209ENST00000383826 1069 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
RUNX3Q13761 AL596275.1-201ENST00000423464 877 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
RUNX3Q13761 AP000697.1-201ENST00000430607 339 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
RUNX3Q13761 NT5C3B-203ENST00000435506 975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
RUNX3Q13761 AC089999.2-201ENST00000552525 248 ntTSL 3 BASIC21.22■□□□□ 0.99
RUNX3Q13761 LINC00304-202ENST00000562248 1095 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
RUNX3Q13761 CLN6-206ENST00000565471 1075 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
RUNX3Q13761 AL359736.2-201ENST00000621992 437 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
RUNX3Q13761 FBXO6-201ENST00000376753 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
RUNX3Q13761 AC116050.2-201ENST00000612102 1779 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
RUNX3Q13761 HOXA4-202ENST00000428284 1595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
RUNX3Q13761 NIPAL4-202ENST00000435489 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
RUNX3Q13761 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
RUNX3Q13761 CALML5-201ENST00000380332 859 ntAPPRIS P1 BASIC21.21■□□□□ 0.99
RUNX3Q13761 ANKHD1-205ENST00000394723 2135 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
RUNX3Q13761 KRT17P3-201ENST00000420566 1262 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
RUNX3Q13761 AL807752.2-201ENST00000435463 301 ntTSL 3 BASIC21.21■□□□□ 0.99
RUNX3Q13761 SGO1-AS1-202ENST00000448208 819 ntTSL 3 BASIC21.21■□□□□ 0.99
RUNX3Q13761 UBE2SP1-201ENST00000450587 669 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
RUNX3Q13761 ARL16-209ENST00000573715 763 ntTSL 3 BASIC21.21■□□□□ 0.99
RUNX3Q13761 ARL16-211ENST00000576135 694 ntTSL 3 BASIC21.21■□□□□ 0.99
RUNX3Q13761 CD24-208ENST00000622315 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
RUNX3Q13761 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
RUNX3Q13761 PHB2-201ENST00000399433 1308 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
RUNX3Q13761 ATP8A1-207ENST00000510289 2238 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
RUNX3Q13761 SH3GLB2-202ENST00000372559 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
RUNX3Q13761 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
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